Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5B0I1

Protein Details
Accession Q5B0I1    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-232DSGNDSHRSHRHRRRSRSRSRSPRVEKDDRRHRDREHDRRSHRDRDBasic
258-301RAARRSASPRPDRRRDDRRDRDQDQDYRRDRNSRSSRRDARSSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-238RRREREQGRERHQERERERGHRHRRDSGNDSHRSHRHRRRSRSRSRSPRVEKDDRRHRDREHDRRSHRDRDGERENR
255-276RYDRAARRSASPRPDRRRDDRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ani:AN5949.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGDLNLKKSWHPSLLRNQERVWAEEKRALEERKRIDQLKRERDEERQIQELQRLQESAGGTRQLQRVDWMYQEPSSASGHYAEEMEGYLLGKRRIDGILLKNDESKKLEKGAATGPGAAAGLPPVVHNTRDTMAKVMADPLLEIRKREQAAYEAMVKESVRRREREQGRERHQERERERGHRHRRDSGNDSHRSHRHRRRSRSRSRSPRVEKDDRRHRDREHDRRSHRDRDGERENRVERVYHSSRRDHDRDERYDRAARRSASPRPDRRRDDRRDRDQDQDYRRDRNSRSSRRDARSSRDRDTDAFGRDRNRDRGSHSRNGNADANADQHAQELEEQRKRRLAEMQANAQDMEATRRQRVAEVTALEEKQREEDDKRRSDRGQFMSGLHRQLQEDSLDERIRRSRGALTKDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.63
3 0.7
4 0.68
5 0.63
6 0.63
7 0.6
8 0.55
9 0.49
10 0.44
11 0.4
12 0.41
13 0.41
14 0.39
15 0.44
16 0.47
17 0.49
18 0.52
19 0.55
20 0.58
21 0.65
22 0.65
23 0.66
24 0.7
25 0.73
26 0.76
27 0.75
28 0.7
29 0.66
30 0.67
31 0.69
32 0.68
33 0.61
34 0.56
35 0.54
36 0.52
37 0.54
38 0.52
39 0.45
40 0.39
41 0.34
42 0.29
43 0.29
44 0.27
45 0.24
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.26
50 0.29
51 0.26
52 0.26
53 0.27
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.16
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.21
85 0.25
86 0.33
87 0.35
88 0.36
89 0.39
90 0.4
91 0.41
92 0.38
93 0.34
94 0.28
95 0.29
96 0.31
97 0.26
98 0.28
99 0.28
100 0.29
101 0.27
102 0.24
103 0.2
104 0.17
105 0.17
106 0.14
107 0.1
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.05
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.23
134 0.23
135 0.24
136 0.23
137 0.19
138 0.22
139 0.23
140 0.25
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.18
145 0.2
146 0.24
147 0.31
148 0.31
149 0.34
150 0.38
151 0.48
152 0.56
153 0.62
154 0.66
155 0.67
156 0.7
157 0.78
158 0.75
159 0.74
160 0.71
161 0.69
162 0.63
163 0.63
164 0.6
165 0.58
166 0.64
167 0.65
168 0.71
169 0.71
170 0.73
171 0.72
172 0.72
173 0.7
174 0.69
175 0.67
176 0.65
177 0.64
178 0.61
179 0.59
180 0.59
181 0.59
182 0.63
183 0.63
184 0.65
185 0.67
186 0.76
187 0.8
188 0.85
189 0.9
190 0.9
191 0.92
192 0.92
193 0.9
194 0.9
195 0.87
196 0.85
197 0.83
198 0.83
199 0.8
200 0.79
201 0.81
202 0.78
203 0.77
204 0.73
205 0.66
206 0.67
207 0.7
208 0.71
209 0.7
210 0.72
211 0.71
212 0.76
213 0.8
214 0.78
215 0.71
216 0.69
217 0.61
218 0.6
219 0.64
220 0.6
221 0.56
222 0.54
223 0.51
224 0.45
225 0.43
226 0.35
227 0.27
228 0.3
229 0.33
230 0.34
231 0.37
232 0.39
233 0.44
234 0.51
235 0.52
236 0.49
237 0.53
238 0.54
239 0.57
240 0.59
241 0.57
242 0.53
243 0.56
244 0.53
245 0.5
246 0.47
247 0.41
248 0.4
249 0.44
250 0.46
251 0.5
252 0.57
253 0.62
254 0.66
255 0.74
256 0.75
257 0.79
258 0.82
259 0.83
260 0.84
261 0.84
262 0.86
263 0.85
264 0.81
265 0.8
266 0.77
267 0.75
268 0.71
269 0.7
270 0.64
271 0.61
272 0.61
273 0.61
274 0.55
275 0.58
276 0.61
277 0.62
278 0.67
279 0.7
280 0.77
281 0.75
282 0.83
283 0.77
284 0.75
285 0.75
286 0.73
287 0.69
288 0.65
289 0.61
290 0.52
291 0.54
292 0.5
293 0.44
294 0.41
295 0.38
296 0.38
297 0.42
298 0.47
299 0.48
300 0.47
301 0.44
302 0.48
303 0.56
304 0.58
305 0.6
306 0.57
307 0.56
308 0.55
309 0.57
310 0.54
311 0.43
312 0.37
313 0.3
314 0.28
315 0.23
316 0.22
317 0.17
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.14
322 0.19
323 0.25
324 0.32
325 0.35
326 0.38
327 0.43
328 0.44
329 0.43
330 0.45
331 0.46
332 0.48
333 0.52
334 0.57
335 0.56
336 0.56
337 0.52
338 0.44
339 0.36
340 0.27
341 0.26
342 0.23
343 0.22
344 0.23
345 0.26
346 0.27
347 0.29
348 0.31
349 0.3
350 0.3
351 0.28
352 0.3
353 0.33
354 0.34
355 0.32
356 0.31
357 0.27
358 0.24
359 0.26
360 0.26
361 0.27
362 0.35
363 0.44
364 0.52
365 0.57
366 0.61
367 0.62
368 0.65
369 0.68
370 0.66
371 0.62
372 0.55
373 0.53
374 0.55
375 0.55
376 0.51
377 0.45
378 0.41
379 0.37
380 0.36
381 0.36
382 0.29
383 0.27
384 0.25
385 0.27
386 0.29
387 0.29
388 0.31
389 0.35
390 0.36
391 0.35
392 0.36
393 0.39
394 0.43
395 0.5