Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5B7Q3

Protein Details
Accession Q5B7Q3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-49VSAPEPPSKKALRKAKKKATVADAKAHydrophilic
315-336AAEKPQQKKAKNAKPDYTRYDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-42PSKKALRKAKKKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ani:AN3427.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTGIGEGNHKKRKLLDGAELEIDVSAPEPPSKKALRKAKKKATVADAKADTHPKSENGGTETAPQKRSDYGIWIGNLAFSVTKEDIRRFLTTNCSFTDATITRVHLPKPSDKSSRAQNKGFAYVDFSTPKALEEALGLSEQLVSGRRVLIKDAKNYKGRPEKSQDDGNNAPTSSGRPPSKRLFVGNLSFDTTKEFLEEHFSQCGTVTNVHVATFQDSGKCKGYAWVEFEDLEAAKTAERGYKYITEDNEDEDDSAQKPQRRKIWLNQVLGRRMRLEFAEDATTRYNKRFGKNGEGKKGATGNDGDAEPGDFEEVAAEKPQQKKAKNAKPDYTRYDESTVQKLSGAIVEGQGRKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.53
4 0.56
5 0.54
6 0.49
7 0.41
8 0.31
9 0.25
10 0.16
11 0.1
12 0.08
13 0.07
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.22
18 0.3
19 0.37
20 0.45
21 0.55
22 0.63
23 0.72
24 0.81
25 0.85
26 0.88
27 0.87
28 0.85
29 0.84
30 0.83
31 0.76
32 0.73
33 0.65
34 0.58
35 0.56
36 0.54
37 0.45
38 0.37
39 0.36
40 0.29
41 0.31
42 0.3
43 0.29
44 0.27
45 0.28
46 0.26
47 0.3
48 0.34
49 0.36
50 0.35
51 0.33
52 0.31
53 0.31
54 0.33
55 0.28
56 0.27
57 0.25
58 0.27
59 0.26
60 0.26
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.15
65 0.11
66 0.07
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.17
71 0.19
72 0.23
73 0.26
74 0.28
75 0.26
76 0.28
77 0.34
78 0.35
79 0.36
80 0.33
81 0.33
82 0.31
83 0.29
84 0.34
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.27
91 0.28
92 0.25
93 0.28
94 0.32
95 0.37
96 0.42
97 0.44
98 0.45
99 0.48
100 0.53
101 0.61
102 0.59
103 0.55
104 0.54
105 0.5
106 0.52
107 0.49
108 0.39
109 0.33
110 0.28
111 0.28
112 0.23
113 0.21
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.2
137 0.22
138 0.3
139 0.37
140 0.41
141 0.46
142 0.47
143 0.53
144 0.55
145 0.53
146 0.51
147 0.52
148 0.5
149 0.48
150 0.55
151 0.48
152 0.45
153 0.44
154 0.4
155 0.34
156 0.3
157 0.26
158 0.18
159 0.19
160 0.15
161 0.19
162 0.2
163 0.21
164 0.26
165 0.31
166 0.35
167 0.34
168 0.34
169 0.32
170 0.32
171 0.33
172 0.3
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.21
177 0.19
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.15
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.16
208 0.2
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.18
217 0.15
218 0.12
219 0.09
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.18
229 0.22
230 0.26
231 0.26
232 0.27
233 0.26
234 0.28
235 0.27
236 0.23
237 0.19
238 0.16
239 0.16
240 0.13
241 0.17
242 0.19
243 0.21
244 0.26
245 0.32
246 0.39
247 0.46
248 0.52
249 0.57
250 0.64
251 0.68
252 0.71
253 0.7
254 0.7
255 0.69
256 0.65
257 0.57
258 0.48
259 0.4
260 0.35
261 0.29
262 0.26
263 0.2
264 0.2
265 0.24
266 0.21
267 0.23
268 0.24
269 0.27
270 0.25
271 0.26
272 0.31
273 0.31
274 0.35
275 0.42
276 0.44
277 0.51
278 0.6
279 0.67
280 0.68
281 0.67
282 0.63
283 0.59
284 0.57
285 0.47
286 0.4
287 0.32
288 0.25
289 0.23
290 0.22
291 0.18
292 0.15
293 0.15
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.13
304 0.18
305 0.24
306 0.33
307 0.39
308 0.43
309 0.52
310 0.62
311 0.69
312 0.74
313 0.78
314 0.79
315 0.8
316 0.85
317 0.82
318 0.79
319 0.73
320 0.67
321 0.63
322 0.6
323 0.55
324 0.53
325 0.47
326 0.39
327 0.36
328 0.31
329 0.27
330 0.22
331 0.2
332 0.14
333 0.15
334 0.21
335 0.22
336 0.24
337 0.27