Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9WD16

Protein Details
Accession W9WD16    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-178NVADGHKRKNKRRRLLLKEEQELBasic
209-258AKEREATKREGKHRHRNDRDREADSDEDTDRRHRHRHRHRHPARDPHDRVBasic
294-359GGDRETSREREHRHRHHRTDSRERRSPGDRETSRDRRQRHHRTDSRERRSPPDRDRDRPSRRHDDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-169KRKNKRRR
207-227ERAKEREATKREGKHRHRNDR
239-253RRHRHRHRHRHPARD
281-355DRRQRRNDEGHRRGGDRETSREREHRHRHHRTDSRERRSPGDRETSRDRRQRHHRTDSRERRSPPDRDRDRPSRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNAIRQTQLLNKRELENATPPSASWHADYRDTAWIYIGGLLPDLTEGDVCIIFSQYGNPTHLNLIRDKETGKSKGFGFLKYEDQRSCDLAVDNLGGADVLGRLLRVDHTRYKRRDDEDEETYRVERLEALQEAEERMNASGKRGGGSGSDTEDEDNVADGHKRKNKRRRLLLKEEQELEDMLAPAQDGEEEDPMREYLIREKREEVERAKEREATKREGKHRHRNDRDREADSDEDTDRRHRHRHRHRHPARDPHDRVDTKAQRDTEHSEERRRDHRDDDDRRQRRNDEGHRRGGDRETSREREHRHRHHRTDSRERRSPGDRETSRDRRQRHHRTDSRERRSPPDRDRDRPSRRHDDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.44
3 0.43
4 0.43
5 0.41
6 0.37
7 0.34
8 0.35
9 0.34
10 0.31
11 0.26
12 0.27
13 0.28
14 0.31
15 0.32
16 0.3
17 0.35
18 0.34
19 0.32
20 0.26
21 0.23
22 0.2
23 0.21
24 0.19
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.1
42 0.13
43 0.15
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.24
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.29
52 0.29
53 0.3
54 0.29
55 0.3
56 0.34
57 0.37
58 0.36
59 0.35
60 0.32
61 0.39
62 0.4
63 0.37
64 0.34
65 0.31
66 0.38
67 0.4
68 0.44
69 0.37
70 0.37
71 0.37
72 0.35
73 0.33
74 0.25
75 0.21
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.07
92 0.1
93 0.14
94 0.23
95 0.32
96 0.42
97 0.46
98 0.53
99 0.58
100 0.6
101 0.63
102 0.62
103 0.59
104 0.57
105 0.57
106 0.51
107 0.45
108 0.41
109 0.34
110 0.26
111 0.2
112 0.13
113 0.1
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.11
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.09
147 0.16
148 0.22
149 0.3
150 0.39
151 0.49
152 0.59
153 0.67
154 0.76
155 0.8
156 0.83
157 0.86
158 0.85
159 0.83
160 0.77
161 0.69
162 0.59
163 0.49
164 0.39
165 0.29
166 0.2
167 0.12
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.14
185 0.22
186 0.24
187 0.25
188 0.27
189 0.31
190 0.35
191 0.39
192 0.34
193 0.36
194 0.41
195 0.43
196 0.42
197 0.44
198 0.41
199 0.46
200 0.47
201 0.44
202 0.45
203 0.49
204 0.56
205 0.61
206 0.69
207 0.71
208 0.78
209 0.82
210 0.85
211 0.88
212 0.88
213 0.87
214 0.84
215 0.76
216 0.68
217 0.61
218 0.52
219 0.43
220 0.37
221 0.28
222 0.23
223 0.21
224 0.24
225 0.24
226 0.28
227 0.36
228 0.42
229 0.52
230 0.62
231 0.72
232 0.76
233 0.83
234 0.87
235 0.89
236 0.89
237 0.89
238 0.86
239 0.86
240 0.79
241 0.73
242 0.74
243 0.64
244 0.59
245 0.59
246 0.58
247 0.51
248 0.53
249 0.49
250 0.41
251 0.45
252 0.47
253 0.43
254 0.46
255 0.46
256 0.49
257 0.52
258 0.56
259 0.6
260 0.61
261 0.57
262 0.53
263 0.59
264 0.61
265 0.65
266 0.71
267 0.73
268 0.75
269 0.78
270 0.78
271 0.71
272 0.68
273 0.69
274 0.69
275 0.69
276 0.69
277 0.73
278 0.71
279 0.7
280 0.64
281 0.59
282 0.56
283 0.5
284 0.51
285 0.49
286 0.51
287 0.55
288 0.59
289 0.61
290 0.64
291 0.7
292 0.72
293 0.75
294 0.8
295 0.83
296 0.87
297 0.89
298 0.88
299 0.89
300 0.89
301 0.87
302 0.86
303 0.8
304 0.76
305 0.74
306 0.7
307 0.66
308 0.66
309 0.59
310 0.57
311 0.65
312 0.68
313 0.7
314 0.72
315 0.7
316 0.7
317 0.78
318 0.83
319 0.83
320 0.84
321 0.83
322 0.85
323 0.9
324 0.91
325 0.9
326 0.88
327 0.82
328 0.8
329 0.8
330 0.8
331 0.79
332 0.79
333 0.78
334 0.78
335 0.83
336 0.85
337 0.86
338 0.86
339 0.85