Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q1EBC4

Protein Details
Accession Q1EBC4    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-37MGRVLQKKKNRSSAPKIKIKSGKSKSGKKKINVLGNSHydrophilic
171-195AAEEERVKKRKPRHQSKREEEWLQRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-30KKKNRSSAPKIKIKSGKSKSGKKK
176-187RVKKRKPRHQSK
224-235RRRLRKWHGNKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cim:CIMG_00139  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MGRVLQKKKNRSSAPKIKIKSGKSKSGKKKINVLGNSIIAQNWDKKLTLAQNYRRLGLATRLNAPTGGVEKGVSAGALNNISSLATKGKTAAQIQPSEARVERDPETGKILRIIQPDQAGDDGTIEVAGHKRRRTNPLDDPLNELSDVEDSTLRDTGASTDVVSALERQAAAEEERVKKRKPRHQSKREEEWLQRLVDKYGDDVPAMVRDRKLNPMQQTEGDIRRRLRKWHGNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.88
3 0.81
4 0.81
5 0.79
6 0.76
7 0.76
8 0.73
9 0.74
10 0.73
11 0.81
12 0.82
13 0.84
14 0.86
15 0.8
16 0.83
17 0.8
18 0.81
19 0.73
20 0.67
21 0.61
22 0.54
23 0.49
24 0.39
25 0.31
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.23
34 0.28
35 0.35
36 0.4
37 0.46
38 0.53
39 0.55
40 0.55
41 0.51
42 0.45
43 0.38
44 0.35
45 0.33
46 0.26
47 0.3
48 0.3
49 0.3
50 0.29
51 0.27
52 0.21
53 0.17
54 0.15
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.14
77 0.16
78 0.2
79 0.22
80 0.23
81 0.24
82 0.27
83 0.26
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.18
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.23
94 0.22
95 0.21
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.21
100 0.21
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.16
105 0.15
106 0.11
107 0.09
108 0.08
109 0.06
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.06
115 0.11
116 0.14
117 0.17
118 0.23
119 0.28
120 0.36
121 0.41
122 0.46
123 0.5
124 0.55
125 0.59
126 0.54
127 0.55
128 0.48
129 0.44
130 0.36
131 0.27
132 0.19
133 0.13
134 0.12
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.12
160 0.17
161 0.23
162 0.32
163 0.36
164 0.39
165 0.45
166 0.54
167 0.6
168 0.66
169 0.71
170 0.74
171 0.81
172 0.88
173 0.91
174 0.91
175 0.9
176 0.86
177 0.79
178 0.75
179 0.69
180 0.59
181 0.53
182 0.44
183 0.37
184 0.31
185 0.27
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.2
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.26
197 0.29
198 0.37
199 0.42
200 0.43
201 0.48
202 0.52
203 0.54
204 0.5
205 0.53
206 0.51
207 0.53
208 0.51
209 0.5
210 0.49
211 0.55
212 0.57
213 0.6
214 0.64
215 0.67