Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YPD0

Protein Details
Accession W9YPD0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-140SRETAPPQSRKPKKTGYEKYQDPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 8, mito 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTTLPRDKAGGANSKGFFEHANPFNEVAKARKLQAFQDNQEEVLDFEDTYDGLGDQLQEAGDDFNDDTFGGGAEGSNDRGGVGKDFDFFGSTAQVSTAIEEEAMRYNLQYPSRETAPPQSRKPKKTGYEKYQDPGYIPEIEAKSGAWSHKPSTHSPGQPSQPEDIHVSTSRHTAPAPEAPQPGTKMMSLEEVEAALLAQAQAHARAQAAQAPQPPYPQPQVFPFPVDHMHPPQPYQPGPPPMPFNQQHAPPPPRSASPRRHNRMPSQPSHPSQTSQLRPAQQPLQILQNPNRARHSPQPSVDRVQGLPPYGPAQAGAAPGITHPQQLLDLSEAQRRAYLEEDAKRAKRNHKIFLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVTATGTSADPNPEASLNEDFYYQVYSQIRGAPRQHPTQPLGHFAQTYLFQTGIRGGGRRQHANGDNHMQRMQQQVQRAVEAAKLKPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKRQDSSDARPASGRKEVSPSDRKTILKNIEAVYTTLMRLEDHERQSPPPPTEGDADSIQAHLDWRQKLQELNTALWQELKVLDPIVPGSSIPHPFIAFLSFAKGKKAMPRIFRLIDQEQRLTILTMIVVHLDQLDVTKDARPAAGDSQPTLAVREEIELFSQTVMPCLLQYVNEAPINIVIGLLGLLVERTSIAVVAMTKIGLGMMTMLLTRAELSKESGVVSDQEWQQWTALYNRLFDTLEPLLGLLFPGPVNSGDDIYIWQFLATIGIGASPDQQQRLVIGVKDRVMETVQQSKTLPPEMASVRLGNVNLFMRAIGLDVEMLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.38
4 0.35
5 0.42
6 0.42
7 0.43
8 0.41
9 0.37
10 0.32
11 0.26
12 0.31
13 0.29
14 0.32
15 0.33
16 0.35
17 0.36
18 0.37
19 0.35
20 0.31
21 0.32
22 0.32
23 0.34
24 0.38
25 0.38
26 0.42
27 0.5
28 0.54
29 0.5
30 0.56
31 0.52
32 0.48
33 0.46
34 0.39
35 0.3
36 0.23
37 0.2
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.07
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.09
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.16
100 0.2
101 0.24
102 0.25
103 0.26
104 0.3
105 0.34
106 0.35
107 0.34
108 0.4
109 0.47
110 0.52
111 0.56
112 0.62
113 0.68
114 0.73
115 0.78
116 0.77
117 0.77
118 0.8
119 0.81
120 0.8
121 0.8
122 0.8
123 0.76
124 0.71
125 0.62
126 0.52
127 0.45
128 0.38
129 0.3
130 0.25
131 0.27
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.18
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.18
140 0.2
141 0.23
142 0.29
143 0.32
144 0.34
145 0.39
146 0.46
147 0.47
148 0.5
149 0.53
150 0.55
151 0.55
152 0.55
153 0.51
154 0.43
155 0.4
156 0.37
157 0.31
158 0.28
159 0.27
160 0.25
161 0.22
162 0.26
163 0.24
164 0.22
165 0.21
166 0.19
167 0.2
168 0.26
169 0.28
170 0.29
171 0.3
172 0.31
173 0.34
174 0.34
175 0.31
176 0.25
177 0.22
178 0.18
179 0.17
180 0.19
181 0.16
182 0.15
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.15
202 0.17
203 0.22
204 0.25
205 0.26
206 0.28
207 0.29
208 0.29
209 0.34
210 0.32
211 0.29
212 0.3
213 0.35
214 0.33
215 0.33
216 0.3
217 0.25
218 0.26
219 0.26
220 0.26
221 0.25
222 0.3
223 0.29
224 0.3
225 0.32
226 0.35
227 0.33
228 0.34
229 0.36
230 0.37
231 0.39
232 0.4
233 0.41
234 0.38
235 0.46
236 0.42
237 0.42
238 0.39
239 0.4
240 0.43
241 0.46
242 0.48
243 0.42
244 0.44
245 0.4
246 0.41
247 0.45
248 0.48
249 0.5
250 0.55
251 0.64
252 0.67
253 0.73
254 0.74
255 0.75
256 0.77
257 0.75
258 0.7
259 0.67
260 0.68
261 0.62
262 0.62
263 0.55
264 0.46
265 0.44
266 0.48
267 0.43
268 0.41
269 0.43
270 0.41
271 0.42
272 0.44
273 0.42
274 0.36
275 0.34
276 0.3
277 0.33
278 0.31
279 0.33
280 0.34
281 0.39
282 0.39
283 0.4
284 0.42
285 0.37
286 0.39
287 0.44
288 0.47
289 0.45
290 0.48
291 0.51
292 0.51
293 0.53
294 0.5
295 0.43
296 0.35
297 0.32
298 0.28
299 0.23
300 0.19
301 0.16
302 0.16
303 0.14
304 0.13
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.12
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.17
333 0.21
334 0.25
335 0.29
336 0.31
337 0.35
338 0.39
339 0.44
340 0.48
341 0.51
342 0.53
343 0.54
344 0.58
345 0.55
346 0.59
347 0.59
348 0.5
349 0.44
350 0.38
351 0.32
352 0.25
353 0.23
354 0.17
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.17
361 0.18
362 0.16
363 0.17
364 0.2
365 0.22
366 0.22
367 0.26
368 0.24
369 0.24
370 0.23
371 0.21
372 0.15
373 0.13
374 0.1
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.09
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.16
399 0.17
400 0.19
401 0.22
402 0.23
403 0.27
404 0.31
405 0.33
406 0.33
407 0.34
408 0.36
409 0.34
410 0.34
411 0.31
412 0.28
413 0.24
414 0.21
415 0.19
416 0.15
417 0.14
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.14
428 0.18
429 0.2
430 0.2
431 0.24
432 0.3
433 0.32
434 0.35
435 0.37
436 0.36
437 0.35
438 0.35
439 0.29
440 0.25
441 0.28
442 0.3
443 0.25
444 0.26
445 0.3
446 0.29
447 0.3
448 0.28
449 0.23
450 0.2
451 0.21
452 0.19
453 0.22
454 0.27
455 0.28
456 0.34
457 0.4
458 0.45
459 0.45
460 0.48
461 0.43
462 0.44
463 0.46
464 0.43
465 0.37
466 0.29
467 0.26
468 0.22
469 0.18
470 0.12
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.2
475 0.22
476 0.24
477 0.26
478 0.29
479 0.31
480 0.31
481 0.39
482 0.37
483 0.45
484 0.52
485 0.52
486 0.55
487 0.52
488 0.52
489 0.47
490 0.46
491 0.43
492 0.36
493 0.33
494 0.31
495 0.31
496 0.3
497 0.32
498 0.28
499 0.21
500 0.25
501 0.27
502 0.33
503 0.41
504 0.4
505 0.4
506 0.44
507 0.44
508 0.42
509 0.48
510 0.44
511 0.38
512 0.38
513 0.34
514 0.31
515 0.31
516 0.28
517 0.21
518 0.17
519 0.14
520 0.12
521 0.11
522 0.09
523 0.1
524 0.15
525 0.2
526 0.23
527 0.27
528 0.28
529 0.3
530 0.36
531 0.39
532 0.36
533 0.32
534 0.3
535 0.27
536 0.29
537 0.28
538 0.25
539 0.2
540 0.2
541 0.17
542 0.16
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.11
547 0.16
548 0.16
549 0.17
550 0.2
551 0.21
552 0.24
553 0.25
554 0.28
555 0.25
556 0.25
557 0.27
558 0.26
559 0.24
560 0.23
561 0.2
562 0.14
563 0.13
564 0.12
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.09
574 0.13
575 0.14
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.15
580 0.16
581 0.15
582 0.12
583 0.1
584 0.14
585 0.16
586 0.17
587 0.19
588 0.2
589 0.2
590 0.27
591 0.36
592 0.38
593 0.4
594 0.46
595 0.51
596 0.52
597 0.52
598 0.52
599 0.48
600 0.49
601 0.46
602 0.41
603 0.35
604 0.34
605 0.31
606 0.25
607 0.19
608 0.12
609 0.09
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.11
623 0.12
624 0.12
625 0.13
626 0.13
627 0.14
628 0.17
629 0.21
630 0.19
631 0.19
632 0.2
633 0.21
634 0.21
635 0.2
636 0.16
637 0.13
638 0.12
639 0.13
640 0.13
641 0.12
642 0.13
643 0.12
644 0.12
645 0.12
646 0.14
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.09
652 0.1
653 0.1
654 0.08
655 0.11
656 0.12
657 0.16
658 0.16
659 0.17
660 0.15
661 0.15
662 0.16
663 0.13
664 0.1
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.03
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.05
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.07
698 0.08
699 0.09
700 0.12
701 0.14
702 0.14
703 0.15
704 0.15
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.17
709 0.17
710 0.2
711 0.21
712 0.21
713 0.2
714 0.2
715 0.21
716 0.19
717 0.24
718 0.23
719 0.24
720 0.24
721 0.26
722 0.25
723 0.23
724 0.26
725 0.2
726 0.19
727 0.16
728 0.15
729 0.13
730 0.12
731 0.12
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.07
737 0.08
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.12
743 0.13
744 0.13
745 0.14
746 0.11
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.08
752 0.07
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.13
759 0.16
760 0.17
761 0.18
762 0.18
763 0.18
764 0.22
765 0.23
766 0.21
767 0.24
768 0.27
769 0.28
770 0.3
771 0.3
772 0.27
773 0.26
774 0.27
775 0.27
776 0.32
777 0.31
778 0.32
779 0.33
780 0.34
781 0.37
782 0.37
783 0.32
784 0.24
785 0.3
786 0.29
787 0.32
788 0.31
789 0.27
790 0.26
791 0.28
792 0.27
793 0.2
794 0.22
795 0.2
796 0.18
797 0.18
798 0.16
799 0.13
800 0.13
801 0.13
802 0.09
803 0.08