Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9Z6J1

Protein Details
Accession W9Z6J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85TARSNRRQPRLSIRNNTENGHydrophilic
377-399KDPLCNTRPPSPKRRKRTFAELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-392KRRK
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAAVMAKPAGTATKMKKPPTPVVQTNVNGVKPTAPSSSPSSARKSLPGQNPTPTSASSNSATVNGTARSNRRQPRLSIRNNTENGSIEKRVPKKIPEPYVPKESYILRKFKGCPPSLIVHLHPTHFRFDQQDGSFSYHSEMRVFIEHLAKGTIPHDMVEEFRKSDVKYYDGWLIVRVVDHKSVAKDVHTSEAAADDEKPFSIHNYNQYITPSPYAPYPSQEQSLARSPPLKQERQDSVASDTRDLLHSDDTIDVAPKSTKPRPRIYHVALRPTILSRHMDLVLDAMAPDPKSVNRKQSQANSANRPPGSAAPQTPISGVPPTPSSEKGPPLKKQKLRIDPKDLLEYEGRIVNATAPPLYLDPVDTLEEAETLIDILKDPLCNTRPPSPKRRKRTFAELAAEDAHAKQQERFMLIMDERTAGSTGATNSGAVDGQAAATLFQPRFEKFNALDNIKREIAERKQREKDRQLQEDETRRSQQDRMQEEEKKRIMIQRAQEMRGMRPRPQDVQTVFQQQQHTQAVQRPPSQQVNGIPPNMQSQMLAAQQRGSPVIRQGTPLAASSPVVTGAGQVGHPMAMSGSQQGHGSPPRPGSGSAVQHGHPSAPMARVPSGQGPSRHSTPQMAHGTPRNATPVMRQGTPAQQITQASPHGSTVAPTPQMMPAGMMQGMQGQAPNGVPRQLNPQQLAEMQRRQALQQQAMQQQMANGTPQMSHAQIAHIQAQQQAQAERQAAIQRQQAQQHHQQQQQAMQQGTPQSQHMSPDPAQSQIAYKQSVAEHVKAQIQSLQQQNQGHSSPAPNHMTPQQQVSQLAHVQQQQRMMAAQAQQAQMMGGSVPHPQQRPQANPALQQLYQSTLAAYQQRFLGQAAAKYGGNTSMLQPAEVQQVQQQAKTAAMQAVRRRQVEMNNMSIQQAQMRQQVAQQQAQQQGGGMPNGMMGMSPNMAAALQQQQAQHMQQMQLQQAQQVMQAQQQQQGMQYQQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.52
4 0.58
5 0.65
6 0.67
7 0.7
8 0.67
9 0.65
10 0.69
11 0.65
12 0.66
13 0.61
14 0.52
15 0.44
16 0.38
17 0.35
18 0.29
19 0.31
20 0.26
21 0.22
22 0.25
23 0.3
24 0.37
25 0.4
26 0.43
27 0.47
28 0.48
29 0.49
30 0.52
31 0.52
32 0.54
33 0.57
34 0.6
35 0.58
36 0.6
37 0.62
38 0.59
39 0.55
40 0.47
41 0.42
42 0.36
43 0.36
44 0.29
45 0.28
46 0.25
47 0.24
48 0.23
49 0.2
50 0.21
51 0.18
52 0.2
53 0.25
54 0.3
55 0.37
56 0.45
57 0.53
58 0.58
59 0.62
60 0.66
61 0.72
62 0.76
63 0.78
64 0.79
65 0.79
66 0.8
67 0.77
68 0.72
69 0.64
70 0.56
71 0.51
72 0.46
73 0.4
74 0.36
75 0.42
76 0.45
77 0.5
78 0.51
79 0.54
80 0.57
81 0.65
82 0.68
83 0.69
84 0.72
85 0.71
86 0.75
87 0.69
88 0.62
89 0.56
90 0.53
91 0.53
92 0.53
93 0.54
94 0.46
95 0.51
96 0.54
97 0.58
98 0.62
99 0.55
100 0.51
101 0.49
102 0.51
103 0.5
104 0.5
105 0.44
106 0.42
107 0.42
108 0.4
109 0.39
110 0.36
111 0.37
112 0.34
113 0.35
114 0.31
115 0.31
116 0.37
117 0.34
118 0.36
119 0.33
120 0.37
121 0.34
122 0.3
123 0.3
124 0.24
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.15
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.19
146 0.21
147 0.18
148 0.2
149 0.23
150 0.22
151 0.28
152 0.28
153 0.26
154 0.25
155 0.27
156 0.31
157 0.29
158 0.29
159 0.24
160 0.22
161 0.2
162 0.19
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.19
169 0.22
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.25
175 0.22
176 0.21
177 0.18
178 0.19
179 0.18
180 0.15
181 0.15
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.1
187 0.12
188 0.16
189 0.19
190 0.25
191 0.29
192 0.3
193 0.31
194 0.34
195 0.34
196 0.31
197 0.3
198 0.23
199 0.19
200 0.21
201 0.23
202 0.22
203 0.22
204 0.25
205 0.25
206 0.27
207 0.28
208 0.27
209 0.27
210 0.33
211 0.31
212 0.28
213 0.29
214 0.28
215 0.36
216 0.43
217 0.44
218 0.4
219 0.47
220 0.51
221 0.51
222 0.52
223 0.44
224 0.42
225 0.41
226 0.4
227 0.32
228 0.27
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.17
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.13
244 0.2
245 0.27
246 0.34
247 0.39
248 0.49
249 0.54
250 0.61
251 0.67
252 0.67
253 0.69
254 0.67
255 0.69
256 0.6
257 0.55
258 0.48
259 0.4
260 0.35
261 0.28
262 0.25
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.13
270 0.1
271 0.09
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.17
279 0.21
280 0.31
281 0.33
282 0.39
283 0.45
284 0.52
285 0.59
286 0.61
287 0.64
288 0.63
289 0.63
290 0.65
291 0.58
292 0.5
293 0.43
294 0.36
295 0.34
296 0.29
297 0.25
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.2
303 0.17
304 0.15
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.14
309 0.16
310 0.17
311 0.2
312 0.22
313 0.29
314 0.35
315 0.4
316 0.46
317 0.54
318 0.61
319 0.63
320 0.69
321 0.72
322 0.75
323 0.79
324 0.79
325 0.78
326 0.73
327 0.71
328 0.67
329 0.58
330 0.5
331 0.4
332 0.33
333 0.25
334 0.22
335 0.19
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.09
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.12
367 0.14
368 0.17
369 0.2
370 0.29
371 0.37
372 0.43
373 0.54
374 0.6
375 0.68
376 0.76
377 0.82
378 0.81
379 0.78
380 0.82
381 0.79
382 0.76
383 0.72
384 0.61
385 0.53
386 0.46
387 0.4
388 0.3
389 0.21
390 0.15
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.15
400 0.14
401 0.14
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.05
419 0.04
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.08
426 0.07
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.14
431 0.15
432 0.18
433 0.16
434 0.24
435 0.26
436 0.28
437 0.3
438 0.29
439 0.32
440 0.29
441 0.28
442 0.21
443 0.23
444 0.27
445 0.35
446 0.4
447 0.44
448 0.53
449 0.59
450 0.66
451 0.68
452 0.71
453 0.69
454 0.69
455 0.65
456 0.61
457 0.61
458 0.61
459 0.57
460 0.5
461 0.44
462 0.38
463 0.36
464 0.34
465 0.31
466 0.31
467 0.31
468 0.33
469 0.36
470 0.41
471 0.42
472 0.47
473 0.45
474 0.37
475 0.35
476 0.33
477 0.33
478 0.31
479 0.31
480 0.33
481 0.36
482 0.36
483 0.38
484 0.34
485 0.33
486 0.37
487 0.35
488 0.31
489 0.32
490 0.33
491 0.35
492 0.36
493 0.39
494 0.33
495 0.35
496 0.34
497 0.35
498 0.34
499 0.34
500 0.33
501 0.27
502 0.31
503 0.28
504 0.26
505 0.22
506 0.26
507 0.27
508 0.29
509 0.33
510 0.29
511 0.32
512 0.35
513 0.33
514 0.3
515 0.28
516 0.32
517 0.31
518 0.29
519 0.25
520 0.23
521 0.24
522 0.23
523 0.2
524 0.12
525 0.1
526 0.11
527 0.14
528 0.14
529 0.12
530 0.12
531 0.13
532 0.13
533 0.14
534 0.12
535 0.1
536 0.12
537 0.16
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.15
542 0.16
543 0.15
544 0.13
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.11
570 0.13
571 0.14
572 0.15
573 0.16
574 0.17
575 0.18
576 0.18
577 0.2
578 0.23
579 0.24
580 0.24
581 0.24
582 0.23
583 0.24
584 0.23
585 0.19
586 0.13
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.13
594 0.15
595 0.17
596 0.18
597 0.21
598 0.22
599 0.25
600 0.28
601 0.31
602 0.31
603 0.28
604 0.29
605 0.26
606 0.33
607 0.34
608 0.3
609 0.3
610 0.33
611 0.35
612 0.32
613 0.31
614 0.26
615 0.21
616 0.2
617 0.2
618 0.24
619 0.24
620 0.24
621 0.24
622 0.24
623 0.29
624 0.33
625 0.3
626 0.23
627 0.23
628 0.23
629 0.23
630 0.23
631 0.19
632 0.15
633 0.15
634 0.14
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.11
639 0.13
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.14
645 0.13
646 0.12
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.07
658 0.07
659 0.09
660 0.08
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.21
665 0.26
666 0.31
667 0.31
668 0.31
669 0.3
670 0.33
671 0.38
672 0.35
673 0.33
674 0.3
675 0.31
676 0.31
677 0.3
678 0.34
679 0.34
680 0.31
681 0.32
682 0.37
683 0.39
684 0.4
685 0.39
686 0.32
687 0.27
688 0.25
689 0.21
690 0.15
691 0.1
692 0.09
693 0.09
694 0.11
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.12
700 0.14
701 0.16
702 0.19
703 0.18
704 0.18
705 0.2
706 0.21
707 0.21
708 0.21
709 0.2
710 0.17
711 0.2
712 0.2
713 0.17
714 0.19
715 0.21
716 0.21
717 0.25
718 0.29
719 0.31
720 0.35
721 0.41
722 0.43
723 0.45
724 0.52
725 0.58
726 0.61
727 0.59
728 0.59
729 0.55
730 0.56
731 0.55
732 0.51
733 0.42
734 0.34
735 0.32
736 0.31
737 0.3
738 0.25
739 0.21
740 0.19
741 0.19
742 0.22
743 0.22
744 0.25
745 0.24
746 0.29
747 0.28
748 0.27
749 0.26
750 0.24
751 0.25
752 0.23
753 0.26
754 0.21
755 0.2
756 0.21
757 0.21
758 0.29
759 0.29
760 0.26
761 0.25
762 0.26
763 0.31
764 0.28
765 0.28
766 0.25
767 0.24
768 0.28
769 0.33
770 0.34
771 0.35
772 0.37
773 0.38
774 0.38
775 0.37
776 0.32
777 0.27
778 0.27
779 0.26
780 0.3
781 0.33
782 0.29
783 0.31
784 0.35
785 0.38
786 0.36
787 0.37
788 0.34
789 0.32
790 0.34
791 0.33
792 0.32
793 0.29
794 0.3
795 0.29
796 0.31
797 0.32
798 0.32
799 0.35
800 0.31
801 0.29
802 0.28
803 0.24
804 0.22
805 0.22
806 0.23
807 0.24
808 0.24
809 0.23
810 0.23
811 0.21
812 0.17
813 0.14
814 0.1
815 0.05
816 0.06
817 0.09
818 0.12
819 0.18
820 0.2
821 0.23
822 0.31
823 0.38
824 0.43
825 0.47
826 0.53
827 0.51
828 0.54
829 0.57
830 0.55
831 0.47
832 0.42
833 0.37
834 0.32
835 0.29
836 0.24
837 0.18
838 0.14
839 0.18
840 0.22
841 0.21
842 0.19
843 0.2
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.23
848 0.19
849 0.21
850 0.22
851 0.23
852 0.22
853 0.21
854 0.21
855 0.17
856 0.16
857 0.15
858 0.14
859 0.18
860 0.18
861 0.18
862 0.18
863 0.19
864 0.24
865 0.24
866 0.23
867 0.2
868 0.28
869 0.3
870 0.3
871 0.3
872 0.24
873 0.24
874 0.25
875 0.24
876 0.19
877 0.22
878 0.27
879 0.33
880 0.42
881 0.48
882 0.48
883 0.49
884 0.5
885 0.53
886 0.57
887 0.54
888 0.51
889 0.48
890 0.48
891 0.45
892 0.42
893 0.35
894 0.29
895 0.28
896 0.27
897 0.28
898 0.29
899 0.28
900 0.31
901 0.38
902 0.39
903 0.4
904 0.4
905 0.42
906 0.46
907 0.46
908 0.43
909 0.36
910 0.33
911 0.3
912 0.26
913 0.19
914 0.13
915 0.12
916 0.12
917 0.11
918 0.08
919 0.06
920 0.08
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.08
925 0.08
926 0.08
927 0.1
928 0.14
929 0.15
930 0.19
931 0.19
932 0.22
933 0.27
934 0.28
935 0.3
936 0.28
937 0.28
938 0.28
939 0.33
940 0.34
941 0.35
942 0.35
943 0.32
944 0.3
945 0.28
946 0.27
947 0.27
948 0.24
949 0.24
950 0.3
951 0.31
952 0.34
953 0.36
954 0.34
955 0.32
956 0.36