Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AVB8

Protein Details
Accession Q5AVB8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-366YGSLSEQPRTKRRQNKQGEDVRERVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ani:AN7762.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MAEEQSSDPVRLDGRKLEGGGQLVRIAVALSALTGRAVVIDHVRGNRSGKRGLKASHLAAIKALGELSGSTLVKAQVGSCSVGFYPPPQEQGRPPQTSSDINIRLPTPGSVFLVFQALYPYLLYSDSAEQIRLSIVGGTNVSSSPSYDYVSQVLIPNFARLGLPPISVRLEKRGWASSQGHLGKVIFTINTLRRRRGGASSHDDPSIDLHRCRRGKISKIDITVLAPDDHLVTDTAGTTKSESSKRGIWEDVAAELEENEKQGTVREFTERYVRATLRRRLKELPRDVFLRPQLEGASLDRRPHVIPIETHTTEATHRRSCLYVLIVAHTSTGFKIGRDSLYGSLSEQPRTKRRQNKQGEDVRERVERLVDDCVESFIGEIYDPLVQTQSSASELPRHRPCVDEYMRDQLVIFEALGQASNNKDHQEYESREDEKYWSLHTKTAQWVCRELLGQSSAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.33
4 0.35
5 0.34
6 0.35
7 0.33
8 0.29
9 0.24
10 0.21
11 0.19
12 0.16
13 0.12
14 0.08
15 0.07
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.13
28 0.17
29 0.2
30 0.22
31 0.25
32 0.3
33 0.34
34 0.36
35 0.42
36 0.44
37 0.47
38 0.52
39 0.51
40 0.55
41 0.55
42 0.52
43 0.5
44 0.46
45 0.4
46 0.33
47 0.32
48 0.24
49 0.18
50 0.15
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.17
73 0.17
74 0.23
75 0.24
76 0.27
77 0.31
78 0.41
79 0.48
80 0.47
81 0.46
82 0.44
83 0.46
84 0.46
85 0.44
86 0.42
87 0.37
88 0.34
89 0.35
90 0.31
91 0.29
92 0.27
93 0.24
94 0.17
95 0.15
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.08
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.21
159 0.24
160 0.25
161 0.23
162 0.28
163 0.29
164 0.26
165 0.33
166 0.32
167 0.29
168 0.27
169 0.26
170 0.2
171 0.18
172 0.16
173 0.08
174 0.07
175 0.12
176 0.17
177 0.26
178 0.29
179 0.3
180 0.31
181 0.34
182 0.36
183 0.37
184 0.36
185 0.34
186 0.39
187 0.41
188 0.41
189 0.39
190 0.36
191 0.3
192 0.27
193 0.25
194 0.19
195 0.17
196 0.2
197 0.28
198 0.29
199 0.3
200 0.36
201 0.38
202 0.43
203 0.5
204 0.55
205 0.51
206 0.52
207 0.52
208 0.44
209 0.38
210 0.31
211 0.24
212 0.15
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.11
228 0.13
229 0.15
230 0.17
231 0.2
232 0.22
233 0.24
234 0.24
235 0.2
236 0.19
237 0.18
238 0.16
239 0.12
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.23
257 0.22
258 0.23
259 0.25
260 0.26
261 0.3
262 0.38
263 0.45
264 0.48
265 0.5
266 0.52
267 0.55
268 0.63
269 0.66
270 0.66
271 0.63
272 0.57
273 0.56
274 0.53
275 0.51
276 0.46
277 0.38
278 0.29
279 0.25
280 0.22
281 0.2
282 0.2
283 0.16
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.18
293 0.18
294 0.22
295 0.29
296 0.28
297 0.28
298 0.25
299 0.23
300 0.23
301 0.28
302 0.29
303 0.24
304 0.24
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.27
309 0.22
310 0.2
311 0.17
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.13
317 0.12
318 0.09
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.17
326 0.19
327 0.16
328 0.17
329 0.18
330 0.16
331 0.2
332 0.22
333 0.24
334 0.26
335 0.31
336 0.38
337 0.46
338 0.54
339 0.58
340 0.67
341 0.73
342 0.8
343 0.83
344 0.85
345 0.86
346 0.86
347 0.82
348 0.76
349 0.7
350 0.62
351 0.53
352 0.44
353 0.37
354 0.29
355 0.24
356 0.25
357 0.21
358 0.2
359 0.19
360 0.19
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.09
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.12
380 0.2
381 0.23
382 0.32
383 0.39
384 0.43
385 0.42
386 0.43
387 0.46
388 0.48
389 0.51
390 0.49
391 0.45
392 0.48
393 0.47
394 0.45
395 0.41
396 0.31
397 0.27
398 0.21
399 0.17
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.19
411 0.2
412 0.26
413 0.33
414 0.36
415 0.39
416 0.44
417 0.44
418 0.44
419 0.44
420 0.41
421 0.36
422 0.32
423 0.32
424 0.32
425 0.32
426 0.36
427 0.38
428 0.42
429 0.47
430 0.54
431 0.54
432 0.5
433 0.52
434 0.49
435 0.5
436 0.44
437 0.35
438 0.32