Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9X1N0

Protein Details
Accession W9X1N0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29SPELDKSPPVKRQNRSDSEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSRKRHNTSSPELDKSPPVKRQNRSDSEEEESDEVPYVNQFSGQFGAFPGLGEDQGELFFGPADNGMDYLRMVRSEAKGVPPVMTAQIPSAPVDELEEGEEIEEGGYYYNGAYTANHQIVTTVEAEPPLPPAQIEYYSSLLAQFRLVRATLRCQPPLPAVEALRPSQFISFPENTRKVRAQWESHILSTDPHPVQVACMDAETVVELVKFLAAKLEKMLRTRDLARIARIGAWAWAILGKCRNREESSNEEVGDIRELAQTALRLQQMRDDGHRTEGEDQDEEGDNEIPGEGQDTGANDIPEKRPNLEATDEEAEPVESDGDLGRQKCVSVILDMIVTIAGEVYGQRDLLDLRSRWTEDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.59
3 0.58
4 0.56
5 0.59
6 0.63
7 0.68
8 0.76
9 0.79
10 0.81
11 0.79
12 0.76
13 0.7
14 0.68
15 0.62
16 0.53
17 0.45
18 0.37
19 0.31
20 0.25
21 0.2
22 0.14
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.12
27 0.11
28 0.12
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.13
61 0.15
62 0.19
63 0.21
64 0.23
65 0.26
66 0.26
67 0.26
68 0.22
69 0.22
70 0.19
71 0.18
72 0.15
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.08
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.15
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.17
137 0.23
138 0.26
139 0.27
140 0.27
141 0.28
142 0.29
143 0.29
144 0.26
145 0.21
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.2
150 0.17
151 0.17
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.19
159 0.25
160 0.3
161 0.3
162 0.33
163 0.33
164 0.3
165 0.35
166 0.38
167 0.34
168 0.32
169 0.38
170 0.36
171 0.34
172 0.33
173 0.25
174 0.21
175 0.19
176 0.22
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.11
202 0.16
203 0.17
204 0.2
205 0.23
206 0.21
207 0.24
208 0.26
209 0.29
210 0.32
211 0.32
212 0.31
213 0.3
214 0.29
215 0.26
216 0.24
217 0.2
218 0.12
219 0.11
220 0.09
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.15
226 0.18
227 0.22
228 0.25
229 0.3
230 0.3
231 0.34
232 0.38
233 0.39
234 0.42
235 0.4
236 0.38
237 0.33
238 0.31
239 0.27
240 0.22
241 0.15
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.2
254 0.23
255 0.25
256 0.28
257 0.28
258 0.26
259 0.3
260 0.31
261 0.28
262 0.28
263 0.29
264 0.28
265 0.24
266 0.23
267 0.21
268 0.22
269 0.2
270 0.17
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.17
287 0.2
288 0.24
289 0.25
290 0.25
291 0.27
292 0.29
293 0.31
294 0.32
295 0.3
296 0.31
297 0.32
298 0.3
299 0.27
300 0.25
301 0.21
302 0.17
303 0.16
304 0.1
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.1
309 0.14
310 0.14
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.18
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.1
324 0.08
325 0.06
326 0.05
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.1
336 0.15
337 0.23
338 0.21
339 0.25
340 0.31