Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9VRB2

Protein Details
Accession W9VRB2    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52FESTSKALRKELKRKNQTADLDHydrophilic
123-142AIKTKPAKLKRAQSNKREASHydrophilic
346-373LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-188RKVKPARNRSPAVIKKTEPVRNLKRK
353-365GFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MVSKTEVPQVTTEPPSQVLSLVSAFLDEYGFESTSKALRKELKRKNQTADLDGLQDGVNLETIVESWKRQEAQGSTSEDESSEESDASSSDSESGSSSDASDQGSSSESTSESETDSESREEAIKTKPAKLKRAQSNKREASPSSSSSSSSDSDADDEHEDGRKVKPARNRSPAVIKKTEPVRNLKRKAASSSSESESSSSVDRSAKRTKVAKSGGRSTSDSGTSSASSEEETSGDAGTSSDEEEQGDDEEASPTQPPTLGKLTAAAAEDPSDSSSNTVMGDVIDRSEEESHLAHGRGGKQIVTRKTHVGARPTRLAQLSAQSTVADHISNAYKSYEYADRAYNDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.27
4 0.24
5 0.19
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.06
15 0.07
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.17
22 0.22
23 0.22
24 0.25
25 0.34
26 0.44
27 0.55
28 0.64
29 0.7
30 0.76
31 0.82
32 0.84
33 0.84
34 0.78
35 0.72
36 0.66
37 0.57
38 0.48
39 0.41
40 0.34
41 0.24
42 0.2
43 0.15
44 0.1
45 0.09
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.16
55 0.18
56 0.18
57 0.25
58 0.24
59 0.27
60 0.32
61 0.35
62 0.32
63 0.32
64 0.31
65 0.25
66 0.24
67 0.21
68 0.17
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.16
111 0.21
112 0.23
113 0.3
114 0.35
115 0.4
116 0.48
117 0.52
118 0.59
119 0.63
120 0.72
121 0.74
122 0.76
123 0.81
124 0.77
125 0.74
126 0.68
127 0.58
128 0.54
129 0.49
130 0.43
131 0.36
132 0.32
133 0.28
134 0.26
135 0.28
136 0.22
137 0.19
138 0.16
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.17
151 0.18
152 0.22
153 0.29
154 0.38
155 0.47
156 0.53
157 0.55
158 0.52
159 0.6
160 0.62
161 0.61
162 0.55
163 0.47
164 0.44
165 0.49
166 0.51
167 0.44
168 0.47
169 0.51
170 0.56
171 0.6
172 0.6
173 0.57
174 0.54
175 0.55
176 0.5
177 0.43
178 0.37
179 0.36
180 0.33
181 0.29
182 0.27
183 0.23
184 0.19
185 0.17
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.13
190 0.14
191 0.19
192 0.25
193 0.26
194 0.31
195 0.37
196 0.38
197 0.43
198 0.48
199 0.48
200 0.47
201 0.53
202 0.51
203 0.48
204 0.47
205 0.4
206 0.35
207 0.31
208 0.26
209 0.19
210 0.17
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.12
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.13
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.06
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.17
283 0.19
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.24
288 0.32
289 0.37
290 0.4
291 0.4
292 0.4
293 0.43
294 0.48
295 0.47
296 0.49
297 0.49
298 0.5
299 0.54
300 0.52
301 0.53
302 0.47
303 0.44
304 0.36
305 0.36
306 0.33
307 0.27
308 0.26
309 0.21
310 0.21
311 0.2
312 0.19
313 0.12
314 0.09
315 0.11
316 0.14
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.16
322 0.2
323 0.22
324 0.21
325 0.23
326 0.27
327 0.27
328 0.29
329 0.3
330 0.27
331 0.22
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.21
338 0.21
339 0.28
340 0.35
341 0.43
342 0.51
343 0.6
344 0.68
345 0.76
346 0.85
347 0.86
348 0.9
349 0.91
350 0.9
351 0.9
352 0.87
353 0.86
354 0.84
355 0.77
356 0.67
357 0.56
358 0.49
359 0.4
360 0.34
361 0.26
362 0.19
363 0.16