FuNGI

W9VPD3

Protein Details

Accession

W9VPD3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
416-448	KRRKEAADKQAIRDQRRNDANKARDARNNKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLTRKYPKIITPVIEEQPVDIDGVKYPVDTTKPNPNGEEFHNLYLDFNGIVHPCSHPEDKPPPANETEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRQQRSNNDDDEDDDEAETVEEVVKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRFWVQWKLNTDPAWAQLKVVISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPAYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFLNDAKARTCRICGRQGHYADNCRGEAKEKSGEFDEKGTVEKLKPFIWLNVPVLREYLGAEMFVPGQTFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIKEDGIDKLIAIWRDNIPLMGGYLTCDGKVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEAADKQAIRDQRRNDANKARDARNNKRRRSSPDYTKGSRVAADARVPTGMQTFEATNFPTLDYNSIVNRGAVDKTLASNKSAAAVLKEQMLARKAAAETAAKDAANGANGTPGSAGAVLGKRSASQMEAESDDPGTPASALGKRQAALMDDEPETDGTPGRNTPVEKKTSNNADPNNPPPDTVRLWEEGYSDRYYEQKFHVSPHDIEFRHKVAEAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIDKKVVKFEKGTPFKPYEQLMGVLPASSNHAIPTAFHPLMTEPDSDIVDFYPEEFDLDLNGAKQSWKAIVLLPFIDEKRLLKAMATKYPLLTADEHARNEHGYDALLISEQNPLYEQLALKFYSKKSKDAPKTVKLSMQKFQLAGDVIKNEDFLPHMDLVGPEPGIRLDPDVDDDRSMSVFFVMPPPTHVHKSMLFPGVGLPPAVLDKSDLAILRSKARTSGRDFGGAPLYDNTRRDPMDNQNRGGRINYAADRPPLNGPPMMPPPNQWPPGMPPPPPPNFGGQNAYNRGPPPPPSNGYPGYNNYANQGYGGYDQGQNGGQAHNGYYGGNQGQPQYGNNGHYQQNGGRSFSDGNYQSQNRGPPGRDNWGGNHGVNGYNQGGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.62
3	0.66
4	0.66
5	0.61
6	0.59
7	0.59
8	0.56
9	0.51
10	0.44
11	0.36
12	0.32
13	0.29
14	0.22
15	0.15
16	0.13
17	0.12
18	0.14
19	0.13
20	0.11
21	0.12
22	0.16
23	0.19
24	0.22
25	0.26
26	0.35
27	0.41
28	0.44
29	0.46
30	0.45
31	0.46
32	0.46
33	0.5
34	0.42
35	0.38
36	0.36
37	0.34
38	0.31
39	0.27
40	0.24
41	0.15
42	0.11
43	0.12
44	0.11
45	0.12
46	0.12
47	0.13
48	0.16
49	0.21
50	0.25
51	0.24
52	0.32
53	0.39
54	0.47
55	0.54
56	0.54
57	0.53
58	0.52
59	0.53
60	0.46
61	0.4
62	0.34
63	0.27
64	0.25
65	0.2
66	0.17
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.46
81	0.47
82	0.46
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.82
105	0.8
106	0.77
107	0.79
108	0.79
109	0.75
110	0.76
111	0.69
112	0.62
113	0.67
114	0.63
115	0.56
116	0.53
117	0.47
118	0.42
119	0.43
120	0.41
121	0.31
122	0.3
123	0.36
124	0.38
125	0.46
126	0.46
127	0.45
128	0.47
129	0.55
130	0.58
131	0.52
132	0.45
133	0.38
134	0.35
135	0.35
136	0.36
137	0.29
138	0.24
139	0.21
140	0.18
141	0.15
142	0.14
143	0.12
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.11
149	0.12
150	0.12
151	0.13
152	0.16
153	0.2
154	0.23
155	0.26
156	0.31
157	0.32
158	0.32
159	0.31
160	0.3
161	0.25
162	0.21
163	0.17
164	0.12
165	0.1
166	0.1
167	0.13
168	0.13
169	0.14
170	0.13
171	0.15
172	0.15
173	0.15
174	0.17
175	0.19
176	0.23
177	0.28
178	0.32
179	0.35
180	0.4
181	0.4
182	0.41
183	0.37
184	0.37
185	0.36
186	0.31
187	0.27
188	0.24
189	0.24
190	0.22
191	0.21
192	0.16
193	0.11
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.18
209	0.24
210	0.3
211	0.31
212	0.33
213	0.35
214	0.39
215	0.4
216	0.37
217	0.4
218	0.37
219	0.4
220	0.41
221	0.41
222	0.42
223	0.39
224	0.38
225	0.29
226	0.26
227	0.21
228	0.21
229	0.16
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.06
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.04
241	0.05
242	0.07
243	0.08
244	0.11
245	0.13
246	0.14
247	0.18
248	0.2
249	0.21
250	0.22
251	0.23
252	0.2
253	0.22
254	0.22
255	0.19
256	0.19
257	0.17
258	0.17
259	0.17
260	0.2
261	0.17
262	0.21
263	0.27
264	0.3
265	0.38
266	0.43
267	0.47
268	0.52
269	0.54
270	0.57
271	0.55
272	0.56
273	0.51
274	0.47
275	0.42
276	0.35
277	0.33
278	0.29
279	0.26
280	0.24
281	0.28
282	0.25
283	0.27
284	0.29
285	0.31
286	0.29
287	0.28
288	0.25
289	0.18
290	0.2
291	0.18
292	0.18
293	0.17
294	0.19
295	0.2
296	0.19
297	0.22
298	0.21
299	0.23
300	0.25
301	0.28
302	0.27
303	0.29
304	0.29
305	0.26
306	0.25
307	0.22
308	0.18
309	0.14
310	0.13
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.17
330	0.15
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.1
351	0.12
352	0.12
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.12
357	0.13
358	0.1
359	0.07
360	0.08
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.12
365	0.12
366	0.14
367	0.14
368	0.12
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.07
397	0.08
398	0.12
399	0.14
400	0.21
401	0.26
402	0.26
403	0.32
404	0.35
405	0.37
406	0.4
407	0.47
408	0.48
409	0.54
410	0.56
411	0.54
412	0.56
413	0.59
414	0.57
415	0.53
416	0.46
417	0.44
418	0.5
419	0.5
420	0.52
421	0.55
422	0.54
423	0.56
424	0.59
425	0.54
426	0.52
427	0.57
428	0.61
429	0.62
430	0.68
431	0.66
432	0.7
433	0.72
434	0.75
435	0.75
436	0.73
437	0.73
438	0.74
439	0.75
440	0.69
441	0.67
442	0.6
443	0.51
444	0.43
445	0.33
446	0.25
447	0.2
448	0.2
449	0.16
450	0.15
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.11
455	0.09
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.1
470	0.09
471	0.11
472	0.11
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.08
481	0.13
482	0.13
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.12
489	0.09
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.1
495	0.12
496	0.12
497	0.11
498	0.1
499	0.11
500	0.1
501	0.09
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.11
506	0.13
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.09
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.08
541	0.06
542	0.04
543	0.04
544	0.06
545	0.08
546	0.08
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.13
551	0.13
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.12
557	0.12
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.08
562	0.08
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.1
568	0.11
569	0.18
570	0.23
571	0.28
572	0.28
573	0.3
574	0.35
575	0.4
576	0.44
577	0.43
578	0.4
579	0.4
580	0.43
581	0.45
582	0.44
583	0.36
584	0.32
585	0.28
586	0.29
587	0.25
588	0.23
589	0.2
590	0.18
591	0.19
592	0.19
593	0.19
594	0.17
595	0.18
596	0.17
597	0.15
598	0.14
599	0.16
600	0.16
601	0.17
602	0.18
603	0.2
604	0.2
605	0.22
606	0.27
607	0.28
608	0.28
609	0.3
610	0.36
611	0.3
612	0.32
613	0.33
614	0.29
615	0.26
616	0.25
617	0.21
618	0.14
619	0.16
620	0.13
621	0.12
622	0.11
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.06
628	0.05
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.06
633	0.06
634	0.07
635	0.08
636	0.08
637	0.09
638	0.14
639	0.18
640	0.16
641	0.19
642	0.21
643	0.25
644	0.28
645	0.3
646	0.28
647	0.24
648	0.24
649	0.21
650	0.2
651	0.15
652	0.12
653	0.1
654	0.07
655	0.09
656	0.12
657	0.12
658	0.11
659	0.14
660	0.13
661	0.16
662	0.19
663	0.19
664	0.18
665	0.25
666	0.36
667	0.39
668	0.41
669	0.43
670	0.45
671	0.45
672	0.46
673	0.4
674	0.31
675	0.26
676	0.26
677	0.2
678	0.18
679	0.16
680	0.12
681	0.11
682	0.09
683	0.11
684	0.1
685	0.1
686	0.08
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.13
691	0.18
692	0.17
693	0.17
694	0.17
695	0.17
696	0.2
697	0.21
698	0.18
699	0.11
700	0.12
701	0.13
702	0.12
703	0.12
704	0.09
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.06
710	0.07
711	0.07
712	0.07
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.06
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.09
724	0.09
725	0.12
726	0.15
727	0.16
728	0.16
729	0.16
730	0.18
731	0.17
732	0.17
733	0.15
734	0.13
735	0.15
736	0.16
737	0.15
738	0.14
739	0.21
740	0.24
741	0.3
742	0.32
743	0.3
744	0.28
745	0.3
746	0.3
747	0.24
748	0.21
749	0.18
750	0.23
751	0.26
752	0.26
753	0.26
754	0.26
755	0.24
756	0.23
757	0.21
758	0.13
759	0.09
760	0.09
761	0.08
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.06
766	0.1
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.11
772	0.13
773	0.13
774	0.11
775	0.14
776	0.15
777	0.16
778	0.2
779	0.22
780	0.3
781	0.32
782	0.35
783	0.4
784	0.5
785	0.57
786	0.64
787	0.69
788	0.68
789	0.72
790	0.69
791	0.68
792	0.65
793	0.61
794	0.55
795	0.52
796	0.46
797	0.4
798	0.38
799	0.34
800	0.28
801	0.24
802	0.22
803	0.18
804	0.16
805	0.16
806	0.16
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.11
811	0.13
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.12
816	0.13
817	0.14
818	0.12
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.09
827	0.14
828	0.17
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.17
833	0.16
834	0.15
835	0.11
836	0.09
837	0.08
838	0.08
839	0.12
840	0.14
841	0.13
842	0.16
843	0.21
844	0.25
845	0.28
846	0.29
847	0.29
848	0.3
849	0.35
850	0.38
851	0.36
852	0.31
853	0.28
854	0.28
855	0.27
856	0.24
857	0.19
858	0.13
859	0.1
860	0.11
861	0.11
862	0.09
863	0.08
864	0.08
865	0.09
866	0.12
867	0.11
868	0.12
869	0.17
870	0.19
871	0.25
872	0.26
873	0.26
874	0.3
875	0.35
876	0.39
877	0.41
878	0.48
879	0.43
880	0.45
881	0.45
882	0.42
883	0.43
884	0.37
885	0.32
886	0.26
887	0.28
888	0.28
889	0.29
890	0.29
891	0.29
892	0.3
893	0.3
894	0.34
895	0.4
896	0.47
897	0.52
898	0.52
899	0.53
900	0.54
901	0.53
902	0.48
903	0.4
904	0.32
905	0.32
906	0.31
907	0.29
908	0.31
909	0.33
910	0.32
911	0.33
912	0.34
913	0.31
914	0.3
915	0.27
916	0.25
917	0.28
918	0.36
919	0.38
920	0.34
921	0.34
922	0.4
923	0.48
924	0.49
925	0.43
926	0.37
927	0.39
928	0.49
929	0.51
930	0.45
931	0.45
932	0.52
933	0.56
934	0.56
935	0.51
936	0.46
937	0.46
938	0.48
939	0.45
940	0.41
941	0.44
942	0.47
943	0.47
944	0.44
945	0.4
946	0.4
947	0.37
948	0.38
949	0.35
950	0.38
951	0.4
952	0.41
953	0.47
954	0.48
955	0.48
956	0.48
957	0.47
958	0.45
959	0.44
960	0.41
961	0.37
962	0.34
963	0.3
964	0.25
965	0.21
966	0.17
967	0.15
968	0.16
969	0.15
970	0.15
971	0.15
972	0.17
973	0.17
974	0.17
975	0.16
976	0.15
977	0.15
978	0.14
979	0.14
980	0.14
981	0.14
982	0.13
983	0.12
984	0.16
985	0.16
986	0.17
987	0.18
988	0.18
989	0.21
990	0.22
991	0.23
992	0.25
993	0.27
994	0.28
995	0.3
996	0.34
997	0.33
998	0.34
999	0.37
1000	0.34
1001	0.38
1002	0.38
1003	0.36
1004	0.32
1005	0.32
1006	0.33
1007	0.3
1008	0.35
1009	0.28
1010	0.3
1011	0.36
1012	0.37
1013	0.38
1014	0.4
1015	0.44
1016	0.42
1017	0.47
1018	0.46
1019	0.47
1020	0.52
1021	0.56
1022	0.57
1023	0.54
1024	0.52
1025	0.52
1026	0.53
1027	0.44
1028	0.4
1029	0.34
1030	0.31
1031	0.28
1032	0.28
1033	0.22
1034	0.18
1035	0.19

W9VPD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer