Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W9YBF1

Protein Details
Accession W9YBF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-261GTASTREKQQSQRRRKQYDEYLGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-226KVAERRRQEEEKTKAAKDKSGARPVAGKLGKSRSASPAKKSDQPRVPKAPRPP
321-339KREKEERRRKLMILASKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 9.833, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLGDIVNSIGTGAAPPPKPAGRLPGVNSQQRTAEDLKPGSRPGVTSTPSPLNGSKRRAEDEPPKATYKIIRPNPTPGLTSSVSKRTSAPLNAPKPAGDKHASVARPKLETSVSASRTASASPTTPATAVSKAPPKGSYADIMARAKQAQEMKAHSQIGLIKHQATNRERVSKVAERRRQEEEKTKAAKDKSGARPVAGKLGKSRSASPAKKSDQPRVPKAPRPPLHAPASYKGTIGTASTREKQQSQRRRKQYDEYLGTDEEDASDDVGYGQDEEDDYGSDASSVMEAGAFEVDEEEQRALRAAKEEDAKELALEAQLKREKEERRRKLMILASKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.15
3 0.15
4 0.17
5 0.22
6 0.24
7 0.27
8 0.29
9 0.35
10 0.34
11 0.39
12 0.42
13 0.47
14 0.53
15 0.57
16 0.57
17 0.51
18 0.48
19 0.43
20 0.44
21 0.39
22 0.35
23 0.35
24 0.36
25 0.37
26 0.37
27 0.37
28 0.34
29 0.3
30 0.27
31 0.26
32 0.3
33 0.29
34 0.28
35 0.32
36 0.35
37 0.35
38 0.37
39 0.36
40 0.38
41 0.44
42 0.47
43 0.48
44 0.48
45 0.51
46 0.51
47 0.54
48 0.55
49 0.57
50 0.58
51 0.56
52 0.55
53 0.51
54 0.5
55 0.48
56 0.46
57 0.47
58 0.48
59 0.51
60 0.51
61 0.58
62 0.62
63 0.58
64 0.51
65 0.42
66 0.39
67 0.33
68 0.34
69 0.3
70 0.32
71 0.31
72 0.3
73 0.3
74 0.28
75 0.32
76 0.32
77 0.37
78 0.39
79 0.43
80 0.45
81 0.44
82 0.41
83 0.39
84 0.37
85 0.34
86 0.27
87 0.23
88 0.23
89 0.29
90 0.3
91 0.29
92 0.32
93 0.3
94 0.29
95 0.28
96 0.27
97 0.21
98 0.2
99 0.24
100 0.27
101 0.26
102 0.27
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.19
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.2
120 0.21
121 0.22
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.2
127 0.16
128 0.17
129 0.2
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.19
139 0.22
140 0.24
141 0.28
142 0.28
143 0.24
144 0.23
145 0.23
146 0.22
147 0.21
148 0.18
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.25
153 0.24
154 0.29
155 0.29
156 0.34
157 0.32
158 0.32
159 0.37
160 0.36
161 0.43
162 0.46
163 0.5
164 0.47
165 0.51
166 0.57
167 0.55
168 0.54
169 0.55
170 0.5
171 0.52
172 0.53
173 0.51
174 0.49
175 0.46
176 0.43
177 0.37
178 0.41
179 0.4
180 0.44
181 0.43
182 0.38
183 0.41
184 0.39
185 0.44
186 0.36
187 0.29
188 0.25
189 0.29
190 0.34
191 0.31
192 0.33
193 0.32
194 0.41
195 0.43
196 0.44
197 0.48
198 0.47
199 0.53
200 0.56
201 0.57
202 0.56
203 0.6
204 0.63
205 0.65
206 0.67
207 0.67
208 0.71
209 0.72
210 0.68
211 0.69
212 0.67
213 0.63
214 0.62
215 0.6
216 0.54
217 0.48
218 0.49
219 0.41
220 0.35
221 0.29
222 0.24
223 0.19
224 0.17
225 0.15
226 0.13
227 0.17
228 0.2
229 0.23
230 0.25
231 0.3
232 0.39
233 0.47
234 0.54
235 0.61
236 0.69
237 0.76
238 0.81
239 0.81
240 0.81
241 0.81
242 0.81
243 0.75
244 0.69
245 0.63
246 0.55
247 0.5
248 0.41
249 0.31
250 0.2
251 0.16
252 0.11
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.17
292 0.18
293 0.23
294 0.29
295 0.3
296 0.31
297 0.33
298 0.31
299 0.26
300 0.25
301 0.2
302 0.16
303 0.19
304 0.16
305 0.23
306 0.28
307 0.28
308 0.32
309 0.38
310 0.45
311 0.52
312 0.63
313 0.64
314 0.69
315 0.75
316 0.73
317 0.74
318 0.73
319 0.72