FuNGI

W9XID0

Protein Details

Accession

W9XID0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
427-450	NPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKFGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
428-443	PGGGKRRGAKGKRGKN

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 10, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRRWIDKSSAQTFHLLYRPQDDPALHDENAGERALYQVSGPGSSAQKSNPKEGLHLNDLENDLDFESMRENEGEAAQYGIYFDDTNYDYMQHLRDIGEGGGESHFIEAAPVKVQGKGKSKAKTMKLEDALREVSLDDERSVAGTDMLSTFSTQTRDRTYQSQQNVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDNDEEDVFGALAQDGRHGELDLEDFEANYFDDEDDGWESDATEKAPTQPSEVKLPTAVHPTEGGYPNSDNAARDAEAAAAEDGDWLRDFAKFKRDTARKPQPKAAESIIAASAIQDKAPTLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSSYSMTSSSLARTSGQQLLDARFDQVEKMYSLDEADEFDDMDGEMSLASGMTGRSKMSQLSTTSFADEGAVRDDFDSMMDGFLGDWNKANPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKFGLQQLDEVRAELGPPRLYGRTTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.49
3	0.46
4	0.4
5	0.34
6	0.35
7	0.35
8	0.33
9	0.36
10	0.31
11	0.29
12	0.32
13	0.36
14	0.3
15	0.29
16	0.28
17	0.26
18	0.27
19	0.23
20	0.16
21	0.1
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.09
26	0.11
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.15
31	0.17
32	0.18
33	0.2
34	0.22
35	0.3
36	0.33
37	0.39
38	0.41
39	0.4
40	0.43
41	0.47
42	0.49
43	0.45
44	0.45
45	0.39
46	0.37
47	0.37
48	0.33
49	0.27
50	0.2
51	0.15
52	0.13
53	0.11
54	0.08
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.12
62	0.13
63	0.1
64	0.1
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.08
70	0.07
71	0.06
72	0.09
73	0.11
74	0.12
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.15
79	0.16
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.09
88	0.1
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.06
93	0.07
94	0.05
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.08
99	0.1
100	0.11
101	0.15
102	0.19
103	0.26
104	0.33
105	0.4
106	0.46
107	0.49
108	0.56
109	0.61
110	0.64
111	0.66
112	0.64
113	0.65
114	0.64
115	0.63
116	0.57
117	0.52
118	0.46
119	0.36
120	0.31
121	0.22
122	0.17
123	0.14
124	0.14
125	0.1
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.09
140	0.13
141	0.13
142	0.16
143	0.21
144	0.24
145	0.26
146	0.31
147	0.36
148	0.4
149	0.43
150	0.46
151	0.43
152	0.44
153	0.42
154	0.36
155	0.31
156	0.24
157	0.2
158	0.14
159	0.12
160	0.09
161	0.07
162	0.09
163	0.08
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.12
229	0.12
230	0.15
231	0.18
232	0.2
233	0.25
234	0.25
235	0.23
236	0.21
237	0.22
238	0.21
239	0.22
240	0.21
241	0.15
242	0.15
243	0.16
244	0.18
245	0.2
246	0.18
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.16
251	0.15
252	0.11
253	0.1
254	0.11
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.07
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.07
271	0.09
272	0.11
273	0.2
274	0.21
275	0.23
276	0.33
277	0.4
278	0.44
279	0.53
280	0.63
281	0.63
282	0.66
283	0.71
284	0.68
285	0.63
286	0.6
287	0.52
288	0.44
289	0.35
290	0.32
291	0.25
292	0.18
293	0.16
294	0.12
295	0.13
296	0.09
297	0.09
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.16
308	0.17
309	0.17
310	0.25
311	0.32
312	0.41
313	0.46
314	0.5
315	0.56
316	0.63
317	0.72
318	0.72
319	0.73
320	0.74
321	0.75
322	0.76
323	0.68
324	0.61
325	0.53
326	0.45
327	0.37
328	0.28
329	0.23
330	0.18
331	0.16
332	0.15
333	0.15
334	0.16
335	0.14
336	0.15
337	0.17
338	0.2
339	0.19
340	0.21
341	0.22
342	0.24
343	0.26
344	0.24
345	0.21
346	0.17
347	0.17
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.11
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.07
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.1
379	0.12
380	0.14
381	0.17
382	0.21
383	0.22
384	0.25
385	0.28
386	0.27
387	0.28
388	0.26
389	0.22
390	0.19
391	0.17
392	0.15
393	0.14
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.1
407	0.11
408	0.1
409	0.11
410	0.12
411	0.14
412	0.14
413	0.16
414	0.17
415	0.25
416	0.35
417	0.4
418	0.48
419	0.52
420	0.61
421	0.7
422	0.71
423	0.73
424	0.74
425	0.77
426	0.78
427	0.82
428	0.83
429	0.83
430	0.86
431	0.84
432	0.79
433	0.71
434	0.65
435	0.61
436	0.55
437	0.44
438	0.4
439	0.34
440	0.34
441	0.32
442	0.29
443	0.24
444	0.21
445	0.21
446	0.2
447	0.23
448	0.18
449	0.2
450	0.23
451	0.25
452	0.27

W9XID0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer