Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9XUB4

Protein Details
Accession W9XUB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-105GEDGFPPPKKKSTKKSKPPLHSTGPARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-103PPKKKSTKKSKPPLHSTGP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSGDLQPWALPRLQRLLPIDDGSLKEIITYTSSLPKAAAADHLKNLLGDSPQALEFISSFNARRANISSDPAPSSVSRGEDGFPPPKKKSTKKSKPPLHSTGPARRPEGYGNVAGGYKKHYEDDSHSSTQRPTSRDHSAALLSETPEAWQAPFLTESQTAGLPSGDVSPAKPSQKLPPSASGQLISDFGFANVRAKQSKRPVHATHPQPQSGTSTPNKAGATTTTSSVADLTAAIAALELATNPTLSTKRRKCDCNASIHPLFTTAPNCLNCGKIICALEGLQPCSFCDTPLLTKDQVNDMIKALKEERGIEKMAAHNAAQAQSGRGTPVFGGSTPDSASGDELSSAASRARAHRDKLLAFQRDNAQRTRVYDEAADYDMSLTPGATQWMSPVQRAAALKKQQKYLRELEEASRPEWEKKRTVMSMSIKNGKLVKTYGHGKVPTAAEKDESAAPTDDEDEGDSQDQHLSLGGKDAFSNNPLLATGKLIRPVWKAPEGSEKGKSADTDGQVPRKSVWRRVQDDNVDNEHWILDGGLHGSGTESTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.39
4 0.39
5 0.39
6 0.37
7 0.34
8 0.33
9 0.3
10 0.26
11 0.21
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.19
25 0.25
26 0.24
27 0.27
28 0.29
29 0.31
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.23
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.21
49 0.21
50 0.24
51 0.26
52 0.3
53 0.3
54 0.34
55 0.33
56 0.33
57 0.34
58 0.32
59 0.3
60 0.24
61 0.25
62 0.22
63 0.22
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.21
68 0.27
69 0.32
70 0.36
71 0.41
72 0.43
73 0.5
74 0.59
75 0.64
76 0.69
77 0.72
78 0.77
79 0.81
80 0.89
81 0.91
82 0.91
83 0.91
84 0.88
85 0.84
86 0.82
87 0.79
88 0.79
89 0.76
90 0.71
91 0.64
92 0.58
93 0.53
94 0.48
95 0.45
96 0.38
97 0.31
98 0.27
99 0.25
100 0.25
101 0.23
102 0.2
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.18
107 0.18
108 0.2
109 0.26
110 0.33
111 0.36
112 0.38
113 0.38
114 0.38
115 0.39
116 0.42
117 0.41
118 0.35
119 0.33
120 0.34
121 0.4
122 0.4
123 0.4
124 0.36
125 0.32
126 0.3
127 0.28
128 0.23
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.11
156 0.16
157 0.18
158 0.2
159 0.21
160 0.29
161 0.36
162 0.42
163 0.4
164 0.42
165 0.45
166 0.46
167 0.45
168 0.37
169 0.3
170 0.25
171 0.22
172 0.16
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.17
182 0.19
183 0.26
184 0.35
185 0.43
186 0.45
187 0.52
188 0.53
189 0.57
190 0.64
191 0.63
192 0.63
193 0.61
194 0.57
195 0.48
196 0.45
197 0.42
198 0.35
199 0.33
200 0.26
201 0.25
202 0.25
203 0.29
204 0.28
205 0.23
206 0.22
207 0.18
208 0.21
209 0.17
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.05
232 0.07
233 0.11
234 0.21
235 0.26
236 0.34
237 0.4
238 0.45
239 0.48
240 0.57
241 0.59
242 0.59
243 0.58
244 0.57
245 0.53
246 0.49
247 0.44
248 0.34
249 0.29
250 0.21
251 0.17
252 0.11
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.16
273 0.15
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.15
279 0.18
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.22
285 0.21
286 0.2
287 0.18
288 0.19
289 0.18
290 0.19
291 0.17
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.09
337 0.12
338 0.21
339 0.25
340 0.28
341 0.33
342 0.37
343 0.37
344 0.43
345 0.48
346 0.45
347 0.4
348 0.41
349 0.44
350 0.46
351 0.47
352 0.42
353 0.37
354 0.33
355 0.35
356 0.37
357 0.3
358 0.25
359 0.23
360 0.22
361 0.21
362 0.2
363 0.17
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.14
377 0.15
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.18
382 0.2
383 0.23
384 0.25
385 0.33
386 0.4
387 0.43
388 0.51
389 0.52
390 0.55
391 0.58
392 0.56
393 0.54
394 0.52
395 0.49
396 0.44
397 0.48
398 0.45
399 0.39
400 0.37
401 0.32
402 0.35
403 0.4
404 0.42
405 0.39
406 0.41
407 0.47
408 0.45
409 0.46
410 0.47
411 0.48
412 0.51
413 0.53
414 0.57
415 0.51
416 0.51
417 0.51
418 0.44
419 0.39
420 0.32
421 0.28
422 0.26
423 0.32
424 0.33
425 0.37
426 0.37
427 0.34
428 0.39
429 0.39
430 0.39
431 0.35
432 0.31
433 0.27
434 0.26
435 0.28
436 0.25
437 0.23
438 0.2
439 0.18
440 0.17
441 0.16
442 0.17
443 0.15
444 0.12
445 0.13
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.1
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.18
462 0.17
463 0.18
464 0.2
465 0.14
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.13
470 0.16
471 0.18
472 0.18
473 0.23
474 0.25
475 0.29
476 0.32
477 0.36
478 0.39
479 0.41
480 0.4
481 0.38
482 0.47
483 0.48
484 0.49
485 0.49
486 0.45
487 0.41
488 0.42
489 0.4
490 0.34
491 0.35
492 0.33
493 0.36
494 0.4
495 0.46
496 0.46
497 0.46
498 0.44
499 0.46
500 0.5
501 0.51
502 0.54
503 0.57
504 0.61
505 0.68
506 0.75
507 0.75
508 0.76
509 0.73
510 0.69
511 0.6
512 0.54
513 0.46
514 0.36
515 0.27
516 0.2
517 0.13
518 0.08
519 0.07
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.08