FuNGI

W9YCH1

Protein Details

Accession

W9YCH1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-80	TSATAATTRSKRRKIRDEPNSLDTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
51-52	PK
65-69	SKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MAPRRQAHDELAIYAQPLSSDDEEYNTSTKPPASPPKEPQGKITKSSRLSPKRPLTSATAATTRSKRRKIRDEPNSLDTLIARQDPAVPDTFSEWNSSGSQKRRLQRSYANRKFYQKPESLENEAGPSIAQDEFVSYEEVTKRRGGPKLELDFIPVATLPGKVMPRKPAPLETRLDIVDMPRKESPKERGFQLPDLPDFNSSATTASTTTGLEAPSIFGDRPPSDRLHDRRRSGSTSSLSSVDSMFILEHQGELLDQAGDLAAAEPSDLRCPVCQQKVSDSASLYVPAKLRTLPFKRQQDFCAQHQVVEAKEQWQDRGYPDINWKEFEEIRIPRKLPILQEIINRKTASFYLEQLDKKIKAARGNRKAVKLYLNQGIVDVAKQGYYGPKGARVMVGAITAELTRSLNMALRSDSALRAAGVGGYVSAVLVPELTSLLVMEDMGLQNSEEARRVLDKSSRIGALLNPDDDHIEREDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.21
3	0.13
4	0.13
5	0.15
6	0.14
7	0.16
8	0.16
9	0.18
10	0.2
11	0.23
12	0.23
13	0.19
14	0.19
15	0.19
16	0.2
17	0.21
18	0.27
19	0.36
20	0.42
21	0.5
22	0.56
23	0.65
24	0.73
25	0.7
26	0.7
27	0.7
28	0.68
29	0.66
30	0.66
31	0.64
32	0.58
33	0.66
34	0.68
35	0.68
36	0.69
37	0.73
38	0.75
39	0.74
40	0.73
41	0.68
42	0.64
43	0.61
44	0.59
45	0.52
46	0.46
47	0.4
48	0.44
49	0.48
50	0.51
51	0.54
52	0.59
53	0.64
54	0.7
55	0.79
56	0.83
57	0.87
58	0.87
59	0.88
60	0.85
61	0.82
62	0.74
63	0.63
64	0.53
65	0.42
66	0.34
67	0.26
68	0.2
69	0.14
70	0.12
71	0.15
72	0.16
73	0.18
74	0.19
75	0.16
76	0.16
77	0.2
78	0.21
79	0.18
80	0.2
81	0.19
82	0.19
83	0.2
84	0.24
85	0.27
86	0.31
87	0.4
88	0.44
89	0.51
90	0.58
91	0.6
92	0.63
93	0.66
94	0.71
95	0.73
96	0.75
97	0.76
98	0.72
99	0.75
100	0.76
101	0.73
102	0.7
103	0.64
104	0.59
105	0.58
106	0.59
107	0.57
108	0.51
109	0.44
110	0.37
111	0.31
112	0.27
113	0.19
114	0.13
115	0.1
116	0.08
117	0.08
118	0.06
119	0.06
120	0.08
121	0.09
122	0.1
123	0.08
124	0.12
125	0.15
126	0.16
127	0.18
128	0.2
129	0.23
130	0.28
131	0.33
132	0.33
133	0.36
134	0.44
135	0.46
136	0.47
137	0.42
138	0.4
139	0.35
140	0.31
141	0.25
142	0.16
143	0.12
144	0.09
145	0.09
146	0.06
147	0.09
148	0.13
149	0.15
150	0.18
151	0.25
152	0.29
153	0.33
154	0.35
155	0.4
156	0.41
157	0.44
158	0.44
159	0.38
160	0.36
161	0.32
162	0.31
163	0.22
164	0.2
165	0.21
166	0.18
167	0.2
168	0.21
169	0.23
170	0.24
171	0.3
172	0.36
173	0.36
174	0.39
175	0.39
176	0.43
177	0.45
178	0.46
179	0.45
180	0.39
181	0.33
182	0.32
183	0.3
184	0.23
185	0.2
186	0.17
187	0.13
188	0.1
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.08
204	0.07
205	0.06
206	0.09
207	0.1
208	0.13
209	0.15
210	0.16
211	0.18
212	0.26
213	0.33
214	0.4
215	0.47
216	0.47
217	0.5
218	0.52
219	0.53
220	0.47
221	0.46
222	0.38
223	0.32
224	0.3
225	0.26
226	0.23
227	0.19
228	0.17
229	0.12
230	0.09
231	0.07
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.04
241	0.04
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.02
250	0.02
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.11
259	0.18
260	0.22
261	0.25
262	0.25
263	0.29
264	0.36
265	0.38
266	0.36
267	0.3
268	0.26
269	0.23
270	0.24
271	0.2
272	0.16
273	0.15
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.16
278	0.23
279	0.28
280	0.34
281	0.42
282	0.51
283	0.55
284	0.56
285	0.57
286	0.58
287	0.57
288	0.52
289	0.54
290	0.44
291	0.4
292	0.39
293	0.38
294	0.27
295	0.26
296	0.23
297	0.15
298	0.19
299	0.19
300	0.18
301	0.18
302	0.19
303	0.18
304	0.24
305	0.22
306	0.21
307	0.28
308	0.34
309	0.34
310	0.34
311	0.33
312	0.31
313	0.3
314	0.29
315	0.29
316	0.27
317	0.31
318	0.35
319	0.35
320	0.33
321	0.37
322	0.38
323	0.33
324	0.34
325	0.34
326	0.32
327	0.38
328	0.43
329	0.41
330	0.43
331	0.41
332	0.35
333	0.31
334	0.29
335	0.26
336	0.2
337	0.19
338	0.19
339	0.25
340	0.25
341	0.27
342	0.32
343	0.29
344	0.3
345	0.34
346	0.33
347	0.36
348	0.45
349	0.53
350	0.57
351	0.66
352	0.7
353	0.7
354	0.69
355	0.65
356	0.62
357	0.56
358	0.52
359	0.48
360	0.44
361	0.38
362	0.34
363	0.32
364	0.24
365	0.2
366	0.16
367	0.09
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.12
372	0.13
373	0.17
374	0.17
375	0.22
376	0.23
377	0.24
378	0.24
379	0.2
380	0.2
381	0.17
382	0.16
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.11
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.16
398	0.18
399	0.19
400	0.19
401	0.16
402	0.16
403	0.14
404	0.13
405	0.12
406	0.09
407	0.08
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.09
431	0.08
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.15
438	0.18
439	0.2
440	0.25
441	0.29
442	0.32
443	0.35
444	0.39
445	0.37
446	0.34
447	0.34
448	0.31
449	0.34
450	0.34
451	0.31
452	0.26
453	0.26
454	0.29
455	0.28
456	0.28
457	0.21

W9YCH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer