Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9WTA8

Protein Details
Accession W9WTA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-447KRRKEIEDKRARNEQRRNHANEAREARAAKRRRSS
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLTRKYPKIITPVIEEQPYQIDGVKYPVDTTKPNPNGEEMYNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRQQQRDRDEDEEEETVDDVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAQLKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPAYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVELRDAKAKTCRICGQQGHYAENCRGDAKIKAGEFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLGAEMFVPGQTFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIKEDGIDKLIAIWRDNIPIMGGYLTCDGKVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEIEDKRARNEQRRNHANEAREARAAKRRRSSPDYSKGSRPDARVPTGPQETFEATNFPVLDYNSIVNRAAVDKSLASNKSAAAVLKEQMLARKAAETPTKNGTHGANGTPSSSGGSPSSILGKRKAAIMEAESESDVTPASAVSKRKGALMEEESDSVGTPGRNTPIEKKTYDNGDPNNPPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFHVDPKDIGFRHKVAEAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIDKNAVKFDKGTPFRPYEQLMGVLPASSNHAIPSAFHPLMTDPESDIVDFYPEQFDLDLNGAKQSWKAIVLLPFIDEKRLLAAMATKYHLLTDDEHARNERGHDALIISDQNPLYDILAMKFYSKKAKGGPNTVKLSMQKSQLAGEVTKNEDFLPHMDLVGPQEDIRLEPEVDDDRSLNVHFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPPPVLDKSDLAILRSKARTSGRDFGGAPLYDNTRRDRLDTQNRGGRINYAVDRPPFDAGPPGVPPPSHWPPGMPPPPPPGYGGQSGYNRNPPPTNGYGGHGSHTAQGYGGQDQGYYGNQGQAQYYGGQAPNQYHGSNGQYQQNGGRSFSDGYYQGQNRGPPARDNRSGNYGGGGYGQGGYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.61
6 0.59
7 0.59
8 0.58
9 0.52
10 0.46
11 0.39
12 0.36
13 0.33
14 0.26
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.21
19 0.21
20 0.18
21 0.19
22 0.23
23 0.24
24 0.27
25 0.31
26 0.38
27 0.42
28 0.45
29 0.45
30 0.44
31 0.45
32 0.42
33 0.43
34 0.35
35 0.32
36 0.29
37 0.27
38 0.24
39 0.19
40 0.18
41 0.13
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.13
48 0.15
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.37
53 0.46
54 0.53
55 0.6
56 0.59
57 0.6
58 0.59
59 0.6
60 0.51
61 0.44
62 0.38
63 0.32
64 0.3
65 0.24
66 0.19
67 0.14
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.13
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.47
80 0.46
81 0.47
82 0.46
83 0.45
84 0.39
85 0.31
86 0.29
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.37
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.82
105 0.8
106 0.77
107 0.79
108 0.79
109 0.75
110 0.76
111 0.69
112 0.62
113 0.67
114 0.63
115 0.56
116 0.53
117 0.47
118 0.42
119 0.43
120 0.41
121 0.31
122 0.3
123 0.36
124 0.37
125 0.46
126 0.48
127 0.48
128 0.51
129 0.58
130 0.62
131 0.56
132 0.51
133 0.46
134 0.43
135 0.41
136 0.42
137 0.34
138 0.29
139 0.25
140 0.21
141 0.17
142 0.14
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.15
150 0.2
151 0.23
152 0.26
153 0.31
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.3
158 0.25
159 0.21
160 0.17
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.18
173 0.25
174 0.28
175 0.33
176 0.35
177 0.42
178 0.41
179 0.42
180 0.4
181 0.38
182 0.38
183 0.34
184 0.29
185 0.24
186 0.25
187 0.22
188 0.21
189 0.16
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.24
207 0.3
208 0.31
209 0.33
210 0.36
211 0.39
212 0.4
213 0.37
214 0.4
215 0.37
216 0.4
217 0.41
218 0.42
219 0.42
220 0.4
221 0.38
222 0.3
223 0.26
224 0.21
225 0.21
226 0.16
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.23
248 0.25
249 0.23
250 0.28
251 0.28
252 0.25
253 0.29
254 0.28
255 0.26
256 0.31
257 0.35
258 0.31
259 0.36
260 0.41
261 0.39
262 0.47
263 0.48
264 0.47
265 0.49
266 0.49
267 0.48
268 0.44
269 0.42
270 0.36
271 0.34
272 0.29
273 0.22
274 0.2
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.21
279 0.19
280 0.2
281 0.21
282 0.25
283 0.23
284 0.24
285 0.22
286 0.17
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.15
291 0.18
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.17
327 0.15
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.1
356 0.07
357 0.08
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.07
394 0.08
395 0.12
396 0.14
397 0.21
398 0.26
399 0.26
400 0.33
401 0.37
402 0.39
403 0.44
404 0.51
405 0.54
406 0.6
407 0.65
408 0.63
409 0.7
410 0.72
411 0.72
412 0.72
413 0.69
414 0.68
415 0.71
416 0.73
417 0.71
418 0.7
419 0.63
420 0.61
421 0.58
422 0.49
423 0.43
424 0.37
425 0.33
426 0.37
427 0.41
428 0.4
429 0.43
430 0.47
431 0.52
432 0.58
433 0.63
434 0.64
435 0.68
436 0.69
437 0.65
438 0.64
439 0.6
440 0.59
441 0.56
442 0.49
443 0.47
444 0.43
445 0.43
446 0.4
447 0.38
448 0.38
449 0.37
450 0.34
451 0.27
452 0.25
453 0.23
454 0.22
455 0.2
456 0.16
457 0.11
458 0.13
459 0.12
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.13
478 0.13
479 0.12
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.1
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.13
498 0.19
499 0.18
500 0.2
501 0.25
502 0.26
503 0.25
504 0.26
505 0.23
506 0.2
507 0.2
508 0.17
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.12
513 0.11
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.12
522 0.14
523 0.15
524 0.16
525 0.18
526 0.18
527 0.19
528 0.19
529 0.15
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.13
534 0.13
535 0.11
536 0.11
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.05
541 0.04
542 0.03
543 0.06
544 0.09
545 0.1
546 0.12
547 0.15
548 0.15
549 0.17
550 0.18
551 0.17
552 0.18
553 0.19
554 0.2
555 0.19
556 0.19
557 0.17
558 0.16
559 0.15
560 0.1
561 0.09
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.09
566 0.11
567 0.12
568 0.19
569 0.23
570 0.27
571 0.28
572 0.3
573 0.31
574 0.35
575 0.37
576 0.35
577 0.32
578 0.35
579 0.37
580 0.36
581 0.38
582 0.32
583 0.29
584 0.26
585 0.27
586 0.21
587 0.2
588 0.2
589 0.18
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.16
594 0.18
595 0.16
596 0.14
597 0.12
598 0.14
599 0.14
600 0.15
601 0.14
602 0.15
603 0.16
604 0.22
605 0.25
606 0.27
607 0.27
608 0.28
609 0.36
610 0.33
611 0.35
612 0.31
613 0.28
614 0.26
615 0.27
616 0.24
617 0.15
618 0.17
619 0.14
620 0.14
621 0.13
622 0.11
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.06
627 0.05
628 0.03
629 0.03
630 0.04
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.09
637 0.14
638 0.17
639 0.16
640 0.19
641 0.21
642 0.25
643 0.28
644 0.3
645 0.28
646 0.24
647 0.24
648 0.21
649 0.2
650 0.15
651 0.12
652 0.1
653 0.07
654 0.09
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.11
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.1
663 0.1
664 0.14
665 0.23
666 0.25
667 0.28
668 0.33
669 0.36
670 0.38
671 0.4
672 0.38
673 0.3
674 0.28
675 0.25
676 0.21
677 0.18
678 0.15
679 0.12
680 0.1
681 0.08
682 0.1
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.1
689 0.13
690 0.18
691 0.17
692 0.17
693 0.17
694 0.17
695 0.2
696 0.21
697 0.18
698 0.11
699 0.12
700 0.13
701 0.12
702 0.12
703 0.09
704 0.09
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.07
713 0.09
714 0.1
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.09
722 0.09
723 0.1
724 0.12
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.16
729 0.18
730 0.17
731 0.17
732 0.14
733 0.11
734 0.11
735 0.11
736 0.1
737 0.08
738 0.12
739 0.13
740 0.15
741 0.16
742 0.15
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.13
747 0.13
748 0.17
749 0.25
750 0.26
751 0.27
752 0.29
753 0.29
754 0.28
755 0.28
756 0.25
757 0.16
758 0.15
759 0.14
760 0.13
761 0.12
762 0.13
763 0.12
764 0.1
765 0.13
766 0.12
767 0.11
768 0.12
769 0.12
770 0.1
771 0.11
772 0.11
773 0.09
774 0.11
775 0.11
776 0.12
777 0.14
778 0.16
779 0.24
780 0.25
781 0.28
782 0.33
783 0.42
784 0.46
785 0.55
786 0.61
787 0.61
788 0.64
789 0.61
790 0.58
791 0.52
792 0.51
793 0.45
794 0.4
795 0.34
796 0.3
797 0.3
798 0.29
799 0.28
800 0.24
801 0.23
802 0.22
803 0.23
804 0.22
805 0.21
806 0.18
807 0.17
808 0.17
809 0.16
810 0.16
811 0.13
812 0.12
813 0.12
814 0.13
815 0.14
816 0.14
817 0.13
818 0.09
819 0.1
820 0.1
821 0.1
822 0.12
823 0.12
824 0.11
825 0.11
826 0.14
827 0.16
828 0.16
829 0.17
830 0.15
831 0.14
832 0.15
833 0.15
834 0.13
835 0.11
836 0.12
837 0.12
838 0.13
839 0.19
840 0.19
841 0.22
842 0.27
843 0.31
844 0.35
845 0.37
846 0.39
847 0.35
848 0.39
849 0.41
850 0.39
851 0.34
852 0.29
853 0.29
854 0.29
855 0.26
856 0.22
857 0.16
858 0.13
859 0.15
860 0.16
861 0.15
862 0.12
863 0.12
864 0.13
865 0.19
866 0.19
867 0.18
868 0.23
869 0.23
870 0.29
871 0.31
872 0.3
873 0.3
874 0.35
875 0.39
876 0.41
877 0.48
878 0.43
879 0.45
880 0.45
881 0.42
882 0.43
883 0.37
884 0.32
885 0.26
886 0.28
887 0.28
888 0.3
889 0.32
890 0.32
891 0.33
892 0.35
893 0.39
894 0.45
895 0.52
896 0.58
897 0.62
898 0.62
899 0.63
900 0.61
901 0.55
902 0.47
903 0.39
904 0.36
905 0.31
906 0.29
907 0.33
908 0.33
909 0.35
910 0.34
911 0.34
912 0.28
913 0.25
914 0.26
915 0.22
916 0.23
917 0.22
918 0.23
919 0.23
920 0.22
921 0.25
922 0.28
923 0.33
924 0.34
925 0.32
926 0.32
927 0.36
928 0.46
929 0.5
930 0.44
931 0.42
932 0.46
933 0.49
934 0.48
935 0.45
936 0.38
937 0.36
938 0.39
939 0.37
940 0.36
941 0.38
942 0.43
943 0.45
944 0.49
945 0.47
946 0.46
947 0.47
948 0.43
949 0.45
950 0.43
951 0.44
952 0.37
953 0.38
954 0.39
955 0.37
956 0.37
957 0.3
958 0.27
959 0.25
960 0.25
961 0.21
962 0.16
963 0.17
964 0.17
965 0.17
966 0.18
967 0.14
968 0.13
969 0.13
970 0.15
971 0.13
972 0.15
973 0.14
974 0.16
975 0.17
976 0.18
977 0.19
978 0.18
979 0.18
980 0.16
981 0.16
982 0.17
983 0.17
984 0.18
985 0.2
986 0.21
987 0.25
988 0.27
989 0.26
990 0.22
991 0.25
992 0.28
993 0.33
994 0.35
995 0.37
996 0.35
997 0.37
998 0.41
999 0.44
1000 0.41
1001 0.36
1002 0.33
1003 0.29
1004 0.3
1005 0.29
1006 0.28
1007 0.22
1008 0.24
1009 0.31
1010 0.32
1011 0.34
1012 0.35
1013 0.37
1014 0.39
1015 0.45
1016 0.45
1017 0.44
1018 0.52
1019 0.56
1020 0.6
1021 0.63
1022 0.62
1023 0.62
1024 0.62
1025 0.53
1026 0.46
1027 0.38
1028 0.3
1029 0.25
1030 0.2
1031 0.14
1032 0.12
1033 0.11