Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5ERX6

Protein Details
Accession V5ERX6    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-139GSTPKPAAPKAKKPAKPKEEGAEAKTKKPKKKPAAIAATDHydrophilic
160-183ASSSAPKPKKTVKKKNASTSKDQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-133KPAAPKAKKPAKPKEEGAEAKTKKPKKKPA
165-174PKPKKTVKKK
202-224DTKSKGKKASASKAGGKAASKAR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, cyto 10, nucl 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MTGTGVIPESFFDMPFDYGTGDANMDFGSMPGFPTGDVAMSNSSDFDALTAQIAASMPPLPSASYPTTMMAGSQPYSAGVKMEMEDSSSVPGASPMTAEGSTPKPAAPKAKKPAKPKEEGAEAKTKKPKKKPAAIAATDAAATASPASSGPVPGSSKDSASSSAPKPKKTVKKKNASTSKDQPPSATTSPAAFATPASPSKDTKSKGKKASASKAGGKAASKARSTTARSASRMSSIGRDAGTPAAASRVGSQRPQDEANDDDEPAPNRAAPQEDEEADDEEVEADDGVEELGKDHFSTQEAIYAAQQRNMGLLSMVMDEDQLDRHMASRRGALNKTSVRKLVNHVLSQSVSQHVAMVVSGVAKIFVGEIVEKAREIQAMRGEQGPLRPNHLREAHRQYYLKRERPGHYPPGTNAGFPGVGKKRRMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.12
5 0.12
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.19
56 0.19
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.06
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.13
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.2
93 0.31
94 0.36
95 0.43
96 0.51
97 0.61
98 0.67
99 0.74
100 0.82
101 0.8
102 0.79
103 0.74
104 0.7
105 0.69
106 0.66
107 0.6
108 0.6
109 0.53
110 0.54
111 0.58
112 0.6
113 0.59
114 0.65
115 0.71
116 0.71
117 0.79
118 0.81
119 0.83
120 0.85
121 0.78
122 0.71
123 0.61
124 0.51
125 0.41
126 0.31
127 0.21
128 0.1
129 0.08
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.15
147 0.17
148 0.21
149 0.2
150 0.3
151 0.32
152 0.33
153 0.37
154 0.44
155 0.53
156 0.59
157 0.67
158 0.67
159 0.75
160 0.81
161 0.87
162 0.88
163 0.83
164 0.8
165 0.78
166 0.77
167 0.72
168 0.64
169 0.54
170 0.46
171 0.47
172 0.4
173 0.32
174 0.23
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.24
189 0.25
190 0.33
191 0.41
192 0.46
193 0.52
194 0.57
195 0.61
196 0.62
197 0.68
198 0.66
199 0.61
200 0.57
201 0.53
202 0.48
203 0.42
204 0.35
205 0.31
206 0.29
207 0.28
208 0.25
209 0.22
210 0.23
211 0.27
212 0.3
213 0.31
214 0.34
215 0.34
216 0.35
217 0.37
218 0.35
219 0.32
220 0.3
221 0.25
222 0.19
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.12
237 0.14
238 0.16
239 0.18
240 0.19
241 0.22
242 0.23
243 0.21
244 0.19
245 0.19
246 0.21
247 0.2
248 0.19
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.18
264 0.19
265 0.16
266 0.15
267 0.11
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.22
292 0.22
293 0.23
294 0.23
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.09
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.1
313 0.16
314 0.18
315 0.19
316 0.25
317 0.3
318 0.35
319 0.38
320 0.37
321 0.4
322 0.45
323 0.49
324 0.47
325 0.45
326 0.42
327 0.43
328 0.47
329 0.48
330 0.47
331 0.43
332 0.4
333 0.39
334 0.37
335 0.35
336 0.31
337 0.23
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.15
363 0.16
364 0.19
365 0.23
366 0.26
367 0.27
368 0.29
369 0.29
370 0.28
371 0.33
372 0.36
373 0.31
374 0.35
375 0.39
376 0.39
377 0.46
378 0.52
379 0.5
380 0.53
381 0.61
382 0.6
383 0.62
384 0.64
385 0.59
386 0.63
387 0.69
388 0.67
389 0.66
390 0.68
391 0.64
392 0.67
393 0.72
394 0.71
395 0.67
396 0.65
397 0.59
398 0.6
399 0.57
400 0.49
401 0.41
402 0.34
403 0.29
404 0.23
405 0.3
406 0.3
407 0.36