FuNGI

V5F0S4

Protein Details

Accession

V5F0S4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
673-692	SSSNQQKKSKQADTSKQAQP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8.833, nucl 7.5, cyto 7, extr 7, cyto_mito 5.999, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011502 Nucleoporin_Nup85
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0031080 C:nuclear pore outer ring GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF07575 Nucleopor_Nup85

Amino Acid Sequences

MAISAAASAAPAATIVSYDWGTSSDLKALYTQTYTIFTSLQHIHQEALLTDRTGRGAAGSSVLPSAETIQYYNRISEHYARAIQYYLERIQLDDSVDSDQFQTWRDAQTILRLAEVLYYPKDGRGISVVGEELLHWLNSFDVAPTTEEGQEIAESAVPHEHPSYWDYVLRCVLRGFHTSAASVLKSLDSHSSSVIRRVAQKSARLLSTLPRSTQFSMEHEFVAAHRSWLSNVRKLISGLEQEMDEMEAEGGNTEEVEDERLEYEAQFRCLLELMAGVKDRIFEACEDWREALGAWGTLVHPTLKRDDVPTTAAIILEKFPIDGTVPNEIVQQYLIKGQVRQAVQRAQDVDIWLGAHLGDLADKVGLLEDDNQAGPSDLRQSLLLKYAQSLLDEQGLWRISIDYLAACGAAGRKKMSHIILSVPLDGPDPTEESDDADIAMDEGADGSAIAPSKQAKSLARAEQVLRACSDHGLELEARVVCRRMSRTLMDQGQYGVAIAYCVQASDTVLIRTIAERILGEYVSKGAEAFIQIVDSFPSSLISPADGLDLDGEDLNDEQGLALNKHARGFFSNRLAFLARFRDFHRLYADGQWAAAAGLLVELVTTEAAPERFLAVLLVDAIPLLEDGQATWFDSSQTFELIRIVERITNAVSMHPDMSDHFLGYLDQLLGVDSSSNQQKKSKQADTSKQAQPSVKASDKLDAVRLSLARNLARVGVMQAGIA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.05
3	0.07
4	0.08
5	0.08
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.14
10	0.15
11	0.17
12	0.17
13	0.18
14	0.19
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.17
20	0.2
21	0.2
22	0.19
23	0.18
24	0.16
25	0.2
26	0.22
27	0.24
28	0.26
29	0.25
30	0.25
31	0.25
32	0.26
33	0.21
34	0.21
35	0.19
36	0.15
37	0.16
38	0.16
39	0.16
40	0.14
41	0.14
42	0.11
43	0.12
44	0.11
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.11
51	0.09
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.12
56	0.15
57	0.21
58	0.22
59	0.23
60	0.21
61	0.21
62	0.25
63	0.3
64	0.33
65	0.33
66	0.36
67	0.35
68	0.35
69	0.34
70	0.31
71	0.27
72	0.27
73	0.23
74	0.23
75	0.23
76	0.22
77	0.23
78	0.23
79	0.22
80	0.17
81	0.17
82	0.15
83	0.15
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.14
88	0.15
89	0.18
90	0.17
91	0.19
92	0.2
93	0.21
94	0.19
95	0.26
96	0.3
97	0.26
98	0.25
99	0.22
100	0.21
101	0.21
102	0.22
103	0.17
104	0.13
105	0.16
106	0.16
107	0.17
108	0.19
109	0.17
110	0.17
111	0.17
112	0.16
113	0.14
114	0.15
115	0.14
116	0.12
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.09
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.1
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.11
144	0.1
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.12
149	0.14
150	0.17
151	0.16
152	0.2
153	0.19
154	0.21
155	0.26
156	0.25
157	0.24
158	0.21
159	0.22
160	0.22
161	0.25
162	0.24
163	0.22
164	0.22
165	0.21
166	0.22
167	0.22
168	0.18
169	0.15
170	0.13
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.14
175	0.13
176	0.14
177	0.15
178	0.2
179	0.2
180	0.24
181	0.26
182	0.24
183	0.3
184	0.32
185	0.38
186	0.38
187	0.42
188	0.43
189	0.44
190	0.42
191	0.36
192	0.34
193	0.33
194	0.37
195	0.34
196	0.3
197	0.28
198	0.32
199	0.32
200	0.35
201	0.31
202	0.26
203	0.28
204	0.27
205	0.25
206	0.22
207	0.2
208	0.16
209	0.18
210	0.14
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.2
216	0.24
217	0.26
218	0.28
219	0.29
220	0.29
221	0.29
222	0.3
223	0.25
224	0.23
225	0.18
226	0.17
227	0.15
228	0.14
229	0.14
230	0.12
231	0.08
232	0.06
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.12
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.13
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.09
271	0.13
272	0.14
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.14
277	0.14
278	0.12
279	0.09
280	0.07
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.12
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.17
294	0.17
295	0.18
296	0.18
297	0.16
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.11
302	0.09
303	0.07
304	0.07
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.11
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.09
319	0.06
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.12
325	0.17
326	0.18
327	0.19
328	0.21
329	0.23
330	0.23
331	0.25
332	0.24
333	0.2
334	0.2
335	0.19
336	0.16
337	0.12
338	0.1
339	0.08
340	0.07
341	0.05
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.11
369	0.14
370	0.14
371	0.11
372	0.12
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.03
394	0.04
395	0.06
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.12
401	0.16
402	0.17
403	0.17
404	0.16
405	0.17
406	0.21
407	0.21
408	0.21
409	0.17
410	0.16
411	0.14
412	0.13
413	0.12
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.08
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.02
432	0.02
433	0.02
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.06
438	0.07
439	0.09
440	0.1
441	0.14
442	0.14
443	0.2
444	0.26
445	0.3
446	0.31
447	0.33
448	0.32
449	0.34
450	0.34
451	0.3
452	0.24
453	0.2
454	0.18
455	0.16
456	0.15
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.12
467	0.11
468	0.15
469	0.17
470	0.18
471	0.22
472	0.25
473	0.29
474	0.36
475	0.39
476	0.36
477	0.33
478	0.3
479	0.26
480	0.23
481	0.18
482	0.1
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.07
493	0.08
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.1
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.06
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.06
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.06
546	0.08
547	0.08
548	0.11
549	0.15
550	0.17
551	0.2
552	0.2
553	0.19
554	0.22
555	0.28
556	0.32
557	0.37
558	0.38
559	0.35
560	0.37
561	0.38
562	0.34
563	0.32
564	0.33
565	0.26
566	0.26
567	0.28
568	0.36
569	0.35
570	0.37
571	0.37
572	0.32
573	0.32
574	0.36
575	0.37
576	0.27
577	0.26
578	0.23
579	0.19
580	0.16
581	0.14
582	0.08
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.04
593	0.06
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.06
602	0.07
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.13
622	0.12
623	0.14
624	0.13
625	0.13
626	0.15
627	0.15
628	0.16
629	0.14
630	0.15
631	0.15
632	0.15
633	0.16
634	0.16
635	0.17
636	0.16
637	0.16
638	0.18
639	0.17
640	0.17
641	0.15
642	0.15
643	0.14
644	0.2
645	0.19
646	0.16
647	0.14
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.15
652	0.09
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.06
660	0.11
661	0.2
662	0.23
663	0.26
664	0.32
665	0.38
666	0.48
667	0.57
668	0.6
669	0.61
670	0.69
671	0.76
672	0.78
673	0.81
674	0.78
675	0.73
676	0.71
677	0.65
678	0.59
679	0.54
680	0.55
681	0.52
682	0.49
683	0.45
684	0.45
685	0.45
686	0.43
687	0.43
688	0.36
689	0.31
690	0.32
691	0.31
692	0.28
693	0.27
694	0.3
695	0.26
696	0.26
697	0.26
698	0.22
699	0.22
700	0.2
701	0.19
702	0.17

V5F0S4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer