FuNGI

W9VIW9

Protein Details

Accession

W9VIW9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-40	RGAPRPRGGIQRKSKAEREQFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-72	KPTTRGRGAPRPRGGIQRKSKAEREQFAKEEAERQKARAAEHEASTRGARAGSRAVNRGR
259-270	GVGRKRPPPSKK
326-333	KRALKKQP

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPDTPAASASAPKPTTRGRGAPRPRGGIQRKSKAEREQFAKEEAERQKARAAEHEASTRGARAGSRAVNRGRGGGATPGQRQGPAAGSGGVFGGGGGGITTTQSRHKYEGYAELLEGGVNRRGPEDGLPGDGDAGGAAGASKRSGGAGAGGSRGGGGGGGGGARAPTAGETVETTTDDERDDGPKRDIERIWISSDEDEHEHEHEADDAVMSSSGKGKQKVTATNGASKSSRYRAGLRPVRAPRMQRDEEDQTGRDRSGVGRKRPPPSKKPDVGPQEISSDEHRERDGDGDGGVEMDMDMDMGMDIDRDDSVHFIKEQPSSPDLRKRALKKQPGGVPHRHHGPLKAFANETLEDRAERLRMQDDVDKLHHIFVPRNDNSTNGDVDHEPSNLHDGKLLLFQLPPLTPFLIDPGAFADSEPKFKTEPSTATNGTVDLDTLPDAAPPTTETDGPVKQDPDRNVLEDKSASRNKNQDQLLPGADGLLTATAPLEGRLPAGVVGKLQVHRSGKVTLDWGGTDMEVKLGSEVDFLQDVVLVERGGSNGDGDVAQDDEHEHADSGGAGGAAGGGKKDKDTKGAGKAYALGHVRHKMILIPDWAKLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.41
3	0.43
4	0.5
5	0.5
6	0.6
7	0.69
8	0.75
9	0.76
10	0.76
11	0.74
12	0.76
13	0.76
14	0.75
15	0.75
16	0.75
17	0.77
18	0.78
19	0.81
20	0.8
21	0.81
22	0.8
23	0.76
24	0.74
25	0.68
26	0.64
27	0.6
28	0.52
29	0.51
30	0.49
31	0.51
32	0.45
33	0.44
34	0.45
35	0.44
36	0.44
37	0.42
38	0.44
39	0.39
40	0.41
41	0.44
42	0.4
43	0.39
44	0.38
45	0.32
46	0.25
47	0.22
48	0.18
49	0.17
50	0.22
51	0.26
52	0.3
53	0.36
54	0.39
55	0.45
56	0.45
57	0.44
58	0.38
59	0.32
60	0.29
61	0.27
62	0.28
63	0.27
64	0.29
65	0.31
66	0.3
67	0.3
68	0.29
69	0.25
70	0.23
71	0.19
72	0.18
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.13
77	0.11
78	0.08
79	0.06
80	0.05
81	0.03
82	0.03
83	0.03
84	0.03
85	0.03
86	0.04
87	0.05
88	0.06
89	0.13
90	0.17
91	0.2
92	0.24
93	0.26
94	0.28
95	0.3
96	0.37
97	0.35
98	0.32
99	0.29
100	0.26
101	0.24
102	0.22
103	0.19
104	0.13
105	0.12
106	0.12
107	0.13
108	0.13
109	0.14
110	0.14
111	0.16
112	0.19
113	0.17
114	0.17
115	0.17
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.12
120	0.07
121	0.06
122	0.04
123	0.03
124	0.03
125	0.03
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.07
134	0.08
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.07
142	0.04
143	0.03
144	0.02
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.06
158	0.07
159	0.08
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.15
168	0.18
169	0.2
170	0.21
171	0.25
172	0.26
173	0.31
174	0.3
175	0.31
176	0.33
177	0.32
178	0.32
179	0.3
180	0.29
181	0.24
182	0.25
183	0.21
184	0.16
185	0.15
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.13
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.08
201	0.13
202	0.16
203	0.18
204	0.19
205	0.24
206	0.29
207	0.34
208	0.36
209	0.4
210	0.39
211	0.44
212	0.44
213	0.41
214	0.37
215	0.33
216	0.32
217	0.27
218	0.29
219	0.24
220	0.28
221	0.32
222	0.42
223	0.48
224	0.47
225	0.52
226	0.53
227	0.57
228	0.55
229	0.53
230	0.49
231	0.51
232	0.5
233	0.43
234	0.44
235	0.43
236	0.43
237	0.42
238	0.35
239	0.29
240	0.28
241	0.26
242	0.2
243	0.16
244	0.15
245	0.22
246	0.28
247	0.33
248	0.4
249	0.46
250	0.54
251	0.63
252	0.68
253	0.68
254	0.7
255	0.73
256	0.69
257	0.67
258	0.68
259	0.66
260	0.63
261	0.56
262	0.48
263	0.4
264	0.35
265	0.33
266	0.25
267	0.23
268	0.19
269	0.17
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.15
274	0.14
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.02
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.02
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.08
302	0.11
303	0.13
304	0.15
305	0.16
306	0.18
307	0.21
308	0.24
309	0.3
310	0.3
311	0.32
312	0.37
313	0.4
314	0.48
315	0.54
316	0.59
317	0.56
318	0.61
319	0.61
320	0.62
321	0.63
322	0.61
323	0.57
324	0.51
325	0.52
326	0.48
327	0.44
328	0.4
329	0.37
330	0.37
331	0.35
332	0.33
333	0.28
334	0.26
335	0.28
336	0.25
337	0.22
338	0.16
339	0.14
340	0.12
341	0.13
342	0.13
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.13
349	0.17
350	0.17
351	0.19
352	0.2
353	0.21
354	0.2
355	0.2
356	0.2
357	0.17
358	0.19
359	0.21
360	0.29
361	0.27
362	0.3
363	0.29
364	0.29
365	0.31
366	0.3
367	0.26
368	0.17
369	0.18
370	0.15
371	0.17
372	0.17
373	0.14
374	0.11
375	0.11
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.12
381	0.13
382	0.15
383	0.15
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.1
401	0.1
402	0.14
403	0.13
404	0.17
405	0.18
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.23
410	0.21
411	0.24
412	0.24
413	0.3
414	0.29
415	0.3
416	0.3
417	0.26
418	0.22
419	0.18
420	0.15
421	0.09
422	0.08
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.17
436	0.19
437	0.22
438	0.24
439	0.23
440	0.25
441	0.31
442	0.32
443	0.33
444	0.34
445	0.33
446	0.33
447	0.32
448	0.31
449	0.27
450	0.27
451	0.3
452	0.35
453	0.35
454	0.38
455	0.46
456	0.47
457	0.52
458	0.52
459	0.48
460	0.44
461	0.46
462	0.41
463	0.33
464	0.29
465	0.21
466	0.19
467	0.14
468	0.1
469	0.07
470	0.05
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.11
486	0.15
487	0.17
488	0.18
489	0.24
490	0.24
491	0.26
492	0.29
493	0.3
494	0.28
495	0.28
496	0.28
497	0.24
498	0.23
499	0.21
500	0.2
501	0.17
502	0.15
503	0.14
504	0.12
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.1
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.1
539	0.11
540	0.1
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.08
554	0.09
555	0.13
556	0.2
557	0.22
558	0.27
559	0.34
560	0.41
561	0.48
562	0.54
563	0.52
564	0.47
565	0.49
566	0.44
567	0.44
568	0.39
569	0.33
570	0.34
571	0.37
572	0.37
573	0.33
574	0.33
575	0.3
576	0.31
577	0.33
578	0.35
579	0.32
580	0.33

W9VIW9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer