FuNGI

C8VH37

Protein Details

Accession

C8VH37

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
548-567	VQNFHRRYPHKPRPSLDGAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19.5, cyto_mito 12, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD

Amino Acid Sequences

MSTKLLNRQQARWSEFLSCFNFRIVYRPGKQGAKPDTLTRRSEDLPKEGDEHLLHQSQTVLKHENVDPACLPEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEHAEPAKHAEPMGTRQSVSFRDEVELQLPPEIQDLICIAYETDPVVRSILKALATRQAQHPDITLADCERKREPPVLPESPARQGILRPLPVPEHAWQDISMDFITHLPTSQGFDSILVVVDRLTKMRHLIACQATINAEGVAHLYTQHVWRLHGLPRTITSDRGPQFVAEFWKHLNKHLDIQSLLSTAFHPETNGQTEWVNAMLEQYLQAYITYLQDNWSTWLPLAEFALNATYSEAIRTSLFFANYRFHPRMGFEPVPVPDCPASQDAENFAQKMQAISDYVRSQMTSAQARYEEQSNKTRQPARQYKAGQRVWLDARNIRTLRPSKKLDWKFLGPFTIKRMINAHAYELDLPASMRIHPVFNVSLLRPAADNPVPRQRADPPPPIEVEGLEHWEVESILDSRWERRGRGGPRLKYTVKWVGYDDPTEEPAEYLTHAKQLVQNFHRRYPHKPRPSLDGARP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.49
3	0.51
4	0.48
5	0.42
6	0.38
7	0.37
8	0.37
9	0.3
10	0.34
11	0.34
12	0.38
13	0.39
14	0.46
15	0.51
16	0.55
17	0.58
18	0.61
19	0.61
20	0.59
21	0.57
22	0.59
23	0.62
24	0.61
25	0.61
26	0.56
27	0.54
28	0.5
29	0.56
30	0.52
31	0.48
32	0.46
33	0.44
34	0.44
35	0.39
36	0.41
37	0.33
38	0.31
39	0.3
40	0.29
41	0.26
42	0.24
43	0.26
44	0.24
45	0.26
46	0.28
47	0.27
48	0.24
49	0.3
50	0.31
51	0.37
52	0.34
53	0.34
54	0.3
55	0.31
56	0.32
57	0.27
58	0.26
59	0.2
60	0.22
61	0.21
62	0.23
63	0.18
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.18
68	0.16
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.1
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.11
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.16
98	0.17
99	0.16
100	0.15
101	0.15
102	0.18
103	0.23
104	0.29
105	0.25
106	0.24
107	0.25
108	0.29
109	0.3
110	0.3
111	0.26
112	0.21
113	0.21
114	0.22
115	0.23
116	0.21
117	0.19
118	0.16
119	0.16
120	0.15
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.1
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.09
135	0.08
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.11
141	0.12
142	0.13
143	0.14
144	0.15
145	0.22
146	0.23
147	0.25
148	0.28
149	0.31
150	0.3
151	0.29
152	0.29
153	0.23
154	0.22
155	0.21
156	0.17
157	0.13
158	0.19
159	0.2
160	0.22
161	0.23
162	0.26
163	0.28
164	0.33
165	0.33
166	0.33
167	0.41
168	0.41
169	0.42
170	0.42
171	0.42
172	0.4
173	0.39
174	0.32
175	0.25
176	0.22
177	0.26
178	0.27
179	0.26
180	0.22
181	0.23
182	0.23
183	0.24
184	0.26
185	0.21
186	0.22
187	0.2
188	0.21
189	0.19
190	0.19
191	0.18
192	0.16
193	0.14
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.09
198	0.07
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.13
220	0.15
221	0.15
222	0.21
223	0.22
224	0.24
225	0.23
226	0.22
227	0.18
228	0.17
229	0.16
230	0.09
231	0.07
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.1
241	0.11
242	0.11
243	0.13
244	0.16
245	0.2
246	0.23
247	0.23
248	0.2
249	0.21
250	0.27
251	0.25
252	0.24
253	0.21
254	0.25
255	0.25
256	0.26
257	0.24
258	0.18
259	0.18
260	0.18
261	0.21
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.19
266	0.19
267	0.23
268	0.26
269	0.23
270	0.28
271	0.3
272	0.31
273	0.25
274	0.26
275	0.22
276	0.18
277	0.17
278	0.11
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.1
286	0.13
287	0.13
288	0.12
289	0.11
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.09
294	0.05
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.1
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.15
338	0.17
339	0.2
340	0.27
341	0.25
342	0.23
343	0.23
344	0.24
345	0.27
346	0.32
347	0.3
348	0.23
349	0.26
350	0.26
351	0.28
352	0.26
353	0.24
354	0.17
355	0.16
356	0.17
357	0.14
358	0.14
359	0.13
360	0.13
361	0.14
362	0.18
363	0.19
364	0.17
365	0.15
366	0.15
367	0.15
368	0.14
369	0.12
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.14
374	0.13
375	0.14
376	0.14
377	0.14
378	0.13
379	0.14
380	0.18
381	0.19
382	0.19
383	0.2
384	0.2
385	0.22
386	0.23
387	0.27
388	0.27
389	0.27
390	0.35
391	0.38
392	0.41
393	0.48
394	0.52
395	0.5
396	0.56
397	0.62
398	0.58
399	0.62
400	0.64
401	0.66
402	0.7
403	0.68
404	0.61
405	0.53
406	0.55
407	0.5
408	0.48
409	0.42
410	0.36
411	0.37
412	0.41
413	0.4
414	0.35
415	0.39
416	0.43
417	0.46
418	0.51
419	0.53
420	0.52
421	0.63
422	0.68
423	0.68
424	0.66
425	0.66
426	0.63
427	0.59
428	0.58
429	0.5
430	0.45
431	0.42
432	0.44
433	0.37
434	0.35
435	0.35
436	0.32
437	0.35
438	0.34
439	0.31
440	0.24
441	0.25
442	0.24
443	0.21
444	0.19
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.12
451	0.12
452	0.13
453	0.13
454	0.17
455	0.16
456	0.17
457	0.2
458	0.18
459	0.22
460	0.21
461	0.21
462	0.18
463	0.18
464	0.22
465	0.23
466	0.27
467	0.27
468	0.37
469	0.39
470	0.39
471	0.41
472	0.42
473	0.49
474	0.53
475	0.57
476	0.51
477	0.53
478	0.54
479	0.53
480	0.46
481	0.35
482	0.32
483	0.24
484	0.24
485	0.2
486	0.19
487	0.16
488	0.16
489	0.16
490	0.12
491	0.12
492	0.08
493	0.09
494	0.14
495	0.15
496	0.18
497	0.27
498	0.3
499	0.29
500	0.36
501	0.45
502	0.47
503	0.57
504	0.64
505	0.63
506	0.68
507	0.75
508	0.7
509	0.63
510	0.65
511	0.63
512	0.56
513	0.5
514	0.45
515	0.44
516	0.45
517	0.45
518	0.39
519	0.32
520	0.32
521	0.3
522	0.27
523	0.2
524	0.17
525	0.16
526	0.15
527	0.16
528	0.15
529	0.18
530	0.18
531	0.2
532	0.23
533	0.29
534	0.38
535	0.42
536	0.51
537	0.52
538	0.6
539	0.67
540	0.66
541	0.7
542	0.71
543	0.74
544	0.75
545	0.79
546	0.75
547	0.74
548	0.81

C8VH37

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer