Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9VNC0

Protein Details
Accession W9VNC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-140LSSSKAQKSGKKRKANGATKAEHydrophilic
458-477DISGMVKRKKPKPTESNGGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-133KSGKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.332, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MATNGDEVSTTVPDPKHEEQRGMAPSMAAATDQTSGNPPDADKHAQLTELIAQAAAEYAVKHYSEAAELYSQATELQAELNGEMAIENADLYYSYGKCLFFLAQQSSSVLGGTAASAQLSSSKAQKSGKKRKANGATKAEASTTNGGGAGATSKAVSAASETTVPNVGDVVPQEDVKQPPQTASDKPYFQISGDAEGWDDSEDDEADEDEEAGEEDDDDDFATSYEFLDLARVLYLKKLDQSQEHAMEDSEKGKYVASIDLTPEVKALKARVAEIYDLQAEVELEGEKYSDAATNLNACLALREELERPESSILAECHYKLSLALEFSASSEERDAAGHPTGKLSVDWKIRNEAIAQQEKAIDVCKMRVAAETAALDKLDAGPAKDKAMAQIEDVQDMIAEMEVRLEELRKPPVSVKAESENQMKQQIQGVLGSLLGSGVTEEEKKEKLAQVTEKATDISGMVKRKKPKPTESNGGDSGQGSAASTPAAAASAVASGSSLGKRKVEFMDDAAHAETGKKAKVEDVEDSGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.41
4 0.43
5 0.46
6 0.43
7 0.51
8 0.52
9 0.47
10 0.41
11 0.3
12 0.27
13 0.25
14 0.22
15 0.14
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.19
27 0.25
28 0.29
29 0.27
30 0.29
31 0.28
32 0.28
33 0.28
34 0.25
35 0.23
36 0.19
37 0.18
38 0.14
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.09
43 0.06
44 0.05
45 0.07
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.21
89 0.24
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.18
96 0.12
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.14
109 0.16
110 0.21
111 0.27
112 0.35
113 0.44
114 0.54
115 0.63
116 0.68
117 0.72
118 0.78
119 0.83
120 0.84
121 0.83
122 0.79
123 0.73
124 0.65
125 0.6
126 0.5
127 0.4
128 0.34
129 0.27
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.14
162 0.16
163 0.17
164 0.21
165 0.19
166 0.19
167 0.23
168 0.25
169 0.25
170 0.28
171 0.3
172 0.28
173 0.28
174 0.3
175 0.26
176 0.23
177 0.24
178 0.2
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.1
186 0.09
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.21
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.24
233 0.21
234 0.2
235 0.2
236 0.16
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.08
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.12
325 0.13
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.17
333 0.22
334 0.25
335 0.26
336 0.29
337 0.29
338 0.3
339 0.29
340 0.27
341 0.28
342 0.32
343 0.3
344 0.27
345 0.27
346 0.26
347 0.25
348 0.21
349 0.15
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.11
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.22
376 0.21
377 0.2
378 0.25
379 0.24
380 0.22
381 0.22
382 0.18
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.1
395 0.14
396 0.2
397 0.21
398 0.23
399 0.25
400 0.34
401 0.38
402 0.37
403 0.37
404 0.38
405 0.42
406 0.44
407 0.46
408 0.4
409 0.38
410 0.42
411 0.38
412 0.32
413 0.33
414 0.31
415 0.27
416 0.24
417 0.22
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.09
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.03
426 0.04
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.12
431 0.13
432 0.15
433 0.19
434 0.23
435 0.25
436 0.32
437 0.37
438 0.4
439 0.44
440 0.44
441 0.41
442 0.37
443 0.33
444 0.26
445 0.2
446 0.18
447 0.19
448 0.26
449 0.32
450 0.37
451 0.47
452 0.54
453 0.64
454 0.68
455 0.74
456 0.76
457 0.79
458 0.83
459 0.8
460 0.79
461 0.72
462 0.64
463 0.54
464 0.44
465 0.36
466 0.26
467 0.2
468 0.13
469 0.1
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.08
485 0.12
486 0.16
487 0.18
488 0.22
489 0.23
490 0.28
491 0.31
492 0.33
493 0.32
494 0.31
495 0.35
496 0.32
497 0.34
498 0.3
499 0.27
500 0.22
501 0.2
502 0.22
503 0.19
504 0.21
505 0.2
506 0.19
507 0.24
508 0.3
509 0.33
510 0.33