Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GTZ1

Protein Details
Accession V5GTZ1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SRFVRPSKYRHVYPNVAKKEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 4, pero 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015505  Coronin  
IPR015048  DUF1899  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08953  DUF1899  
PF00400  WD40  
PF16300  WD40_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSRFVRPSKYRHVYPNVAKKEACYENVKVSNNAWDTNLLAANGKYISINWNASGGGAFAVLPVNKPGKLADIYPLCRGHTATVLDTAFSPFEDNFVASGSDDGTIGLWKIDDAKFDQLDWSDKERERNGGVKDFEPIARVSGGGRKIGQVVWHPTASNVLAAATGDHVIKLFDVSNASTASSSPSISLRGFTDTIQSLDWDWTGTTLIATSRDRKIRTFDPRQGENPVQVADSHGGIKGARVIWCGDKDRAITTGFSKMSDRQMFLWDTTNLASGPLKQVTLDTSSGIIMPFWSDNNIVFLAGKGDGNIRYYELENDELHYLTESKSSEPQRGLTFVGRRFLNTDENEIAKAYKITGTTIQPVSFCVPRKAEGFQSDIFPPAPSAEPALTPKDFFDGKRAARNMVSLETGKGVSSSGSVPTASSTTTAAPARSASPTKSASAPTPAPAAAPARSASPTKPSPAPAAAASPAPAAAASLPPPTRAAEPKANPTPTSTSTSTSNGTSSKEVDELKAQIEKLRTAVEERDTKIRHLEQENETLKTNQKKAREALLNSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.78
4 0.74
5 0.68
6 0.6
7 0.6
8 0.55
9 0.49
10 0.45
11 0.41
12 0.45
13 0.52
14 0.53
15 0.46
16 0.42
17 0.46
18 0.43
19 0.41
20 0.32
21 0.26
22 0.25
23 0.26
24 0.25
25 0.17
26 0.17
27 0.15
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.11
32 0.11
33 0.14
34 0.17
35 0.19
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.17
41 0.13
42 0.09
43 0.07
44 0.06
45 0.05
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.13
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.21
56 0.21
57 0.25
58 0.3
59 0.32
60 0.37
61 0.39
62 0.35
63 0.34
64 0.34
65 0.28
66 0.26
67 0.25
68 0.21
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.16
75 0.14
76 0.14
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.1
97 0.1
98 0.12
99 0.15
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.23
104 0.2
105 0.24
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.31
110 0.37
111 0.37
112 0.4
113 0.39
114 0.42
115 0.41
116 0.41
117 0.41
118 0.35
119 0.36
120 0.33
121 0.3
122 0.26
123 0.22
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.15
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.2
136 0.2
137 0.24
138 0.26
139 0.26
140 0.25
141 0.24
142 0.25
143 0.23
144 0.17
145 0.11
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.14
179 0.17
180 0.15
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.09
196 0.11
197 0.14
198 0.19
199 0.24
200 0.26
201 0.27
202 0.32
203 0.37
204 0.46
205 0.51
206 0.53
207 0.54
208 0.57
209 0.57
210 0.58
211 0.5
212 0.42
213 0.35
214 0.27
215 0.21
216 0.17
217 0.16
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.16
232 0.19
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.16
239 0.14
240 0.13
241 0.18
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.24
247 0.25
248 0.24
249 0.19
250 0.22
251 0.23
252 0.22
253 0.23
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.07
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.16
314 0.18
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.23
319 0.24
320 0.25
321 0.23
322 0.26
323 0.24
324 0.28
325 0.26
326 0.25
327 0.25
328 0.26
329 0.28
330 0.23
331 0.26
332 0.23
333 0.23
334 0.23
335 0.22
336 0.19
337 0.13
338 0.12
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.1
343 0.13
344 0.15
345 0.19
346 0.2
347 0.2
348 0.18
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.21
353 0.21
354 0.21
355 0.23
356 0.25
357 0.26
358 0.27
359 0.26
360 0.28
361 0.24
362 0.25
363 0.24
364 0.23
365 0.21
366 0.17
367 0.15
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.12
374 0.14
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.18
380 0.19
381 0.18
382 0.22
383 0.25
384 0.27
385 0.34
386 0.35
387 0.34
388 0.33
389 0.35
390 0.31
391 0.25
392 0.25
393 0.18
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.14
398 0.12
399 0.1
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.19
420 0.21
421 0.19
422 0.23
423 0.25
424 0.26
425 0.27
426 0.28
427 0.26
428 0.29
429 0.29
430 0.25
431 0.25
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.21
436 0.16
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.17
441 0.19
442 0.18
443 0.23
444 0.25
445 0.28
446 0.31
447 0.32
448 0.34
449 0.34
450 0.35
451 0.28
452 0.28
453 0.25
454 0.22
455 0.2
456 0.16
457 0.13
458 0.11
459 0.1
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.17
468 0.19
469 0.23
470 0.26
471 0.31
472 0.35
473 0.4
474 0.48
475 0.55
476 0.56
477 0.52
478 0.52
479 0.51
480 0.45
481 0.48
482 0.4
483 0.35
484 0.35
485 0.38
486 0.35
487 0.3
488 0.29
489 0.24
490 0.25
491 0.25
492 0.24
493 0.23
494 0.25
495 0.25
496 0.24
497 0.27
498 0.25
499 0.26
500 0.28
501 0.26
502 0.27
503 0.29
504 0.28
505 0.25
506 0.26
507 0.25
508 0.24
509 0.29
510 0.32
511 0.35
512 0.37
513 0.45
514 0.44
515 0.44
516 0.49
517 0.49
518 0.5
519 0.49
520 0.54
521 0.49
522 0.58
523 0.59
524 0.54
525 0.51
526 0.47
527 0.49
528 0.49
529 0.53
530 0.49
531 0.52
532 0.58
533 0.6
534 0.66
535 0.67