Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6MGT0

Protein Details
Accession W6MGT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-296RLMLCAHHKRNREKKRQPPKSLQQLNPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-286KRNREKKRQP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.333, cyto 6, cyto_mito 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MSPHLKQFVRVGSLNSDKIVAEDDPNEAERVSRVGQGWKLDSLTRAGSSLRSASTRLSEEVLKERKYWGDVVQVLKCKEVLTKSNSLGGTSGNTKEFGVKYGFGDSGSNYFDKGIGLLKKNNVYGNVMFRPATNEQIERTYKVVTVRVLGNVDDQFVLLGQSDIKTQLAKFERRKQSGIPVLSEIERARFFLFEEELFYQLLKEAATLLSTNVQVESNKIIVNLHNEVVEIEAIAPDMSEEDNEDDDMDVSKPLSVHDRRAELIALFLRLMLCAHHKRNREKKRQPPKSLQQLNPEQHAQNSHENVLLLRPFIGYYKHNEFVRELESILKETVQKVFDNDFARAEKIMNDPETFKITRSHKHASEVSDSDPFGKCITPPQSDFQLTIPLKTGTGSLKIVIATSGTQTFCNLSTKIDIYRITPSGSVSDTDDYELLLDVSFNDLRDLQDCLSWAIPQYVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.33
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.2
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.17
18 0.16
19 0.18
20 0.19
21 0.24
22 0.28
23 0.32
24 0.34
25 0.33
26 0.33
27 0.3
28 0.29
29 0.26
30 0.25
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.24
42 0.25
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.25
47 0.34
48 0.38
49 0.36
50 0.34
51 0.36
52 0.36
53 0.37
54 0.36
55 0.29
56 0.31
57 0.33
58 0.37
59 0.4
60 0.43
61 0.41
62 0.39
63 0.37
64 0.29
65 0.29
66 0.29
67 0.3
68 0.3
69 0.36
70 0.36
71 0.42
72 0.41
73 0.38
74 0.33
75 0.27
76 0.23
77 0.2
78 0.21
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.21
83 0.2
84 0.2
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.2
89 0.2
90 0.16
91 0.17
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.14
102 0.17
103 0.2
104 0.24
105 0.28
106 0.31
107 0.34
108 0.35
109 0.31
110 0.3
111 0.29
112 0.31
113 0.29
114 0.27
115 0.25
116 0.23
117 0.27
118 0.24
119 0.27
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.28
124 0.3
125 0.26
126 0.26
127 0.22
128 0.22
129 0.23
130 0.24
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.17
137 0.18
138 0.15
139 0.15
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.15
155 0.2
156 0.28
157 0.35
158 0.45
159 0.54
160 0.57
161 0.59
162 0.54
163 0.57
164 0.56
165 0.51
166 0.42
167 0.34
168 0.32
169 0.3
170 0.3
171 0.21
172 0.16
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.14
242 0.15
243 0.19
244 0.22
245 0.24
246 0.24
247 0.25
248 0.25
249 0.17
250 0.18
251 0.14
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.11
260 0.17
261 0.24
262 0.3
263 0.37
264 0.47
265 0.58
266 0.68
267 0.74
268 0.78
269 0.83
270 0.88
271 0.92
272 0.9
273 0.9
274 0.89
275 0.88
276 0.88
277 0.82
278 0.79
279 0.77
280 0.71
281 0.64
282 0.57
283 0.47
284 0.39
285 0.37
286 0.32
287 0.29
288 0.28
289 0.25
290 0.23
291 0.23
292 0.21
293 0.21
294 0.17
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.12
301 0.11
302 0.17
303 0.23
304 0.28
305 0.28
306 0.3
307 0.3
308 0.29
309 0.3
310 0.25
311 0.19
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.17
316 0.16
317 0.14
318 0.15
319 0.19
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.2
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.23
329 0.24
330 0.21
331 0.2
332 0.17
333 0.18
334 0.21
335 0.21
336 0.21
337 0.22
338 0.23
339 0.28
340 0.26
341 0.23
342 0.27
343 0.29
344 0.35
345 0.4
346 0.46
347 0.43
348 0.49
349 0.52
350 0.49
351 0.51
352 0.46
353 0.42
354 0.37
355 0.35
356 0.31
357 0.28
358 0.24
359 0.18
360 0.17
361 0.14
362 0.2
363 0.26
364 0.28
365 0.3
366 0.34
367 0.4
368 0.4
369 0.41
370 0.34
371 0.37
372 0.32
373 0.31
374 0.29
375 0.23
376 0.22
377 0.21
378 0.22
379 0.15
380 0.18
381 0.18
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.14
387 0.13
388 0.1
389 0.11
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.16
395 0.17
396 0.2
397 0.18
398 0.17
399 0.2
400 0.22
401 0.24
402 0.27
403 0.26
404 0.25
405 0.31
406 0.3
407 0.28
408 0.26
409 0.25
410 0.23
411 0.23
412 0.22
413 0.19
414 0.2
415 0.19
416 0.2
417 0.18
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.11
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.13
429 0.13
430 0.15
431 0.16
432 0.19
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.18