Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9VS70

Protein Details
Accession W9VS70    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-479SPTHKNRRLISGRARSRRDVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12372  RRM_CFIm68_CFIm59  
Amino Acid Sequences MASADEDNFDIDIYGDGEVDMGNDGTVDYKPDDDNVQLNAGAAEDISLAEETHANSESEDRQPTSSATTPWVKGKAEDVQSNHTNAVPSKTIPQQGTKRKETSDERPIDHGATNALMISDLHWWTTEDDIRGWANEAGAEDELRELTFSEHKVNGKSKGQVYLEFSSPQAANAAKHKIDSLAGNQPGSRKHSVVYTSATQNPFKTLPKDAPARAREERPIRGGSFNSGPRNDASYGMSNQGFRGGRGGGFNRGSYNPHNQYNRNFSGPMGGYNNSQNMGFQSNMGMGSNYGGFNRGGMMGNPMRGAMGGMRGGRGGMNNMMPMGGGMGMGNMGMNPMMAGMGMGGTSDVNDCPLKLSLSDVDDAFQVFRETSLIPECSTLVQGRILAVAIGINMERNASDRSSGVAAPQYSTKKKLTGLMRQELTQSIVDQCQHSVQLDALQDWLRICVLDARQASLPWSPTHKNRRLISGRARSRRDVSTPRSFGANFSSDCSMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.07
13 0.07
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.13
18 0.15
19 0.17
20 0.18
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.18
25 0.18
26 0.16
27 0.14
28 0.12
29 0.08
30 0.07
31 0.05
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.18
45 0.22
46 0.25
47 0.24
48 0.24
49 0.25
50 0.26
51 0.28
52 0.28
53 0.24
54 0.26
55 0.3
56 0.31
57 0.35
58 0.39
59 0.34
60 0.32
61 0.35
62 0.37
63 0.37
64 0.4
65 0.38
66 0.41
67 0.43
68 0.44
69 0.4
70 0.33
71 0.3
72 0.26
73 0.27
74 0.21
75 0.2
76 0.23
77 0.28
78 0.33
79 0.33
80 0.4
81 0.45
82 0.54
83 0.61
84 0.63
85 0.62
86 0.58
87 0.63
88 0.62
89 0.61
90 0.61
91 0.59
92 0.54
93 0.54
94 0.54
95 0.47
96 0.41
97 0.32
98 0.23
99 0.17
100 0.14
101 0.11
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.15
113 0.17
114 0.14
115 0.15
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.14
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.15
137 0.18
138 0.21
139 0.25
140 0.29
141 0.33
142 0.34
143 0.38
144 0.36
145 0.4
146 0.39
147 0.37
148 0.39
149 0.36
150 0.33
151 0.29
152 0.27
153 0.23
154 0.21
155 0.18
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.16
160 0.21
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.17
168 0.2
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.25
174 0.29
175 0.27
176 0.2
177 0.19
178 0.23
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.23
183 0.24
184 0.28
185 0.3
186 0.28
187 0.26
188 0.27
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.22
193 0.23
194 0.27
195 0.32
196 0.32
197 0.38
198 0.37
199 0.41
200 0.42
201 0.41
202 0.43
203 0.43
204 0.42
205 0.38
206 0.38
207 0.33
208 0.32
209 0.3
210 0.26
211 0.26
212 0.27
213 0.27
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.25
218 0.23
219 0.19
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.15
226 0.14
227 0.18
228 0.16
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.26
243 0.25
244 0.31
245 0.34
246 0.36
247 0.39
248 0.45
249 0.44
250 0.38
251 0.34
252 0.28
253 0.29
254 0.26
255 0.23
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.09
265 0.11
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.06
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.02
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.03
332 0.02
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.14
346 0.16
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.15
366 0.14
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.08
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.13
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.23
396 0.28
397 0.29
398 0.34
399 0.35
400 0.34
401 0.36
402 0.42
403 0.45
404 0.48
405 0.53
406 0.57
407 0.56
408 0.54
409 0.53
410 0.47
411 0.41
412 0.32
413 0.24
414 0.18
415 0.19
416 0.2
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.19
421 0.18
422 0.17
423 0.14
424 0.17
425 0.17
426 0.16
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.17
432 0.13
433 0.11
434 0.12
435 0.15
436 0.16
437 0.22
438 0.23
439 0.25
440 0.26
441 0.27
442 0.28
443 0.26
444 0.27
445 0.23
446 0.29
447 0.32
448 0.41
449 0.52
450 0.58
451 0.63
452 0.64
453 0.71
454 0.71
455 0.74
456 0.75
457 0.75
458 0.77
459 0.78
460 0.8
461 0.76
462 0.74
463 0.72
464 0.7
465 0.69
466 0.67
467 0.68
468 0.66
469 0.61
470 0.61
471 0.54
472 0.47
473 0.44
474 0.41
475 0.31
476 0.31