Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CXE1

Protein Details
Accession A0A090CXE1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-42DDSMHPSRKRARDERSHKTKPRKAVDLEBasic
214-240GAQDDGKKNSKKSKAKKKEEEEEDGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-99SRKRARDERSHKTKPRKAVDLENNTAIKKRARAIERLLAHDPEKLPAHKKRELERELAAHKRRIADAQYKKIRSKMISK
108-111RKKA
220-231KKNSKKSKAKKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019310  Efg1  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10153  Efg1  
Amino Acid Sequences MGVKRSRSEAQAVGDDSMHPSRKRARDERSHKTKPRKAVDLENNTAIKKRARAIERLLAHDPEKLPAHKKRELERELAAHKRRIADAQYKKIRSKMISKYHMVRFFERKKAVRIAKQLEKKLAQATNDDEIAKLREDLHKAQVDIDYAIYYPFMEPYISLYAKPAEGEEEKAAQYLHTERPPMWALIEKTREEGKKALERLQNRRPAEDAEDEGAQDDGKKNSKKSKAKKKEEEEEDGGGFFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.27
4 0.28
5 0.3
6 0.25
7 0.29
8 0.37
9 0.44
10 0.54
11 0.58
12 0.63
13 0.68
14 0.77
15 0.83
16 0.84
17 0.87
18 0.87
19 0.89
20 0.86
21 0.85
22 0.84
23 0.81
24 0.76
25 0.76
26 0.77
27 0.75
28 0.72
29 0.68
30 0.61
31 0.53
32 0.5
33 0.42
34 0.35
35 0.3
36 0.31
37 0.33
38 0.35
39 0.4
40 0.44
41 0.5
42 0.49
43 0.51
44 0.49
45 0.43
46 0.4
47 0.38
48 0.32
49 0.28
50 0.28
51 0.26
52 0.3
53 0.35
54 0.42
55 0.43
56 0.48
57 0.53
58 0.59
59 0.6
60 0.57
61 0.52
62 0.51
63 0.51
64 0.54
65 0.5
66 0.43
67 0.42
68 0.4
69 0.37
70 0.35
71 0.34
72 0.36
73 0.39
74 0.46
75 0.52
76 0.54
77 0.55
78 0.56
79 0.55
80 0.48
81 0.49
82 0.49
83 0.5
84 0.51
85 0.53
86 0.56
87 0.59
88 0.61
89 0.55
90 0.5
91 0.49
92 0.49
93 0.53
94 0.52
95 0.47
96 0.46
97 0.51
98 0.53
99 0.5
100 0.52
101 0.51
102 0.54
103 0.58
104 0.56
105 0.52
106 0.48
107 0.43
108 0.4
109 0.36
110 0.28
111 0.24
112 0.24
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.22
129 0.22
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.08
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.24
168 0.26
169 0.24
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.29
174 0.34
175 0.3
176 0.31
177 0.37
178 0.37
179 0.34
180 0.35
181 0.34
182 0.37
183 0.4
184 0.45
185 0.45
186 0.52
187 0.58
188 0.64
189 0.66
190 0.6
191 0.6
192 0.54
193 0.5
194 0.47
195 0.42
196 0.36
197 0.3
198 0.29
199 0.26
200 0.24
201 0.21
202 0.16
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.23
207 0.28
208 0.34
209 0.44
210 0.54
211 0.63
212 0.71
213 0.78
214 0.81
215 0.87
216 0.92
217 0.92
218 0.92
219 0.9
220 0.87
221 0.81
222 0.73
223 0.63