FuNGI

W9VQW1

Protein Details

Accession

W9VQW1

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-32	NGGPANKPVIRRKKPAADPFFKGPK	Hydrophilic
200-219	SQNAGKRTNFKKKTQQVFKS	Hydrophilic
527-549	GTDASVRKKKLKSKHLSSTQPTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-38	KPVIRRKKPAADPFFKGPKVKPAAT
146-147	RR
416-435	KREAEAKKKNFRDLRKALER
533-539	RKKKLKS

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGSAPNGGPANKPVIRRKKPAADPFFKGPKVKPAATKYPPAGRENGHPTPPTINGQSKPQTPPVLARPRAPSPSRPPVPERERISGFTDPRVTAEGIPYRDYRLVTTKKDLLKGLRYHILQLAGEKPIDIRNEAEFAKPARLHRRDPRAPPPGHQEKKEDEQLDSKDGLNAAEREELNRRKEARQKEREANLAQIAPSQNAGKRTNFKKKTQQVFKSEFSAEEKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHSLIGHHQPGSRDSNATFMYEPAVDASTGKFRLIPIEKIYQFKPKRDDLQKMTIEEVEAAMKKGGSDPEWLVRSREARIKEQMRERDAKESRGLFLGAAKTTAFAGRTGEEADLDFEEDFADDEEGDLFMDKDEDQKLAESRIKEDQLQANFLDFKDLNEYDEAEAREKREAEAKKKNFRDLRKALERRERNYNHGSDSEYESSTDTDEEEARLERERLANKQKEEEEAKKSNLPSSGTNTPSGRKEKRDTDREEGGMKKSTSSRSLKRPASPNASDASGTDASVRKKKLKSKHLSSTQPTPGHSRPGSPANVPSSSAPAGAFDPLAKIRRRGVAGSPAGSDTETDGAAMSDASRARRLKLNVGGSPPAPSSRAASPVPTPATAPRPPAFPSEQDIRNAIPPEGISVRDLIRKIPHPPERKTEFVNLVKAITRLDKDRGLLLPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.48
3	0.53
4	0.6
5	0.67
6	0.74
7	0.76
8	0.82
9	0.86
10	0.86
11	0.82
12	0.8
13	0.8
14	0.79
15	0.73
16	0.68
17	0.6
18	0.59
19	0.6
20	0.59
21	0.58
22	0.58
23	0.64
24	0.64
25	0.69
26	0.66
27	0.67
28	0.67
29	0.62
30	0.58
31	0.51
32	0.54
33	0.55
34	0.54
35	0.51
36	0.46
37	0.45
38	0.44
39	0.45
40	0.42
41	0.39
42	0.4
43	0.37
44	0.45
45	0.49
46	0.51
47	0.52
48	0.53
49	0.5
50	0.45
51	0.5
52	0.51
53	0.55
54	0.52
55	0.53
56	0.54
57	0.56
58	0.63
59	0.6
60	0.59
61	0.58
62	0.66
63	0.66
64	0.65
65	0.64
66	0.66
67	0.69
68	0.69
69	0.66
70	0.63
71	0.6
72	0.57
73	0.57
74	0.54
75	0.49
76	0.46
77	0.44
78	0.37
79	0.35
80	0.35
81	0.31
82	0.24
83	0.29
84	0.29
85	0.27
86	0.3
87	0.29
88	0.29
89	0.31
90	0.3
91	0.27
92	0.31
93	0.35
94	0.37
95	0.43
96	0.47
97	0.48
98	0.52
99	0.53
100	0.49
101	0.51
102	0.51
103	0.5
104	0.49
105	0.45
106	0.44
107	0.42
108	0.38
109	0.3
110	0.29
111	0.26
112	0.21
113	0.2
114	0.18
115	0.16
116	0.18
117	0.19
118	0.17
119	0.16
120	0.16
121	0.2
122	0.2
123	0.21
124	0.2
125	0.2
126	0.25
127	0.26
128	0.31
129	0.38
130	0.43
131	0.5
132	0.56
133	0.66
134	0.67
135	0.73
136	0.76
137	0.76
138	0.73
139	0.69
140	0.7
141	0.7
142	0.68
143	0.63
144	0.59
145	0.55
146	0.59
147	0.62
148	0.54
149	0.45
150	0.45
151	0.44
152	0.42
153	0.37
154	0.3
155	0.24
156	0.23
157	0.21
158	0.18
159	0.16
160	0.14
161	0.17
162	0.17
163	0.18
164	0.26
165	0.32
166	0.32
167	0.38
168	0.4
169	0.43
170	0.51
171	0.59
172	0.62
173	0.66
174	0.71
175	0.73
176	0.74
177	0.74
178	0.68
179	0.6
180	0.52
181	0.43
182	0.34
183	0.29
184	0.25
185	0.18
186	0.18
187	0.17
188	0.16
189	0.21
190	0.24
191	0.25
192	0.33
193	0.41
194	0.51
195	0.55
196	0.6
197	0.66
198	0.73
199	0.79
200	0.81
201	0.8
202	0.78
203	0.78
204	0.73
205	0.66
206	0.57
207	0.48
208	0.43
209	0.44
210	0.37
211	0.39
212	0.4
213	0.37
214	0.41
215	0.41
216	0.39
217	0.39
218	0.47
219	0.43
220	0.44
221	0.43
222	0.38
223	0.43
224	0.42
225	0.33
226	0.25
227	0.23
228	0.2
229	0.27
230	0.3
231	0.27
232	0.28
233	0.27
234	0.25
235	0.24
236	0.23
237	0.21
238	0.24
239	0.24
240	0.26
241	0.28
242	0.29
243	0.32
244	0.36
245	0.31
246	0.26
247	0.22
248	0.23
249	0.21
250	0.22
251	0.18
252	0.14
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.17
267	0.19
268	0.21
269	0.21
270	0.28
271	0.3
272	0.32
273	0.34
274	0.37
275	0.38
276	0.4
277	0.42
278	0.39
279	0.46
280	0.5
281	0.56
282	0.52
283	0.58
284	0.56
285	0.51
286	0.48
287	0.39
288	0.32
289	0.24
290	0.19
291	0.12
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.08
300	0.1
301	0.11
302	0.15
303	0.18
304	0.18
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.2
309	0.24
310	0.22
311	0.24
312	0.32
313	0.36
314	0.39
315	0.45
316	0.48
317	0.48
318	0.5
319	0.47
320	0.49
321	0.46
322	0.42
323	0.39
324	0.34
325	0.3
326	0.26
327	0.25
328	0.15
329	0.15
330	0.14
331	0.1
332	0.1
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.07
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.1
372	0.12
373	0.16
374	0.14
375	0.16
376	0.2
377	0.21
378	0.21
379	0.24
380	0.26
381	0.24
382	0.25
383	0.23
384	0.2
385	0.19
386	0.18
387	0.18
388	0.13
389	0.12
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.16
395	0.12
396	0.16
397	0.16
398	0.14
399	0.15
400	0.15
401	0.17
402	0.17
403	0.17
404	0.21
405	0.26
406	0.32
407	0.42
408	0.49
409	0.56
410	0.59
411	0.67
412	0.67
413	0.68
414	0.69
415	0.65
416	0.66
417	0.67
418	0.7
419	0.69
420	0.72
421	0.72
422	0.65
423	0.7
424	0.63
425	0.59
426	0.6
427	0.54
428	0.47
429	0.42
430	0.4
431	0.31
432	0.34
433	0.29
434	0.23
435	0.21
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.17
451	0.2
452	0.26
453	0.36
454	0.41
455	0.41
456	0.47
457	0.46
458	0.47
459	0.5
460	0.48
461	0.46
462	0.45
463	0.45
464	0.43
465	0.43
466	0.4
467	0.37
468	0.33
469	0.28
470	0.3
471	0.34
472	0.31
473	0.34
474	0.33
475	0.33
476	0.37
477	0.43
478	0.42
479	0.43
480	0.48
481	0.54
482	0.62
483	0.68
484	0.69
485	0.67
486	0.67
487	0.62
488	0.6
489	0.53
490	0.47
491	0.43
492	0.36
493	0.32
494	0.3
495	0.32
496	0.35
497	0.4
498	0.44
499	0.48
500	0.57
501	0.6
502	0.63
503	0.68
504	0.68
505	0.69
506	0.64
507	0.56
508	0.49
509	0.45
510	0.37
511	0.29
512	0.27
513	0.19
514	0.17
515	0.17
516	0.19
517	0.23
518	0.29
519	0.33
520	0.35
521	0.41
522	0.5
523	0.57
524	0.64
525	0.7
526	0.74
527	0.8
528	0.82
529	0.84
530	0.81
531	0.8
532	0.77
533	0.7
534	0.62
535	0.59
536	0.52
537	0.51
538	0.46
539	0.4
540	0.36
541	0.4
542	0.41
543	0.36
544	0.39
545	0.35
546	0.35
547	0.33
548	0.3
549	0.28
550	0.25
551	0.24
552	0.18
553	0.15
554	0.15
555	0.14
556	0.13
557	0.09
558	0.11
559	0.15
560	0.21
561	0.22
562	0.24
563	0.27
564	0.33
565	0.36
566	0.36
567	0.37
568	0.41
569	0.43
570	0.41
571	0.38
572	0.33
573	0.31
574	0.28
575	0.23
576	0.15
577	0.12
578	0.1
579	0.09
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.08
586	0.1
587	0.12
588	0.19
589	0.21
590	0.24
591	0.31
592	0.34
593	0.39
594	0.46
595	0.51
596	0.48
597	0.52
598	0.52
599	0.45
600	0.44
601	0.37
602	0.31
603	0.25
604	0.22
605	0.21
606	0.2
607	0.25
608	0.23
609	0.25
610	0.26
611	0.32
612	0.33
613	0.3
614	0.29
615	0.29
616	0.35
617	0.36
618	0.4
619	0.34
620	0.35
621	0.37
622	0.41
623	0.4
624	0.36
625	0.38
626	0.39
627	0.41
628	0.41
629	0.41
630	0.37
631	0.38
632	0.38
633	0.32
634	0.26
635	0.22
636	0.24
637	0.24
638	0.23
639	0.18
640	0.18
641	0.21
642	0.24
643	0.25
644	0.24
645	0.29
646	0.33
647	0.4
648	0.48
649	0.55
650	0.58
651	0.64
652	0.7
653	0.7
654	0.7
655	0.68
656	0.66
657	0.65
658	0.62
659	0.62
660	0.53
661	0.48
662	0.46
663	0.41
664	0.36
665	0.32
666	0.3
667	0.29
668	0.33
669	0.35
670	0.34
671	0.38

W9VQW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer