Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9WW38

Protein Details
Accession W9WW38    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-338ISDGAAKIKRKKSKVDGGSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-332KIKRKKSK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.333, cyto 8.5, cyto_mito 5.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAENKDDLSDRAHFDPNWISYNGGYLHSNNVLFYFATSPFFDQVSGNQSLFTQWVGTPNQNEILGTRARFESNLRHQRGIQYVVEHDPLEEKATVEGPNGPENTNVWVIRKQNRENESDDSVTVLGYYYIVNNVIYQAPSVASILNNRLLNTVAALNKLFNAPTDMSLFSVSHGHTYYKPVKPSTRQALSGGAAPQSREGSVVPESRAPTGEKVAVSSQANVDGGSGARTAWEALRMTIAYGKEYSDDMPLVGEPGNFRFSKNKDAAATAGQAKATGPTSSPPIGAPGQSRAGSVAAPRSATAAAASGVARVGDRATPISDGAAKIKRKKSKVDGGSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.37
3 0.35
4 0.36
5 0.32
6 0.29
7 0.24
8 0.29
9 0.26
10 0.22
11 0.2
12 0.17
13 0.21
14 0.23
15 0.23
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.15
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.15
30 0.17
31 0.2
32 0.21
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.15
39 0.11
40 0.09
41 0.14
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.23
46 0.25
47 0.23
48 0.23
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.26
59 0.34
60 0.44
61 0.46
62 0.47
63 0.47
64 0.52
65 0.54
66 0.48
67 0.39
68 0.31
69 0.3
70 0.3
71 0.3
72 0.25
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.14
84 0.14
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.2
92 0.19
93 0.17
94 0.2
95 0.25
96 0.32
97 0.4
98 0.42
99 0.46
100 0.5
101 0.51
102 0.51
103 0.5
104 0.46
105 0.39
106 0.34
107 0.26
108 0.22
109 0.18
110 0.14
111 0.09
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.16
164 0.23
165 0.25
166 0.27
167 0.3
168 0.34
169 0.37
170 0.44
171 0.47
172 0.43
173 0.41
174 0.39
175 0.39
176 0.34
177 0.32
178 0.25
179 0.19
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.17
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.14
226 0.14
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.1
243 0.15
244 0.14
245 0.16
246 0.22
247 0.24
248 0.33
249 0.35
250 0.37
251 0.34
252 0.36
253 0.36
254 0.32
255 0.32
256 0.26
257 0.24
258 0.19
259 0.18
260 0.16
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.16
267 0.17
268 0.18
269 0.16
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.21
274 0.21
275 0.24
276 0.24
277 0.24
278 0.21
279 0.21
280 0.19
281 0.19
282 0.2
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.17
288 0.17
289 0.15
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.1
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.18
309 0.23
310 0.29
311 0.35
312 0.43
313 0.52
314 0.59
315 0.63
316 0.72
317 0.75
318 0.78