FuNGI

W9XFN1

Protein Details

Accession

W9XFN1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-38	PPMVRRKKPASDPFFKGPRN	Hydrophilic
203-223	PSQNTGKKLNFKKKTQQVFRP	Hydrophilic
422-444	EAEARKKNFRHMRKALERRERNY	Basic
532-555	GTDVSTRKKKIKSRHLPSSQPTPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-26	RRKK
144-172	PVRLHRRDPRAPPPGQEKEKKEEEKPEPK
419-440	EKREAEARKKNFRHMRKALERR
496-501	RKEKRG
539-543	KKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGSAPSSVPATRPPGAPPMVRRKKPASDPFFKGPRNNPAGTKPQLNGHLTPPVNVNGHLPPKPQSLNALPPRPSSPSKAVIPDRERVSGFSDPRVAAEGISYTDYKLVTTKRDLLNSLRYHILQLAGDKPIDIRNEAEFPKPVRLHRRDPRAPPPGQEKEKKEEEKPEPKDGLTAAEREDLTRRKEARQKEREANLAQIAPSQNTGKKLNFKKKTQQVFRPDFSAEQKRRIQTNYEEKLPWHLEDFENKHCFIGHHQIGSVSSNAALIYEPSVDASTGKFRLIPIEKVYQFKPKREDLQKMSIEEVEAAMKKGGSDPEWLIRHREARIQEALKERAAKESRALFSGAARTTVDAGRTGEEADLDYEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKLAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEAREKREAEARKKNFRHMRKALERRERNYNHGSDSEYESSTDSEEERERIERERLANVKKEEEAEAKKSALSSGANTPSGRKEKRGSDREDEGGMKKSTSSRSLKRPGSPNLSDASGTDVSTRKKKIKSRHLPSSQPTPGHSRPMSPVNVLPSSSAPQTLDPLAALKGRKRGGATSPVGAGSDTDTDAAGMSDSSRARRLNLKMSASPPSTGAPGTASPQGQPSSRAASPTPVSAPGSAPRPVAFPSAQDIKNAIPPQGITIRDLMKVVAHPKDKQKDFVALVKEVASYDKERGVLLPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.35
4	0.39
5	0.43
6	0.46
7	0.51
8	0.59
9	0.62
10	0.67
11	0.67
12	0.72
13	0.77
14	0.79
15	0.77
16	0.75
17	0.78
18	0.79
19	0.8
20	0.76
21	0.73
22	0.7
23	0.71
24	0.69
25	0.65
26	0.6
27	0.58
28	0.62
29	0.59
30	0.57
31	0.49
32	0.48
33	0.52
34	0.52
35	0.48
36	0.42
37	0.46
38	0.41
39	0.4
40	0.37
41	0.34
42	0.31
43	0.29
44	0.29
45	0.27
46	0.34
47	0.35
48	0.34
49	0.34
50	0.39
51	0.41
52	0.39
53	0.39
54	0.38
55	0.45
56	0.52
57	0.55
58	0.51
59	0.52
60	0.54
61	0.54
62	0.51
63	0.48
64	0.45
65	0.44
66	0.46
67	0.51
68	0.54
69	0.58
70	0.58
71	0.58
72	0.56
73	0.53
74	0.49
75	0.43
76	0.42
77	0.39
78	0.37
79	0.34
80	0.35
81	0.31
82	0.31
83	0.33
84	0.27
85	0.2
86	0.19
87	0.16
88	0.12
89	0.15
90	0.14
91	0.11
92	0.13
93	0.13
94	0.12
95	0.16
96	0.17
97	0.2
98	0.25
99	0.32
100	0.35
101	0.38
102	0.41
103	0.41
104	0.47
105	0.45
106	0.43
107	0.39
108	0.34
109	0.33
110	0.31
111	0.28
112	0.19
113	0.2
114	0.19
115	0.18
116	0.18
117	0.17
118	0.17
119	0.19
120	0.19
121	0.17
122	0.16
123	0.18
124	0.23
125	0.25
126	0.26
127	0.27
128	0.27
129	0.35
130	0.36
131	0.4
132	0.46
133	0.51
134	0.58
135	0.63
136	0.72
137	0.72
138	0.77
139	0.8
140	0.78
141	0.74
142	0.69
143	0.7
144	0.69
145	0.69
146	0.69
147	0.65
148	0.63
149	0.7
150	0.69
151	0.64
152	0.64
153	0.66
154	0.68
155	0.68
156	0.68
157	0.61
158	0.56
159	0.53
160	0.43
161	0.39
162	0.3
163	0.26
164	0.19
165	0.21
166	0.21
167	0.2
168	0.25
169	0.25
170	0.27
171	0.34
172	0.35
173	0.39
174	0.46
175	0.55
176	0.61
177	0.65
178	0.7
179	0.71
180	0.73
181	0.72
182	0.66
183	0.6
184	0.51
185	0.43
186	0.34
187	0.29
188	0.25
189	0.19
190	0.19
191	0.19
192	0.18
193	0.21
194	0.25
195	0.25
196	0.34
197	0.43
198	0.52
199	0.57
200	0.62
201	0.68
202	0.74
203	0.81
204	0.8
205	0.79
206	0.79
207	0.78
208	0.73
209	0.66
210	0.58
211	0.5
212	0.48
213	0.5
214	0.42
215	0.42
216	0.46
217	0.47
218	0.49
219	0.48
220	0.46
221	0.45
222	0.53
223	0.5
224	0.48
225	0.45
226	0.42
227	0.46
228	0.43
229	0.34
230	0.25
231	0.23
232	0.2
233	0.27
234	0.31
235	0.31
236	0.32
237	0.32
238	0.3
239	0.28
240	0.27
241	0.24
242	0.29
243	0.24
244	0.22
245	0.22
246	0.23
247	0.23
248	0.23
249	0.2
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.17
271	0.2
272	0.22
273	0.22
274	0.29
275	0.31
276	0.33
277	0.35
278	0.38
279	0.38
280	0.41
281	0.42
282	0.39
283	0.47
284	0.51
285	0.57
286	0.52
287	0.58
288	0.56
289	0.52
290	0.48
291	0.39
292	0.33
293	0.25
294	0.19
295	0.12
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.09
303	0.08
304	0.11
305	0.11
306	0.18
307	0.2
308	0.21
309	0.23
310	0.24
311	0.26
312	0.24
313	0.28
314	0.23
315	0.25
316	0.3
317	0.27
318	0.29
319	0.32
320	0.32
321	0.29
322	0.31
323	0.27
324	0.29
325	0.3
326	0.26
327	0.24
328	0.28
329	0.27
330	0.25
331	0.25
332	0.17
333	0.17
334	0.2
335	0.17
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.11
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.04
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.08
375	0.09
376	0.15
377	0.18
378	0.17
379	0.2
380	0.26
381	0.28
382	0.28
383	0.35
384	0.35
385	0.36
386	0.38
387	0.35
388	0.3
389	0.28
390	0.26
391	0.23
392	0.16
393	0.13
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.16
398	0.18
399	0.14
400	0.19
401	0.19
402	0.19
403	0.22
404	0.22
405	0.23
406	0.22
407	0.22
408	0.24
409	0.31
410	0.36
411	0.43
412	0.5
413	0.58
414	0.6
415	0.69
416	0.71
417	0.72
418	0.73
419	0.7
420	0.73
421	0.73
422	0.81
423	0.81
424	0.82
425	0.81
426	0.74
427	0.78
428	0.7
429	0.66
430	0.63
431	0.55
432	0.47
433	0.41
434	0.39
435	0.31
436	0.33
437	0.28
438	0.22
439	0.2
440	0.18
441	0.17
442	0.16
443	0.14
444	0.09
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.14
450	0.15
451	0.18
452	0.21
453	0.22
454	0.23
455	0.29
456	0.34
457	0.36
458	0.42
459	0.4
460	0.4
461	0.37
462	0.36
463	0.32
464	0.32
465	0.32
466	0.29
467	0.28
468	0.26
469	0.25
470	0.24
471	0.21
472	0.17
473	0.14
474	0.13
475	0.17
476	0.19
477	0.21
478	0.21
479	0.23
480	0.28
481	0.36
482	0.35
483	0.34
484	0.37
485	0.44
486	0.55
487	0.61
488	0.61
489	0.59
490	0.62
491	0.59
492	0.56
493	0.49
494	0.41
495	0.38
496	0.31
497	0.25
498	0.22
499	0.24
500	0.24
501	0.3
502	0.35
503	0.36
504	0.45
505	0.55
506	0.59
507	0.63
508	0.67
509	0.67
510	0.68
511	0.63
512	0.56
513	0.48
514	0.44
515	0.37
516	0.29
517	0.27
518	0.19
519	0.17
520	0.17
521	0.19
522	0.22
523	0.29
524	0.34
525	0.36
526	0.43
527	0.51
528	0.59
529	0.66
530	0.73
531	0.76
532	0.82
533	0.83
534	0.83
535	0.81
536	0.8
537	0.74
538	0.65
539	0.58
540	0.55
541	0.5
542	0.5
543	0.46
544	0.38
545	0.37
546	0.42
547	0.41
548	0.35
549	0.35
550	0.32
551	0.32
552	0.3
553	0.26
554	0.22
555	0.22
556	0.21
557	0.2
558	0.15
559	0.15
560	0.17
561	0.16
562	0.15
563	0.12
564	0.13
565	0.13
566	0.15
567	0.17
568	0.18
569	0.25
570	0.26
571	0.29
572	0.3
573	0.32
574	0.35
575	0.41
576	0.4
577	0.35
578	0.35
579	0.32
580	0.3
581	0.26
582	0.21
583	0.14
584	0.12
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.08
589	0.09
590	0.08
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.09
595	0.11
596	0.13
597	0.18
598	0.19
599	0.22
600	0.3
601	0.35
602	0.4
603	0.46
604	0.5
605	0.5
606	0.52
607	0.57
608	0.51
609	0.46
610	0.38
611	0.32
612	0.28
613	0.23
614	0.2
615	0.15
616	0.14
617	0.16
618	0.19
619	0.18
620	0.18
621	0.22
622	0.24
623	0.22
624	0.24
625	0.25
626	0.27
627	0.27
628	0.29
629	0.26
630	0.3
631	0.31
632	0.31
633	0.3
634	0.27
635	0.27
636	0.26
637	0.27
638	0.25
639	0.28
640	0.27
641	0.26
642	0.24
643	0.24
644	0.24
645	0.27
646	0.23
647	0.2
648	0.25
649	0.32
650	0.31
651	0.31
652	0.31
653	0.28
654	0.36
655	0.35
656	0.3
657	0.24
658	0.23
659	0.27
660	0.31
661	0.3
662	0.23
663	0.27
664	0.28
665	0.27
666	0.27
667	0.23
668	0.19
669	0.23
670	0.27
671	0.31
672	0.34
673	0.39
674	0.49
675	0.59
676	0.6
677	0.61
678	0.59
679	0.59
680	0.58
681	0.59
682	0.54
683	0.46
684	0.43
685	0.38
686	0.34
687	0.27
688	0.25
689	0.22
690	0.19
691	0.21
692	0.23
693	0.22
694	0.22

W9XFN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer