Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YKM6

Protein Details
Accession W9YKM6    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-173DDEPGEARHRRKKRKHMLKEEQELEEBasic
199-224VERARERDRERRSRHKHGHRSRGDENBasic
228-253DQTQDGRGHRHRHRHRHERDERDDPHBasic
269-305DAYERRPRKHGDHSSHRDRDRRHKSRRDDSGERQPSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-163RHRRKKRKH
194-221EKRREVERARERDRERRSRHKHGHRSRG
233-265GRGHRHRHRHRHERDERDDPHEERKEKEKVARQ
271-296YERRPRKHGDHSSHRDRDRRHKSRRD
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNAIRQTQLLNKRELENATPPSASWHADYRDTAYIYIGGLHPDLTEGDVVTVFSQFGNPTHLNLIRDRETGKSKGFAFLKYEDQRSCDLAVDNFTGADVLGRLLRVDHTRYKKKDDEDEDTHRIDRWEQEAEAELNGNGKRESDGSDDDEPGEARHRRKKRKHMLKEEQELEEMLAIKQDGEDEDPMREYLIREKRREVERARERDRERRSRHKHGHRSRGDENDKEDQTQDGRGHRHRHRHRHERDERDDPHEERKEKEKVARQDPDDAYERRPRKHGDHSSHRDRDRRHKSRRDDSGERQPSRDRCPRREDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.42
4 0.42
5 0.4
6 0.37
7 0.33
8 0.35
9 0.34
10 0.31
11 0.25
12 0.27
13 0.27
14 0.3
15 0.32
16 0.3
17 0.33
18 0.32
19 0.3
20 0.24
21 0.21
22 0.18
23 0.19
24 0.15
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.21
48 0.24
49 0.25
50 0.27
51 0.32
52 0.29
53 0.3
54 0.3
55 0.3
56 0.32
57 0.34
58 0.33
59 0.32
60 0.3
61 0.35
62 0.36
63 0.33
64 0.32
65 0.3
66 0.37
67 0.37
68 0.41
69 0.35
70 0.36
71 0.36
72 0.33
73 0.31
74 0.24
75 0.21
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.08
92 0.1
93 0.14
94 0.22
95 0.31
96 0.4
97 0.44
98 0.51
99 0.54
100 0.56
101 0.61
102 0.59
103 0.58
104 0.56
105 0.6
106 0.56
107 0.52
108 0.48
109 0.4
110 0.34
111 0.27
112 0.23
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.14
120 0.12
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.16
140 0.15
141 0.19
142 0.28
143 0.37
144 0.47
145 0.57
146 0.68
147 0.73
148 0.81
149 0.87
150 0.89
151 0.91
152 0.9
153 0.88
154 0.8
155 0.7
156 0.59
157 0.48
158 0.37
159 0.27
160 0.18
161 0.1
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.16
178 0.25
179 0.31
180 0.32
181 0.37
182 0.44
183 0.48
184 0.55
185 0.51
186 0.52
187 0.56
188 0.63
189 0.65
190 0.67
191 0.67
192 0.69
193 0.74
194 0.73
195 0.72
196 0.74
197 0.77
198 0.79
199 0.85
200 0.86
201 0.88
202 0.88
203 0.9
204 0.86
205 0.85
206 0.8
207 0.79
208 0.75
209 0.67
210 0.62
211 0.59
212 0.53
213 0.46
214 0.41
215 0.32
216 0.27
217 0.28
218 0.26
219 0.23
220 0.29
221 0.35
222 0.44
223 0.49
224 0.59
225 0.64
226 0.72
227 0.78
228 0.82
229 0.85
230 0.88
231 0.91
232 0.9
233 0.87
234 0.86
235 0.79
236 0.75
237 0.71
238 0.63
239 0.62
240 0.6
241 0.55
242 0.49
243 0.53
244 0.53
245 0.52
246 0.58
247 0.58
248 0.59
249 0.66
250 0.71
251 0.65
252 0.68
253 0.64
254 0.6
255 0.57
256 0.49
257 0.45
258 0.47
259 0.5
260 0.45
261 0.5
262 0.51
263 0.52
264 0.61
265 0.66
266 0.66
267 0.72
268 0.78
269 0.83
270 0.86
271 0.85
272 0.81
273 0.79
274 0.8
275 0.8
276 0.81
277 0.81
278 0.82
279 0.86
280 0.89
281 0.92
282 0.9
283 0.88
284 0.86
285 0.86
286 0.87
287 0.79
288 0.73
289 0.71
290 0.68
291 0.69
292 0.7
293 0.68
294 0.66