FuNGI

W9YCY8

Protein Details

Accession

W9YCY8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-52	ESLTTPKKRKHGAEEKESSKKKKKLRTEPPPTDTES	Basic
60-94	AQALAAESKKKKKKGKDKDKEKVSRHKNGKHDLEK	Basic
303-328	GPSREDTSKTKKKSKKGRLRDEDDSP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-42	PKKRKHGAEEKESSKKKKKLR
67-89	SKKKKKKGKDKDKEKVSRHKNGK
311-320	KTKKKSKKGR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSIQTDGTHVSASKKVESLTTPKKRKHGAEEKESSKKKKKLRTEPPPTDTESAAAVAAPAQALAAESKKKKKKGKDKDKEKVSRHKNGKHDLEKVPDQRSAKSSEPEDIEVADAPSPETEPTAAVQPATSSPAVNGEDGAVMESEMVADLLDSADPTSFHSTRLSLHLAIPAIGLEAGSPSLLATHLAPLLLTYSPPAQGIVLGFSDPVLSTNPDTGINLPLVPPSNGDVMPRAEVLAKTADEFGVCWVWLTATFLVFRPERGDELYGWTNVTSEGFVGLVSYNYFQTAVAKNRIPQDWIWNGPSREDTSKTKKKSKKGRLRDEDDSPSQTPEDEIAAQNGDWDAGPAASSQVQIDEVGFFVDAHGSKVLPTQKFRVVDTEVVPSHDRHKWSLQIEGTLLDEAAERRVADDERAKFELAQQRSRSQTPGDRGGDTGLLMSGALARSREGSVASRLSGPTPSQRHRVAY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.26
4	0.3
5	0.36
6	0.43
7	0.51
8	0.57
9	0.62
10	0.7
11	0.75
12	0.78
13	0.79
14	0.79
15	0.78
16	0.79
17	0.82
18	0.82
19	0.84
20	0.84
21	0.83
22	0.82
23	0.81
24	0.79
25	0.8
26	0.83
27	0.84
28	0.87
29	0.89
30	0.89
31	0.92
32	0.88
33	0.82
34	0.77
35	0.68
36	0.57
37	0.47
38	0.37
39	0.27
40	0.21
41	0.16
42	0.1
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.05
47	0.04
48	0.04
49	0.05
50	0.07
51	0.1
52	0.18
53	0.24
54	0.35
55	0.44
56	0.53
57	0.62
58	0.71
59	0.78
60	0.82
61	0.87
62	0.89
63	0.92
64	0.93
65	0.95
66	0.94
67	0.92
68	0.91
69	0.89
70	0.88
71	0.87
72	0.84
73	0.82
74	0.82
75	0.83
76	0.8
77	0.78
78	0.73
79	0.7
80	0.71
81	0.68
82	0.62
83	0.57
84	0.51
85	0.47
86	0.45
87	0.43
88	0.39
89	0.38
90	0.36
91	0.35
92	0.36
93	0.34
94	0.32
95	0.26
96	0.23
97	0.18
98	0.17
99	0.13
100	0.1
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.13
116	0.13
117	0.09
118	0.09
119	0.14
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.06
128	0.05
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.03
133	0.03
134	0.02
135	0.02
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.07
144	0.13
145	0.14
146	0.15
147	0.16
148	0.16
149	0.18
150	0.22
151	0.22
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.17
156	0.17
157	0.15
158	0.11
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.09
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.11
244	0.11
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.15
251	0.12
252	0.17
253	0.18
254	0.16
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.11
260	0.06
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.05
274	0.09
275	0.13
276	0.17
277	0.21
278	0.22
279	0.25
280	0.3
281	0.31
282	0.29
283	0.26
284	0.29
285	0.29
286	0.3
287	0.31
288	0.32
289	0.31
290	0.3
291	0.32
292	0.28
293	0.26
294	0.28
295	0.32
296	0.37
297	0.45
298	0.51
299	0.59
300	0.63
301	0.7
302	0.77
303	0.81
304	0.81
305	0.84
306	0.88
307	0.88
308	0.88
309	0.85
310	0.8
311	0.75
312	0.68
313	0.61
314	0.51
315	0.42
316	0.34
317	0.28
318	0.22
319	0.16
320	0.15
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.15
356	0.22
357	0.23
358	0.26
359	0.3
360	0.36
361	0.38
362	0.39
363	0.39
364	0.36
365	0.35
366	0.34
367	0.35
368	0.29
369	0.31
370	0.31
371	0.27
372	0.29
373	0.3
374	0.31
375	0.29
376	0.33
377	0.37
378	0.37
379	0.44
380	0.4
381	0.37
382	0.35
383	0.32
384	0.28
385	0.21
386	0.19
387	0.11
388	0.11
389	0.09
390	0.1
391	0.11
392	0.09
393	0.1
394	0.13
395	0.14
396	0.18
397	0.26
398	0.28
399	0.33
400	0.35
401	0.35
402	0.32
403	0.38
404	0.42
405	0.4
406	0.45
407	0.43
408	0.48
409	0.53
410	0.55
411	0.51
412	0.48
413	0.51
414	0.49
415	0.54
416	0.51
417	0.47
418	0.45
419	0.44
420	0.38
421	0.29
422	0.23
423	0.13
424	0.1
425	0.08
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.17
437	0.21
438	0.23
439	0.24
440	0.25
441	0.25
442	0.26
443	0.27
444	0.27
445	0.31
446	0.38
447	0.42
448	0.47

W9YCY8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer