FuNGI

W9WDH1

Protein Details

Accession

W9WDH1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
433-456	NPGGGKRRGAKAKRGKNGNEKFGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
434-449	PGGGKRRGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 8, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRSRWIDKKSAQTFHLLYRPQTDEALHDETAGERALYQISGPGSSSQHKPELKEGLHLKDLEDDLDFEDMRENEGEAAEYGIYFDDTKYDYMQHLRDIGDGATEAQFVEAVPVKVQGNGKGKTKAMKLEDALRELSVDDARSVAGSEDFSTFSTATRTRTYQNQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDETDEEDVFGALAKEGRNGELDLDEFAATFDEDDQGWESDVTEKASEQPSQLKLPAPNPALEGVDHTSELPAAAAEAAVAADGDWLRDFAKFKRDSARKAPPKAAESIIAASAIQDKAPSLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTAGQQLLDARFDQVEKMYSLDEGDEFDDADGGVSLASGMTGMTGASKMSKMSQLSTTSFADEGAVRADFDSMMDGFLGDWNKANPGGGKRRGAKAKRGKNGNEKFGLQQLDEVRAELGPARIYQRTTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.56
3	0.57
4	0.5
5	0.43
6	0.45
7	0.47
8	0.41
9	0.4
10	0.34
11	0.29
12	0.32
13	0.34
14	0.27
15	0.23
16	0.21
17	0.2
18	0.21
19	0.18
20	0.12
21	0.07
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.08
26	0.1
27	0.11
28	0.12
29	0.13
30	0.15
31	0.17
32	0.21
33	0.26
34	0.27
35	0.34
36	0.37
37	0.39
38	0.43
39	0.48
40	0.45
41	0.49
42	0.5
43	0.47
44	0.48
45	0.46
46	0.39
47	0.35
48	0.35
49	0.27
50	0.23
51	0.18
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.11
56	0.15
57	0.14
58	0.15
59	0.15
60	0.14
61	0.12
62	0.13
63	0.13
64	0.09
65	0.1
66	0.08
67	0.07
68	0.07
69	0.06
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.08
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.13
78	0.15
79	0.19
80	0.21
81	0.21
82	0.22
83	0.22
84	0.21
85	0.21
86	0.18
87	0.14
88	0.12
89	0.12
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.08
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.13
101	0.13
102	0.17
103	0.19
104	0.24
105	0.28
106	0.32
107	0.36
108	0.38
109	0.39
110	0.41
111	0.43
112	0.42
113	0.39
114	0.4
115	0.37
116	0.42
117	0.43
118	0.39
119	0.37
120	0.3
121	0.26
122	0.21
123	0.21
124	0.13
125	0.11
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.07
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.08
136	0.09
137	0.09
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.13
142	0.14
143	0.16
144	0.18
145	0.2
146	0.21
147	0.29
148	0.36
149	0.4
150	0.46
151	0.48
152	0.47
153	0.47
154	0.46
155	0.39
156	0.33
157	0.25
158	0.18
159	0.13
160	0.12
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.08
178	0.07
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.05
196	0.05
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.09
205	0.07
206	0.08
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.07
227	0.1
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.15
232	0.16
233	0.18
234	0.19
235	0.19
236	0.2
237	0.21
238	0.26
239	0.23
240	0.21
241	0.21
242	0.2
243	0.18
244	0.16
245	0.16
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.05
254	0.04
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.04
269	0.05
270	0.07
271	0.08
272	0.1
273	0.19
274	0.2
275	0.23
276	0.33
277	0.37
278	0.42
279	0.49
280	0.58
281	0.58
282	0.61
283	0.66
284	0.6
285	0.58
286	0.55
287	0.47
288	0.38
289	0.3
290	0.26
291	0.2
292	0.15
293	0.12
294	0.1
295	0.11
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.15
308	0.17
309	0.17
310	0.24
311	0.32
312	0.41
313	0.45
314	0.5
315	0.55
316	0.63
317	0.71
318	0.71
319	0.73
320	0.73
321	0.75
322	0.75
323	0.67
324	0.59
325	0.5
326	0.42
327	0.34
328	0.25
329	0.18
330	0.14
331	0.13
332	0.11
333	0.13
334	0.13
335	0.12
336	0.13
337	0.15
338	0.16
339	0.15
340	0.16
341	0.18
342	0.19
343	0.2
344	0.19
345	0.16
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.02
375	0.02
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.04
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.1
385	0.15
386	0.15
387	0.18
388	0.23
389	0.26
390	0.28
391	0.31
392	0.3
393	0.27
394	0.26
395	0.23
396	0.19
397	0.15
398	0.14
399	0.12
400	0.11
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.09
405	0.08
406	0.1
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.07
412	0.1
413	0.12
414	0.1
415	0.11
416	0.12
417	0.14
418	0.14
419	0.16
420	0.18
421	0.25
422	0.35
423	0.4
424	0.48
425	0.52
426	0.61
427	0.7
428	0.71
429	0.73
430	0.74
431	0.77
432	0.78
433	0.82
434	0.83
435	0.83
436	0.86
437	0.84
438	0.79
439	0.71
440	0.65
441	0.61
442	0.55
443	0.44
444	0.4
445	0.34
446	0.34
447	0.32
448	0.29
449	0.24
450	0.21
451	0.21
452	0.18
453	0.18
454	0.14
455	0.16
456	0.2
457	0.22
458	0.26

W9WDH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer