Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9X9D7

Protein Details
Accession W9X9D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-408LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-227PAKRVK
387-400KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito_nucl 10.833, mito 9, cyto_mito 7.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPLKMKKKGSASGKPMPSPQLLGLVDAFLAQSGMESTHKAFTKEITRLHQSASWPAPDGAMHEVGLETVFAAFQKNAVAPTQKSGDESSSVDTDSESEASSKAESSSASSSATSSEESSDSEEEVKTKAHSKGQKGKTTKRSVSPSSSSSSSSSSSDSDADDEDEESSATPAKPITAPKSSSDINKAPGGAAAKNLKRKAESSSSESESSSSESDSPEDKRPAKRVKVVKKPAASDSSSSEASTDSSVEESSAAETTSSSSSSSSSEEEEEEKEAEDKKSFAKPSNKKTKLIAAADTPSESSGTVVGDNADDTPDLSHSEGLMHKDRSQMLNNTTPTSGQKKQVGARPTPLAQLSAQAKGDQYLSNAYQSYDYAEKAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKAFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.64
4 0.56
5 0.49
6 0.41
7 0.39
8 0.32
9 0.3
10 0.26
11 0.21
12 0.19
13 0.16
14 0.15
15 0.07
16 0.06
17 0.04
18 0.04
19 0.05
20 0.07
21 0.08
22 0.1
23 0.12
24 0.18
25 0.2
26 0.22
27 0.22
28 0.26
29 0.33
30 0.37
31 0.41
32 0.41
33 0.47
34 0.46
35 0.48
36 0.46
37 0.41
38 0.43
39 0.41
40 0.36
41 0.31
42 0.3
43 0.28
44 0.25
45 0.25
46 0.2
47 0.17
48 0.15
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.09
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.13
65 0.18
66 0.17
67 0.21
68 0.24
69 0.23
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.17
115 0.19
116 0.26
117 0.32
118 0.4
119 0.5
120 0.57
121 0.64
122 0.66
123 0.73
124 0.75
125 0.79
126 0.75
127 0.72
128 0.7
129 0.67
130 0.65
131 0.6
132 0.52
133 0.47
134 0.43
135 0.37
136 0.31
137 0.28
138 0.23
139 0.2
140 0.19
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.13
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.23
166 0.27
167 0.28
168 0.28
169 0.31
170 0.28
171 0.26
172 0.25
173 0.23
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.13
178 0.15
179 0.18
180 0.21
181 0.27
182 0.28
183 0.28
184 0.28
185 0.29
186 0.3
187 0.32
188 0.32
189 0.31
190 0.34
191 0.35
192 0.35
193 0.33
194 0.29
195 0.22
196 0.2
197 0.15
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.17
205 0.22
206 0.26
207 0.29
208 0.37
209 0.44
210 0.46
211 0.51
212 0.56
213 0.61
214 0.67
215 0.73
216 0.71
217 0.67
218 0.65
219 0.61
220 0.56
221 0.47
222 0.38
223 0.32
224 0.28
225 0.25
226 0.22
227 0.18
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.22
267 0.24
268 0.3
269 0.38
270 0.45
271 0.55
272 0.66
273 0.67
274 0.64
275 0.64
276 0.65
277 0.62
278 0.56
279 0.48
280 0.4
281 0.38
282 0.36
283 0.33
284 0.25
285 0.17
286 0.15
287 0.12
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.11
307 0.13
308 0.17
309 0.22
310 0.23
311 0.24
312 0.28
313 0.31
314 0.33
315 0.36
316 0.38
317 0.37
318 0.42
319 0.42
320 0.4
321 0.38
322 0.35
323 0.34
324 0.36
325 0.35
326 0.34
327 0.38
328 0.41
329 0.47
330 0.52
331 0.54
332 0.51
333 0.52
334 0.51
335 0.47
336 0.45
337 0.4
338 0.35
339 0.28
340 0.31
341 0.28
342 0.27
343 0.26
344 0.23
345 0.23
346 0.22
347 0.24
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.2
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.2
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.19
366 0.19
367 0.22
368 0.25
369 0.31
370 0.33
371 0.35
372 0.4
373 0.39
374 0.45
375 0.49
376 0.53
377 0.56
378 0.64
379 0.71
380 0.76
381 0.85
382 0.87
383 0.9
384 0.91
385 0.9
386 0.9
387 0.88
388 0.86
389 0.84
390 0.78
391 0.67
392 0.56
393 0.49
394 0.4
395 0.33
396 0.25
397 0.17
398 0.14