FuNGI

W9VLW3

Protein Details

Accession

W9VLW3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
426-449	SPASSPRMQPVKKRQAPNLFMKKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
231-233	KRP
238-253	PRAPIHAPGSRPPKPR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MPADSLLDMARRVAGRNIHKITDIGDVSYNIIRPVLLKIESPEQLYQLELNSPQLVGNTSELWLNFMKRDIPDYELKPHIPTNPMSWYKVYKKLKKEASKAASDAEAVLKATLSGIKSMKEENLAEVVSTERGNALYSSANAPGPSRRARFMYNYMAGRTGSKGANKMTLMEKIRKEAKSAKTGVMGRPMHELQKKHNGVVKAPAQFVEDVKRMKVLQQVEARKALTPPPKRPLSTTPRAPIHAPGSRPPKPRPQPAAAAGLEPYDLTSDREARLRALKAGKPIPPKPTVPDSALPQSPTSLAPRLRSTSASNGALTLDFLESDSEPEPVHETHKPVKSRQREADEALFGRTTTPSVKRKRDAEDDSGLPRKVLRPVSNADISSPPQKLSRPSSSGDEVSPSHNLLRPTLPDADLLARSRSPLKLSPASSPRMQPVKKRQAPNLFMKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.34
3	0.44
4	0.48
5	0.46
6	0.46
7	0.45
8	0.42
9	0.41
10	0.34
11	0.25
12	0.23
13	0.22
14	0.23
15	0.25
16	0.23
17	0.16
18	0.15
19	0.13
20	0.12
21	0.15
22	0.17
23	0.16
24	0.17
25	0.2
26	0.26
27	0.28
28	0.31
29	0.29
30	0.26
31	0.25
32	0.24
33	0.22
34	0.17
35	0.18
36	0.15
37	0.16
38	0.15
39	0.15
40	0.14
41	0.14
42	0.14
43	0.13
44	0.14
45	0.13
46	0.12
47	0.14
48	0.14
49	0.16
50	0.16
51	0.16
52	0.15
53	0.16
54	0.19
55	0.18
56	0.22
57	0.22
58	0.24
59	0.3
60	0.32
61	0.37
62	0.38
63	0.38
64	0.37
65	0.38
66	0.37
67	0.34
68	0.32
69	0.3
70	0.35
71	0.37
72	0.37
73	0.37
74	0.41
75	0.43
76	0.51
77	0.57
78	0.56
79	0.61
80	0.68
81	0.75
82	0.77
83	0.79
84	0.8
85	0.76
86	0.72
87	0.65
88	0.57
89	0.47
90	0.38
91	0.31
92	0.22
93	0.16
94	0.12
95	0.1
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.09
100	0.08
101	0.11
102	0.12
103	0.13
104	0.15
105	0.17
106	0.18
107	0.19
108	0.19
109	0.17
110	0.18
111	0.16
112	0.15
113	0.13
114	0.13
115	0.11
116	0.1
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.11
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.13
130	0.14
131	0.18
132	0.24
133	0.24
134	0.25
135	0.28
136	0.31
137	0.35
138	0.38
139	0.4
140	0.39
141	0.39
142	0.37
143	0.35
144	0.32
145	0.28
146	0.23
147	0.19
148	0.16
149	0.16
150	0.19
151	0.18
152	0.22
153	0.21
154	0.22
155	0.21
156	0.25
157	0.27
158	0.3
159	0.3
160	0.31
161	0.38
162	0.36
163	0.38
164	0.4
165	0.42
166	0.43
167	0.45
168	0.41
169	0.4
170	0.43
171	0.4
172	0.41
173	0.36
174	0.29
175	0.31
176	0.3
177	0.31
178	0.32
179	0.32
180	0.28
181	0.38
182	0.38
183	0.36
184	0.39
185	0.34
186	0.31
187	0.36
188	0.36
189	0.28
190	0.28
191	0.26
192	0.23
193	0.22
194	0.22
195	0.2
196	0.18
197	0.16
198	0.15
199	0.17
200	0.16
201	0.17
202	0.21
203	0.19
204	0.22
205	0.28
206	0.32
207	0.33
208	0.35
209	0.33
210	0.28
211	0.28
212	0.27
213	0.29
214	0.32
215	0.35
216	0.4
217	0.44
218	0.44
219	0.47
220	0.5
221	0.5
222	0.51
223	0.51
224	0.5
225	0.49
226	0.49
227	0.46
228	0.41
229	0.38
230	0.34
231	0.29
232	0.3
233	0.36
234	0.41
235	0.46
236	0.46
237	0.51
238	0.55
239	0.63
240	0.63
241	0.59
242	0.57
243	0.55
244	0.58
245	0.47
246	0.4
247	0.31
248	0.25
249	0.2
250	0.14
251	0.11
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.08
256	0.1
257	0.11
258	0.14
259	0.14
260	0.15
261	0.2
262	0.2
263	0.23
264	0.27
265	0.28
266	0.32
267	0.37
268	0.4
269	0.43
270	0.46
271	0.47
272	0.45
273	0.44
274	0.42
275	0.43
276	0.41
277	0.37
278	0.36
279	0.34
280	0.35
281	0.35
282	0.32
283	0.26
284	0.24
285	0.21
286	0.19
287	0.18
288	0.19
289	0.2
290	0.22
291	0.25
292	0.28
293	0.28
294	0.29
295	0.29
296	0.3
297	0.33
298	0.31
299	0.28
300	0.25
301	0.24
302	0.21
303	0.18
304	0.13
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.12
316	0.12
317	0.16
318	0.17
319	0.21
320	0.28
321	0.35
322	0.38
323	0.43
324	0.53
325	0.58
326	0.64
327	0.68
328	0.68
329	0.65
330	0.66
331	0.64
332	0.58
333	0.5
334	0.42
335	0.34
336	0.26
337	0.23
338	0.19
339	0.15
340	0.15
341	0.23
342	0.3
343	0.39
344	0.48
345	0.54
346	0.6
347	0.66
348	0.7
349	0.69
350	0.66
351	0.63
352	0.58
353	0.57
354	0.56
355	0.49
356	0.4
357	0.35
358	0.31
359	0.33
360	0.37
361	0.35
362	0.35
363	0.39
364	0.45
365	0.48
366	0.45
367	0.41
368	0.37
369	0.35
370	0.36
371	0.32
372	0.28
373	0.26
374	0.29
375	0.34
376	0.38
377	0.43
378	0.41
379	0.43
380	0.48
381	0.49
382	0.48
383	0.42
384	0.38
385	0.31
386	0.3
387	0.29
388	0.24
389	0.22
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.26
394	0.26
395	0.28
396	0.3
397	0.28
398	0.26
399	0.27
400	0.28
401	0.27
402	0.26
403	0.25
404	0.22
405	0.23
406	0.27
407	0.27
408	0.28
409	0.3
410	0.36
411	0.41
412	0.43
413	0.5
414	0.52
415	0.55
416	0.55
417	0.53
418	0.54
419	0.56
420	0.58
421	0.59
422	0.64
423	0.7
424	0.75
425	0.79
426	0.8
427	0.81
428	0.84
429	0.85

W9VLW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer