Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3K1Y2

Protein Details
Accession J3K1Y2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-84QPWLTAERERRKQEPRNQQRRRRDKRIQVKIGHGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-74ERRKQEPRNQQRRRRDKR
Subcellular Location(s) mito 18, mito_nucl 12.666, cyto_mito 11.166, nucl 6, cyto_nucl 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG cim:CIMG_13592  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MLTSRWHTKLRPAMSNLEGVFAVHKPGGISSADVLRDLQRHFNPSKFFQPWLTAERERRKQEPRNQQRRRRDKRIQVKIGHGGTLDPIATGVLITGVGKGTKQLNNFLACTKTYEAVVLFGVATDSYDRVGKVVSRAPYEHITRETVEEALKGFRGKIMQRPSIFSALKVQGKKLYEYAREGKEPPVEIAERPVEVTNLEIVEWYEPGTHGWKWPTEEAGPTEKNVAEKMISKEKDIIEKEQKHVQEDKSLKRKPSPSADGIITEEAEPSSKRQKVNPSNTQTETAPEPTTADSLPVAASEPQESQSASDCVQPIPPPPAVKLTMTVSSGFYVRSLAHDLGLALNSNAIMSSLVRTRQGDFELSPDKILEYKDLEAGEEVWGPKVQRFLDEWQEKMKSKTEESGSGNESQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.6
3 0.5
4 0.43
5 0.35
6 0.27
7 0.25
8 0.18
9 0.18
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.12
14 0.14
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.23
24 0.24
25 0.3
26 0.29
27 0.36
28 0.4
29 0.44
30 0.46
31 0.47
32 0.54
33 0.48
34 0.47
35 0.43
36 0.45
37 0.44
38 0.43
39 0.46
40 0.44
41 0.5
42 0.58
43 0.64
44 0.64
45 0.67
46 0.73
47 0.75
48 0.79
49 0.81
50 0.82
51 0.84
52 0.89
53 0.92
54 0.93
55 0.94
56 0.94
57 0.93
58 0.92
59 0.92
60 0.92
61 0.93
62 0.92
63 0.86
64 0.83
65 0.81
66 0.71
67 0.61
68 0.5
69 0.39
70 0.3
71 0.25
72 0.18
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.08
87 0.13
88 0.17
89 0.18
90 0.24
91 0.28
92 0.3
93 0.31
94 0.31
95 0.28
96 0.25
97 0.27
98 0.23
99 0.19
100 0.16
101 0.17
102 0.15
103 0.13
104 0.13
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.11
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.21
124 0.24
125 0.28
126 0.29
127 0.29
128 0.26
129 0.25
130 0.23
131 0.24
132 0.22
133 0.18
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.13
143 0.15
144 0.21
145 0.28
146 0.33
147 0.34
148 0.37
149 0.39
150 0.42
151 0.4
152 0.33
153 0.32
154 0.31
155 0.35
156 0.32
157 0.3
158 0.28
159 0.29
160 0.3
161 0.28
162 0.28
163 0.25
164 0.3
165 0.35
166 0.33
167 0.34
168 0.34
169 0.33
170 0.3
171 0.28
172 0.23
173 0.2
174 0.18
175 0.16
176 0.18
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.17
203 0.15
204 0.16
205 0.17
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.09
215 0.13
216 0.17
217 0.24
218 0.24
219 0.24
220 0.28
221 0.29
222 0.34
223 0.32
224 0.35
225 0.36
226 0.39
227 0.41
228 0.43
229 0.43
230 0.39
231 0.43
232 0.37
233 0.36
234 0.39
235 0.45
236 0.49
237 0.53
238 0.52
239 0.54
240 0.58
241 0.55
242 0.58
243 0.55
244 0.48
245 0.48
246 0.46
247 0.4
248 0.36
249 0.31
250 0.22
251 0.16
252 0.13
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.1
257 0.18
258 0.21
259 0.23
260 0.28
261 0.39
262 0.48
263 0.58
264 0.65
265 0.64
266 0.66
267 0.67
268 0.64
269 0.53
270 0.45
271 0.38
272 0.31
273 0.25
274 0.18
275 0.17
276 0.16
277 0.17
278 0.14
279 0.12
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.15
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.23
304 0.21
305 0.22
306 0.26
307 0.26
308 0.25
309 0.26
310 0.24
311 0.24
312 0.24
313 0.23
314 0.2
315 0.18
316 0.18
317 0.15
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.12
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.14
328 0.15
329 0.13
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.08
339 0.12
340 0.14
341 0.17
342 0.19
343 0.21
344 0.24
345 0.26
346 0.27
347 0.23
348 0.28
349 0.3
350 0.29
351 0.28
352 0.24
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.18
358 0.19
359 0.21
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.19
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.23
372 0.22
373 0.22
374 0.26
375 0.3
376 0.39
377 0.43
378 0.43
379 0.45
380 0.51
381 0.5
382 0.5
383 0.51
384 0.45
385 0.44
386 0.5
387 0.48
388 0.49
389 0.51
390 0.54