Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YHF4

Protein Details
Accession W9YHF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
751-772ELSPSGPGRKRRKSRCGALINGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
757-763PGRKRRK
Subcellular Location(s) cyto 9, nucl 8, cysk 6, cyto_pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MGFKFCWFVELLEDLDAARQLKPLSSSRASRPEHHVVDKWFKAHGHQIPRHGPSAVAFLSCIFPERLSHRSYAMQEARLATVMGRILHLGIGRASRLRRWQELHLDFPTCLQQIMSEAEMPLPEAGGEVTLEEIDEALLQIAANSPFSSPEIRSSANDASPHDILLPIVRRLQSKEARWLVHMILKSYSPVQIPECPVMYAFHFLLPDILAVQNTIEAAVSILGEEDIRPLPPNPPKELRPLFRKACARYVVPKLGVMVRRQPFYKARSIRHCCRMATQRSMSVERKYDGEYCQIHIDLSKGKQNCIQIFSISGKDSTEDRVRLHGAIAAGLRLNEPDSGVKRNCIVEGELLVWSQSKKAIQPFHVIRKHVMHGLRFLGTEEDSPRAPDEQLMIVFYDILLLDDKVLSNEPHNERRMLLEGIVRSIEGEAEIGHRKVINFASRSAKSELREFFAHAINERWEGFVLKGCKDPYLSWGERSSVIKLKKDYIAGLGDTVDLCIVGGRRDQTVVDELKVGELSWTAFHLACLENREAVRRFNAKPVFRILDVLSYHNLSRDNILYLNRRGQFVQTSYSEITPHLDVRIDQKGIRPPTALFKKPFVVEVMGAGFEKPSNTSYFTLRFPRALNIKLHMDRSVVETNTFEEVQELAHKSLTAPTDPEDLEEAGWLRRLILADGKGPNVDGNSQSTSPSKSTTSDRVSIEDLDRDEPGWRDTSPIASTKRTEMPMDLRSSDSTSTPGTPGKDSKRTLELSPSGPGRKRRKSRCGALINGVPLETGVKDESNRAVSAKALVPISYARHNLLSLIPPLDPPAVFRSSRKTPARLGGSVRTRNKRQPLSEIANISPPSVPKGKAPTDLSAENMTRIEKACGNTSMRLREKDRSVQAPKRKLCPSLVMSTECFIKLILDSCWADVSNDSAGLEAHSAHTCLTHRRVYLKLMNHAGAGSEDQVAHEIFGVCRDIREAWTAQRNRVERQCTHLTHASEKRNHQKAIMIFTQRIAEHDFLTGPGARHCDVCDILMDPQSRKFFLACHFLTFETQLPGNASVHQGPGVNGIAKNKVQNGHEAARKVETMSASTTFEWEEATSRLPGWP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.16
4 0.14
5 0.12
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.21
10 0.25
11 0.31
12 0.36
13 0.41
14 0.47
15 0.56
16 0.58
17 0.59
18 0.62
19 0.64
20 0.64
21 0.64
22 0.62
23 0.6
24 0.65
25 0.63
26 0.56
27 0.5
28 0.45
29 0.43
30 0.47
31 0.47
32 0.48
33 0.5
34 0.57
35 0.62
36 0.65
37 0.64
38 0.54
39 0.47
40 0.38
41 0.38
42 0.3
43 0.22
44 0.18
45 0.17
46 0.18
47 0.17
48 0.19
49 0.13
50 0.13
51 0.17
52 0.22
53 0.25
54 0.26
55 0.28
56 0.28
57 0.33
58 0.35
59 0.41
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.4
64 0.38
65 0.32
66 0.3
67 0.2
68 0.18
69 0.17
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.19
81 0.21
82 0.25
83 0.34
84 0.39
85 0.44
86 0.47
87 0.53
88 0.59
89 0.62
90 0.63
91 0.58
92 0.54
93 0.46
94 0.44
95 0.4
96 0.3
97 0.25
98 0.18
99 0.15
100 0.15
101 0.18
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.12
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.12
135 0.15
136 0.14
137 0.18
138 0.22
139 0.23
140 0.25
141 0.29
142 0.32
143 0.32
144 0.33
145 0.3
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.22
150 0.18
151 0.15
152 0.18
153 0.2
154 0.17
155 0.21
156 0.23
157 0.25
158 0.29
159 0.38
160 0.41
161 0.42
162 0.5
163 0.52
164 0.52
165 0.51
166 0.5
167 0.43
168 0.4
169 0.36
170 0.28
171 0.23
172 0.22
173 0.22
174 0.2
175 0.21
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.23
180 0.26
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.24
185 0.23
186 0.21
187 0.19
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.18
219 0.25
220 0.3
221 0.34
222 0.4
223 0.42
224 0.5
225 0.57
226 0.57
227 0.58
228 0.62
229 0.59
230 0.62
231 0.67
232 0.61
233 0.6
234 0.57
235 0.53
236 0.51
237 0.55
238 0.52
239 0.45
240 0.42
241 0.37
242 0.38
243 0.38
244 0.34
245 0.36
246 0.34
247 0.36
248 0.36
249 0.4
250 0.4
251 0.41
252 0.48
253 0.47
254 0.51
255 0.59
256 0.67
257 0.7
258 0.73
259 0.73
260 0.64
261 0.64
262 0.66
263 0.62
264 0.62
265 0.56
266 0.52
267 0.52
268 0.58
269 0.53
270 0.48
271 0.45
272 0.37
273 0.36
274 0.33
275 0.32
276 0.27
277 0.31
278 0.27
279 0.25
280 0.27
281 0.25
282 0.22
283 0.19
284 0.2
285 0.17
286 0.18
287 0.23
288 0.21
289 0.23
290 0.26
291 0.32
292 0.33
293 0.32
294 0.3
295 0.25
296 0.27
297 0.27
298 0.26
299 0.2
300 0.18
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.21
306 0.2
307 0.2
308 0.23
309 0.25
310 0.24
311 0.23
312 0.2
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.11
325 0.13
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.22
330 0.23
331 0.23
332 0.2
333 0.19
334 0.13
335 0.14
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.13
346 0.19
347 0.24
348 0.26
349 0.34
350 0.4
351 0.48
352 0.51
353 0.5
354 0.46
355 0.45
356 0.45
357 0.41
358 0.38
359 0.3
360 0.28
361 0.29
362 0.26
363 0.22
364 0.21
365 0.17
366 0.14
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.16
397 0.2
398 0.26
399 0.28
400 0.28
401 0.27
402 0.29
403 0.3
404 0.24
405 0.2
406 0.17
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.13
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.06
418 0.09
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.12
424 0.15
425 0.18
426 0.17
427 0.21
428 0.27
429 0.27
430 0.31
431 0.32
432 0.32
433 0.28
434 0.33
435 0.31
436 0.28
437 0.28
438 0.25
439 0.24
440 0.24
441 0.23
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.13
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.16
455 0.16
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.23
461 0.23
462 0.22
463 0.23
464 0.23
465 0.25
466 0.26
467 0.25
468 0.23
469 0.25
470 0.26
471 0.27
472 0.28
473 0.28
474 0.28
475 0.25
476 0.21
477 0.2
478 0.16
479 0.15
480 0.12
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.05
485 0.04
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.06
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.13
497 0.13
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.1
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.04
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.19
523 0.22
524 0.22
525 0.28
526 0.35
527 0.32
528 0.33
529 0.36
530 0.34
531 0.29
532 0.3
533 0.22
534 0.2
535 0.19
536 0.19
537 0.16
538 0.14
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.1
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.14
548 0.17
549 0.18
550 0.24
551 0.24
552 0.24
553 0.23
554 0.23
555 0.22
556 0.2
557 0.21
558 0.16
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.17
563 0.14
564 0.15
565 0.12
566 0.11
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.12
571 0.16
572 0.15
573 0.15
574 0.18
575 0.24
576 0.26
577 0.27
578 0.24
579 0.21
580 0.29
581 0.35
582 0.36
583 0.32
584 0.32
585 0.33
586 0.33
587 0.33
588 0.25
589 0.19
590 0.14
591 0.13
592 0.11
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.08
602 0.11
603 0.12
604 0.15
605 0.17
606 0.2
607 0.24
608 0.24
609 0.25
610 0.23
611 0.26
612 0.28
613 0.29
614 0.27
615 0.26
616 0.31
617 0.31
618 0.31
619 0.27
620 0.24
621 0.2
622 0.24
623 0.24
624 0.18
625 0.17
626 0.16
627 0.16
628 0.18
629 0.17
630 0.12
631 0.09
632 0.09
633 0.08
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.13
641 0.14
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.15
646 0.15
647 0.15
648 0.13
649 0.12
650 0.11
651 0.11
652 0.1
653 0.08
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.11
661 0.12
662 0.15
663 0.17
664 0.17
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.12
669 0.12
670 0.09
671 0.11
672 0.13
673 0.13
674 0.14
675 0.15
676 0.17
677 0.17
678 0.18
679 0.16
680 0.16
681 0.2
682 0.26
683 0.29
684 0.32
685 0.32
686 0.32
687 0.32
688 0.31
689 0.28
690 0.24
691 0.21
692 0.17
693 0.16
694 0.14
695 0.14
696 0.13
697 0.14
698 0.13
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.15
703 0.15
704 0.2
705 0.21
706 0.22
707 0.24
708 0.25
709 0.29
710 0.28
711 0.27
712 0.25
713 0.27
714 0.29
715 0.31
716 0.28
717 0.25
718 0.25
719 0.25
720 0.23
721 0.19
722 0.16
723 0.14
724 0.14
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.18
729 0.24
730 0.29
731 0.35
732 0.36
733 0.38
734 0.41
735 0.42
736 0.4
737 0.41
738 0.37
739 0.32
740 0.34
741 0.34
742 0.33
743 0.36
744 0.44
745 0.47
746 0.54
747 0.62
748 0.68
749 0.75
750 0.79
751 0.84
752 0.84
753 0.82
754 0.76
755 0.71
756 0.65
757 0.55
758 0.46
759 0.37
760 0.26
761 0.19
762 0.15
763 0.09
764 0.07
765 0.07
766 0.08
767 0.08
768 0.1
769 0.13
770 0.14
771 0.15
772 0.14
773 0.14
774 0.13
775 0.16
776 0.16
777 0.16
778 0.14
779 0.13
780 0.14
781 0.15
782 0.17
783 0.18
784 0.18
785 0.17
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.18
790 0.18
791 0.16
792 0.16
793 0.14
794 0.14
795 0.15
796 0.16
797 0.13
798 0.13
799 0.15
800 0.18
801 0.19
802 0.2
803 0.26
804 0.31
805 0.41
806 0.44
807 0.44
808 0.45
809 0.52
810 0.56
811 0.52
812 0.5
813 0.49
814 0.53
815 0.58
816 0.62
817 0.61
818 0.62
819 0.67
820 0.72
821 0.71
822 0.66
823 0.65
824 0.65
825 0.64
826 0.63
827 0.58
828 0.49
829 0.47
830 0.44
831 0.37
832 0.3
833 0.23
834 0.22
835 0.23
836 0.23
837 0.21
838 0.28
839 0.31
840 0.36
841 0.39
842 0.39
843 0.4
844 0.4
845 0.38
846 0.35
847 0.32
848 0.26
849 0.24
850 0.21
851 0.18
852 0.18
853 0.18
854 0.17
855 0.19
856 0.22
857 0.26
858 0.28
859 0.31
860 0.35
861 0.42
862 0.43
863 0.47
864 0.48
865 0.5
866 0.53
867 0.57
868 0.58
869 0.59
870 0.63
871 0.66
872 0.72
873 0.75
874 0.74
875 0.73
876 0.71
877 0.66
878 0.6
879 0.59
880 0.54
881 0.5
882 0.49
883 0.44
884 0.4
885 0.38
886 0.36
887 0.28
888 0.23
889 0.16
890 0.13
891 0.11
892 0.12
893 0.11
894 0.14
895 0.15
896 0.15
897 0.16
898 0.16
899 0.15
900 0.13
901 0.15
902 0.11
903 0.11
904 0.1
905 0.09
906 0.09
907 0.09
908 0.09
909 0.07
910 0.09
911 0.09
912 0.09
913 0.09
914 0.12
915 0.13
916 0.19
917 0.24
918 0.27
919 0.29
920 0.33
921 0.36
922 0.41
923 0.46
924 0.46
925 0.48
926 0.48
927 0.46
928 0.42
929 0.4
930 0.33
931 0.27
932 0.21
933 0.15
934 0.11
935 0.1
936 0.1
937 0.11
938 0.11
939 0.1
940 0.1
941 0.1
942 0.09
943 0.11
944 0.14
945 0.12
946 0.12
947 0.15
948 0.14
949 0.15
950 0.2
951 0.2
952 0.25
953 0.35
954 0.38
955 0.42
956 0.48
957 0.5
958 0.53
959 0.59
960 0.6
961 0.52
962 0.56
963 0.6
964 0.54
965 0.58
966 0.56
967 0.51
968 0.53
969 0.59
970 0.61
971 0.59
972 0.66
973 0.69
974 0.71
975 0.69
976 0.61
977 0.6
978 0.55
979 0.55
980 0.53
981 0.48
982 0.4
983 0.41
984 0.43
985 0.36
986 0.34
987 0.31
988 0.25
989 0.21
990 0.21
991 0.2
992 0.16
993 0.19
994 0.19
995 0.16
996 0.18
997 0.21
998 0.2
999 0.21
1000 0.21
1001 0.23
1002 0.21
1003 0.21
1004 0.19
1005 0.17
1006 0.19
1007 0.24
1008 0.26
1009 0.23
1010 0.29
1011 0.32
1012 0.32
1013 0.31
1014 0.29
1015 0.27
1016 0.3
1017 0.38
1018 0.32
1019 0.33
1020 0.34
1021 0.33
1022 0.35
1023 0.33
1024 0.3
1025 0.24
1026 0.24
1027 0.2
1028 0.21
1029 0.22
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.22
1033 0.19
1034 0.2
1035 0.2
1036 0.19
1037 0.17
1038 0.2
1039 0.21
1040 0.2
1041 0.21
1042 0.23
1043 0.27
1044 0.28
1045 0.32
1046 0.33
1047 0.36
1048 0.34
1049 0.4
1050 0.44
1051 0.46
1052 0.49
1053 0.47
1054 0.45
1055 0.43
1056 0.42
1057 0.36
1058 0.33
1059 0.26
1060 0.23
1061 0.24
1062 0.24
1063 0.23
1064 0.23
1065 0.23
1066 0.2
1067 0.19
1068 0.18
1069 0.15
1070 0.15
1071 0.14
1072 0.16
1073 0.16