Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9XHZ0

Protein Details
Accession W9XHZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
969-994RTISKEYKRYRETEKKCHRIARHAEDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFKFKHLVQLLEDLNRARKQAQSLSTRHSTPADEIIIKWFSRHESDIIRHGPSAVAFLSCMLLDRVPNRVYGLQEKSLASVLCKALFIENTSRGRQLHEWEVTGLDFATCLEKHVMALAENDPPPAHKEVTLEDIDAVLRQLAANSKFASPEMRRHRDGVKSEIPLRSILSRLHSREAKWFVRMIQRSYGPVQIPESLVLGCFHFLLPDILSLQNSIDEAVEVLGKPDLISIPHDPPSALQQEYRQECARHLTPKLGVMVKRLEYFKARSIRHCCQMANLRTMSVERKYDGWYCQIHIDKSKGKECIQIFSKRGKDSTKPFIRLHGALEAGLRLGDPACAITQNCIFEGEMLVWSRSRQAILPFEKIRKYTQYGGRTIGAGADSPRSSDEQLMIIFYDCLWHDNQNLVNEPHHVRRQRLEEIVSVTEGLAQLGDRREIRFGSESAKAELRKFFGYAIEQRWEGFVLKGCRDPYLSIGWHTNAIKLKKDYIKGLGDAADLCIIGGRKDPLEAEKYGGSLNWTTFYVACLQNKEVIQRFGTKPKFLILDILTRQTMSEGTFRELNQRGLGFCVPFSGSTEQMDVNIEQPGIMLLPPTVLFTKPFVVEVTGAAFTKPADVAYYALRFPRDIKLHFDRPLTETHSFEELQEMARESLTPVDSEEQEDVNWILRLTEADGKQNQCVDLHAAGTPSPSRVSTASVSTCMSSPLTASRVDHVGTHQPQPALSNYAVAVKPDATPSPKTASTCQSSPLALPANRAQRLDESAALPPPINHVLSPGKGVKRKHEESNLSTVANKRLRKNSFKRLVIPLQSSLQNKTYPVHPYEPPAVFRSPTKTIEQSPSTSPISQQRKPLRELNNVSTKRGLEKLTSTQAESGDHGEMGTAKTVDEHVRNKSSTSKMGNSTSTSHESQASAGSAHGLDLVILKVMSSSALSPQDIKSVNWVTVVYVQLVDSVSSKLVRNTTYETARTISKEYKRYRETEKKCHRIARHAEDPGYQLQPRQPQRRMILFYDEKIQSSFVSSSSDIILKRAGDVLRKRQARKYFAGALLMTAHEDTEDVVSRAIWDWRESVRLLSELRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.38
4 0.37
5 0.32
6 0.33
7 0.36
8 0.41
9 0.47
10 0.49
11 0.51
12 0.57
13 0.6
14 0.57
15 0.54
16 0.48
17 0.42
18 0.36
19 0.37
20 0.34
21 0.3
22 0.29
23 0.31
24 0.33
25 0.3
26 0.27
27 0.24
28 0.23
29 0.27
30 0.29
31 0.28
32 0.32
33 0.37
34 0.44
35 0.46
36 0.44
37 0.4
38 0.37
39 0.34
40 0.26
41 0.25
42 0.17
43 0.13
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.13
52 0.15
53 0.21
54 0.21
55 0.22
56 0.24
57 0.26
58 0.29
59 0.33
60 0.38
61 0.35
62 0.38
63 0.37
64 0.35
65 0.35
66 0.31
67 0.25
68 0.25
69 0.23
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.23
76 0.24
77 0.29
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.35
82 0.39
83 0.39
84 0.39
85 0.4
86 0.39
87 0.38
88 0.35
89 0.36
90 0.31
91 0.27
92 0.21
93 0.12
94 0.09
95 0.07
96 0.11
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.17
103 0.17
104 0.14
105 0.17
106 0.16
107 0.2
108 0.2
109 0.21
110 0.18
111 0.19
112 0.22
113 0.23
114 0.22
115 0.18
116 0.2
117 0.21
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.21
137 0.28
138 0.25
139 0.34
140 0.41
141 0.47
142 0.49
143 0.51
144 0.57
145 0.57
146 0.59
147 0.57
148 0.53
149 0.52
150 0.55
151 0.54
152 0.49
153 0.42
154 0.39
155 0.33
156 0.28
157 0.25
158 0.26
159 0.31
160 0.33
161 0.4
162 0.41
163 0.41
164 0.47
165 0.53
166 0.49
167 0.44
168 0.43
169 0.4
170 0.46
171 0.49
172 0.44
173 0.43
174 0.42
175 0.43
176 0.43
177 0.44
178 0.35
179 0.32
180 0.31
181 0.26
182 0.25
183 0.22
184 0.2
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.11
219 0.14
220 0.18
221 0.21
222 0.21
223 0.2
224 0.2
225 0.25
226 0.25
227 0.23
228 0.2
229 0.22
230 0.31
231 0.33
232 0.37
233 0.35
234 0.32
235 0.33
236 0.38
237 0.39
238 0.36
239 0.35
240 0.35
241 0.33
242 0.35
243 0.38
244 0.36
245 0.32
246 0.3
247 0.33
248 0.31
249 0.33
250 0.31
251 0.3
252 0.29
253 0.32
254 0.35
255 0.39
256 0.39
257 0.44
258 0.51
259 0.55
260 0.57
261 0.57
262 0.5
263 0.49
264 0.56
265 0.52
266 0.5
267 0.44
268 0.37
269 0.34
270 0.36
271 0.32
272 0.26
273 0.24
274 0.19
275 0.2
276 0.24
277 0.26
278 0.27
279 0.28
280 0.25
281 0.25
282 0.3
283 0.32
284 0.31
285 0.32
286 0.35
287 0.36
288 0.4
289 0.44
290 0.42
291 0.39
292 0.44
293 0.41
294 0.43
295 0.43
296 0.45
297 0.43
298 0.47
299 0.51
300 0.46
301 0.48
302 0.45
303 0.46
304 0.46
305 0.54
306 0.54
307 0.55
308 0.53
309 0.55
310 0.55
311 0.49
312 0.44
313 0.36
314 0.27
315 0.21
316 0.21
317 0.16
318 0.11
319 0.1
320 0.07
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.15
348 0.23
349 0.26
350 0.33
351 0.35
352 0.39
353 0.41
354 0.41
355 0.4
356 0.37
357 0.37
358 0.38
359 0.42
360 0.44
361 0.44
362 0.44
363 0.42
364 0.37
365 0.33
366 0.26
367 0.17
368 0.12
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.12
392 0.15
393 0.16
394 0.19
395 0.19
396 0.18
397 0.21
398 0.23
399 0.25
400 0.29
401 0.3
402 0.3
403 0.34
404 0.39
405 0.4
406 0.4
407 0.37
408 0.33
409 0.32
410 0.31
411 0.25
412 0.19
413 0.14
414 0.12
415 0.1
416 0.08
417 0.05
418 0.04
419 0.06
420 0.07
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.16
430 0.2
431 0.2
432 0.21
433 0.24
434 0.23
435 0.23
436 0.24
437 0.23
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.15
442 0.17
443 0.19
444 0.2
445 0.2
446 0.19
447 0.19
448 0.19
449 0.18
450 0.15
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.19
456 0.19
457 0.19
458 0.19
459 0.19
460 0.17
461 0.18
462 0.17
463 0.15
464 0.17
465 0.16
466 0.18
467 0.18
468 0.2
469 0.2
470 0.21
471 0.24
472 0.23
473 0.29
474 0.3
475 0.32
476 0.3
477 0.3
478 0.3
479 0.27
480 0.27
481 0.22
482 0.17
483 0.15
484 0.13
485 0.08
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.12
498 0.12
499 0.13
500 0.12
501 0.13
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.11
513 0.13
514 0.14
515 0.14
516 0.15
517 0.18
518 0.18
519 0.21
520 0.19
521 0.18
522 0.18
523 0.22
524 0.23
525 0.28
526 0.3
527 0.28
528 0.26
529 0.26
530 0.26
531 0.21
532 0.23
533 0.15
534 0.19
535 0.19
536 0.2
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.13
541 0.12
542 0.08
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.13
547 0.14
548 0.2
549 0.21
550 0.21
551 0.19
552 0.19
553 0.17
554 0.17
555 0.18
556 0.12
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.08
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.11
567 0.11
568 0.12
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.05
577 0.04
578 0.04
579 0.03
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.08
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.09
607 0.1
608 0.1
609 0.11
610 0.12
611 0.11
612 0.13
613 0.19
614 0.21
615 0.21
616 0.28
617 0.34
618 0.39
619 0.42
620 0.41
621 0.36
622 0.34
623 0.35
624 0.34
625 0.28
626 0.24
627 0.22
628 0.24
629 0.22
630 0.2
631 0.19
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.08
643 0.08
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.12
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.07
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.08
659 0.14
660 0.13
661 0.17
662 0.21
663 0.22
664 0.24
665 0.25
666 0.23
667 0.17
668 0.17
669 0.16
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.1
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.1
681 0.1
682 0.13
683 0.13
684 0.16
685 0.16
686 0.17
687 0.17
688 0.16
689 0.15
690 0.13
691 0.12
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.13
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.21
704 0.22
705 0.25
706 0.26
707 0.25
708 0.25
709 0.26
710 0.25
711 0.21
712 0.18
713 0.15
714 0.13
715 0.17
716 0.17
717 0.15
718 0.15
719 0.12
720 0.13
721 0.13
722 0.15
723 0.14
724 0.16
725 0.19
726 0.22
727 0.24
728 0.26
729 0.28
730 0.31
731 0.32
732 0.31
733 0.3
734 0.27
735 0.26
736 0.24
737 0.24
738 0.24
739 0.2
740 0.23
741 0.26
742 0.33
743 0.34
744 0.34
745 0.32
746 0.28
747 0.31
748 0.3
749 0.26
750 0.2
751 0.19
752 0.2
753 0.2
754 0.18
755 0.14
756 0.16
757 0.16
758 0.15
759 0.13
760 0.16
761 0.18
762 0.19
763 0.23
764 0.24
765 0.28
766 0.33
767 0.35
768 0.4
769 0.47
770 0.51
771 0.55
772 0.59
773 0.6
774 0.59
775 0.65
776 0.57
777 0.48
778 0.46
779 0.41
780 0.41
781 0.41
782 0.41
783 0.4
784 0.47
785 0.54
786 0.62
787 0.69
788 0.71
789 0.74
790 0.74
791 0.73
792 0.71
793 0.71
794 0.66
795 0.6
796 0.52
797 0.45
798 0.46
799 0.42
800 0.37
801 0.33
802 0.29
803 0.27
804 0.26
805 0.27
806 0.27
807 0.29
808 0.31
809 0.29
810 0.32
811 0.38
812 0.39
813 0.37
814 0.36
815 0.33
816 0.3
817 0.31
818 0.32
819 0.3
820 0.31
821 0.33
822 0.33
823 0.36
824 0.42
825 0.43
826 0.4
827 0.38
828 0.39
829 0.37
830 0.34
831 0.33
832 0.35
833 0.4
834 0.41
835 0.48
836 0.52
837 0.55
838 0.59
839 0.64
840 0.63
841 0.64
842 0.67
843 0.66
844 0.67
845 0.63
846 0.61
847 0.56
848 0.49
849 0.42
850 0.39
851 0.33
852 0.25
853 0.29
854 0.32
855 0.37
856 0.37
857 0.35
858 0.33
859 0.32
860 0.3
861 0.27
862 0.23
863 0.16
864 0.15
865 0.13
866 0.11
867 0.11
868 0.11
869 0.11
870 0.09
871 0.08
872 0.09
873 0.11
874 0.15
875 0.2
876 0.24
877 0.29
878 0.34
879 0.35
880 0.36
881 0.41
882 0.41
883 0.43
884 0.44
885 0.43
886 0.43
887 0.47
888 0.48
889 0.43
890 0.42
891 0.4
892 0.39
893 0.35
894 0.31
895 0.29
896 0.26
897 0.24
898 0.23
899 0.18
900 0.14
901 0.12
902 0.12
903 0.1
904 0.09
905 0.09
906 0.07
907 0.06
908 0.07
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.05
914 0.06
915 0.06
916 0.05
917 0.06
918 0.1
919 0.13
920 0.14
921 0.16
922 0.17
923 0.23
924 0.23
925 0.23
926 0.26
927 0.26
928 0.26
929 0.25
930 0.25
931 0.2
932 0.23
933 0.23
934 0.16
935 0.14
936 0.13
937 0.14
938 0.14
939 0.13
940 0.1
941 0.1
942 0.11
943 0.12
944 0.14
945 0.16
946 0.19
947 0.2
948 0.22
949 0.28
950 0.33
951 0.36
952 0.36
953 0.35
954 0.34
955 0.36
956 0.34
957 0.33
958 0.36
959 0.38
960 0.46
961 0.52
962 0.6
963 0.63
964 0.66
965 0.72
966 0.74
967 0.76
968 0.77
969 0.8
970 0.8
971 0.82
972 0.86
973 0.81
974 0.8
975 0.81
976 0.79
977 0.77
978 0.74
979 0.68
980 0.61
981 0.59
982 0.53
983 0.47
984 0.39
985 0.33
986 0.33
987 0.4
988 0.48
989 0.55
990 0.56
991 0.6
992 0.67
993 0.72
994 0.72
995 0.66
996 0.66
997 0.6
998 0.56
999 0.56
1000 0.5
1001 0.42
1002 0.37
1003 0.34
1004 0.24
1005 0.24
1006 0.23
1007 0.15
1008 0.19
1009 0.18
1010 0.18
1011 0.19
1012 0.23
1013 0.19
1014 0.2
1015 0.22
1016 0.17
1017 0.18
1018 0.22
1019 0.22
1020 0.27
1021 0.35
1022 0.44
1023 0.51
1024 0.59
1025 0.63
1026 0.67
1027 0.74
1028 0.73
1029 0.71
1030 0.69
1031 0.68
1032 0.62
1033 0.62
1034 0.53
1035 0.45
1036 0.39
1037 0.33
1038 0.26
1039 0.17
1040 0.14
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.1
1045 0.12
1046 0.11
1047 0.12
1048 0.12
1049 0.13
1050 0.15
1051 0.19
1052 0.17
1053 0.17
1054 0.2
1055 0.22
1056 0.26
1057 0.26
1058 0.26
1059 0.25
1060 0.27