Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GH57

Protein Details
Accession V5GH57    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-78SAQDKQARKAEARRSRQKRKDYAKQLTKTGREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-66RKAEARRSRQKRK
619-629RPRKPAAPRKR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR043837  Mtf2-like_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF19189  Mtf2  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MSSTLPSSPELPPAKRMRSRSPEQPQAEANGQIGLASTSAAASESTSAQDKQARKAEARRSRQKRKDYAKQLTKTGREPIEFDIEDLIGARNVTDILSEGLEHKNKFERGTRLTLQIERLDAHGDGLAIAPERDWVIAVPHTLPGEKVTVEISSNERLYSKAKLVEVLEKSATRQDELVRCKYFGDCGGCQYQMIDYAHQLEIKRGVVERAFARFSGLDAALIPEVLPTIASPNQYNYRTKLTPHFELPYELRRGRRTGIRNDANGNGKAEYDVPIGFDCIGTKRVMDIEECPIATKTINKALPAAKQKVVDTIESFKNGATILLRDSLITYDSFAEDLAVTSSAGEVEREFDTEVVTDHKATVKERVLTTKFESPAGTFFQNNRSILPSLLDYVRDAITSSGTGGGRYLVDAYCGSGLFSLCLASLFHEVSGVEISSESIRYATKNAELNGITNAKFLAGNAEDIFARIEYPAEKTTVIIDPPRRGCDEEFIRQLVKLGPKHIVYVSCNVHTQARDVGQLIAKDARYKIMSVRGADLFPQTHHVEGVAVLERVDASAPAASPTAPTQASWLSDQLDSLTTSPRTPRPNARSDDRKKHPIPRSVLFADSDRARQSEDFRPRKPAAPRKRFDRTPLTQQEANAFMSLLNQALAGTSTPTSSPLPTAGEREETPFGSYTSLISNPKTQSGSKALLQAFATRNRLKRFEEAREQRARRFMREGLAGSMDPLVLEAGIDEAREAIAACENLVDLLDWAKREVWGIHPTPTSAEVDLANTLETSATSTEGKREVKYGKETPFYPSVLQLLFLTIRDRYRAPHVALTIPRTTRALGIESYVLGVTGSLYNEVLKTQWDWLGDLPGVVSTLRQARETGILSAPLKHPIAPEKGAGGLATSEDESIRETVDRIANEVRKYVLDQKNEEDVFGEGSVEAGKGGKMGGIGVVIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.6
3 0.66
4 0.67
5 0.7
6 0.75
7 0.77
8 0.78
9 0.79
10 0.75
11 0.73
12 0.65
13 0.62
14 0.57
15 0.48
16 0.39
17 0.29
18 0.25
19 0.2
20 0.17
21 0.12
22 0.08
23 0.07
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.05
29 0.06
30 0.08
31 0.08
32 0.11
33 0.14
34 0.15
35 0.19
36 0.26
37 0.28
38 0.35
39 0.42
40 0.45
41 0.48
42 0.57
43 0.63
44 0.67
45 0.74
46 0.77
47 0.8
48 0.86
49 0.9
50 0.91
51 0.91
52 0.91
53 0.92
54 0.92
55 0.92
56 0.91
57 0.87
58 0.86
59 0.84
60 0.79
61 0.73
62 0.7
63 0.65
64 0.56
65 0.53
66 0.48
67 0.47
68 0.41
69 0.37
70 0.31
71 0.25
72 0.23
73 0.21
74 0.17
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.17
88 0.22
89 0.22
90 0.24
91 0.31
92 0.33
93 0.36
94 0.41
95 0.43
96 0.44
97 0.52
98 0.52
99 0.52
100 0.54
101 0.53
102 0.5
103 0.44
104 0.4
105 0.32
106 0.3
107 0.25
108 0.2
109 0.18
110 0.14
111 0.12
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.18
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.19
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.24
150 0.27
151 0.28
152 0.35
153 0.34
154 0.33
155 0.32
156 0.28
157 0.28
158 0.3
159 0.29
160 0.22
161 0.22
162 0.25
163 0.3
164 0.36
165 0.43
166 0.4
167 0.39
168 0.39
169 0.38
170 0.34
171 0.31
172 0.31
173 0.24
174 0.26
175 0.29
176 0.28
177 0.27
178 0.25
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.17
183 0.15
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.2
192 0.17
193 0.19
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.22
199 0.2
200 0.21
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.16
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.03
216 0.07
217 0.09
218 0.11
219 0.12
220 0.17
221 0.24
222 0.28
223 0.31
224 0.31
225 0.36
226 0.36
227 0.38
228 0.42
229 0.42
230 0.43
231 0.43
232 0.43
233 0.37
234 0.4
235 0.4
236 0.37
237 0.38
238 0.37
239 0.37
240 0.38
241 0.4
242 0.4
243 0.45
244 0.46
245 0.48
246 0.55
247 0.57
248 0.56
249 0.57
250 0.57
251 0.54
252 0.49
253 0.41
254 0.31
255 0.25
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.17
278 0.16
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.15
285 0.21
286 0.23
287 0.22
288 0.25
289 0.28
290 0.34
291 0.39
292 0.4
293 0.35
294 0.35
295 0.35
296 0.37
297 0.36
298 0.3
299 0.25
300 0.26
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.13
349 0.14
350 0.19
351 0.2
352 0.23
353 0.24
354 0.31
355 0.3
356 0.32
357 0.34
358 0.34
359 0.32
360 0.29
361 0.29
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.2
366 0.15
367 0.16
368 0.21
369 0.25
370 0.24
371 0.23
372 0.23
373 0.22
374 0.21
375 0.21
376 0.15
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.12
433 0.14
434 0.14
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.19
439 0.19
440 0.15
441 0.13
442 0.12
443 0.09
444 0.09
445 0.08
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.07
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.13
468 0.15
469 0.19
470 0.21
471 0.23
472 0.22
473 0.23
474 0.23
475 0.26
476 0.28
477 0.27
478 0.27
479 0.26
480 0.26
481 0.24
482 0.24
483 0.2
484 0.21
485 0.18
486 0.18
487 0.2
488 0.2
489 0.21
490 0.21
491 0.2
492 0.16
493 0.21
494 0.21
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.2
499 0.18
500 0.18
501 0.14
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.12
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.19
518 0.21
519 0.2
520 0.23
521 0.21
522 0.21
523 0.21
524 0.21
525 0.14
526 0.12
527 0.15
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.11
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.07
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.13
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.09
566 0.12
567 0.11
568 0.12
569 0.15
570 0.2
571 0.24
572 0.28
573 0.37
574 0.4
575 0.48
576 0.52
577 0.57
578 0.62
579 0.67
580 0.72
581 0.7
582 0.73
583 0.69
584 0.74
585 0.75
586 0.72
587 0.69
588 0.62
589 0.62
590 0.54
591 0.5
592 0.42
593 0.34
594 0.29
595 0.25
596 0.23
597 0.18
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.2
602 0.26
603 0.36
604 0.41
605 0.42
606 0.49
607 0.5
608 0.55
609 0.6
610 0.62
611 0.62
612 0.66
613 0.7
614 0.7
615 0.77
616 0.73
617 0.7
618 0.69
619 0.64
620 0.64
621 0.65
622 0.63
623 0.55
624 0.53
625 0.49
626 0.41
627 0.36
628 0.26
629 0.19
630 0.13
631 0.12
632 0.11
633 0.08
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.09
645 0.09
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.14
650 0.14
651 0.17
652 0.16
653 0.18
654 0.19
655 0.21
656 0.22
657 0.19
658 0.2
659 0.18
660 0.17
661 0.15
662 0.14
663 0.11
664 0.12
665 0.15
666 0.15
667 0.16
668 0.21
669 0.21
670 0.25
671 0.26
672 0.25
673 0.26
674 0.29
675 0.31
676 0.28
677 0.34
678 0.31
679 0.31
680 0.31
681 0.32
682 0.3
683 0.31
684 0.36
685 0.34
686 0.4
687 0.42
688 0.46
689 0.44
690 0.5
691 0.52
692 0.53
693 0.59
694 0.61
695 0.65
696 0.71
697 0.7
698 0.65
699 0.67
700 0.62
701 0.56
702 0.53
703 0.47
704 0.41
705 0.43
706 0.4
707 0.33
708 0.33
709 0.28
710 0.23
711 0.2
712 0.15
713 0.11
714 0.09
715 0.07
716 0.04
717 0.04
718 0.03
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.04
725 0.05
726 0.05
727 0.04
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.04
737 0.07
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.11
742 0.11
743 0.13
744 0.14
745 0.16
746 0.23
747 0.24
748 0.28
749 0.28
750 0.28
751 0.28
752 0.29
753 0.25
754 0.18
755 0.17
756 0.13
757 0.13
758 0.14
759 0.12
760 0.1
761 0.08
762 0.08
763 0.07
764 0.06
765 0.07
766 0.07
767 0.08
768 0.1
769 0.11
770 0.14
771 0.2
772 0.23
773 0.22
774 0.28
775 0.3
776 0.35
777 0.42
778 0.46
779 0.47
780 0.49
781 0.49
782 0.49
783 0.49
784 0.45
785 0.38
786 0.32
787 0.28
788 0.24
789 0.24
790 0.18
791 0.16
792 0.15
793 0.14
794 0.15
795 0.15
796 0.16
797 0.18
798 0.19
799 0.2
800 0.27
801 0.33
802 0.34
803 0.37
804 0.37
805 0.41
806 0.44
807 0.46
808 0.44
809 0.38
810 0.37
811 0.33
812 0.31
813 0.27
814 0.26
815 0.24
816 0.18
817 0.19
818 0.18
819 0.17
820 0.17
821 0.14
822 0.11
823 0.08
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.09
834 0.1
835 0.11
836 0.13
837 0.15
838 0.15
839 0.17
840 0.17
841 0.21
842 0.19
843 0.17
844 0.15
845 0.12
846 0.12
847 0.1
848 0.09
849 0.09
850 0.15
851 0.17
852 0.17
853 0.18
854 0.19
855 0.25
856 0.27
857 0.26
858 0.22
859 0.25
860 0.25
861 0.29
862 0.28
863 0.29
864 0.27
865 0.25
866 0.27
867 0.29
868 0.35
869 0.33
870 0.33
871 0.29
872 0.29
873 0.28
874 0.24
875 0.18
876 0.12
877 0.11
878 0.11
879 0.1
880 0.09
881 0.09
882 0.1
883 0.11
884 0.11
885 0.12
886 0.11
887 0.11
888 0.16
889 0.21
890 0.21
891 0.23
892 0.3
893 0.35
894 0.35
895 0.36
896 0.33
897 0.3
898 0.34
899 0.4
900 0.39
901 0.41
902 0.44
903 0.47
904 0.55
905 0.53
906 0.49
907 0.39
908 0.33
909 0.28
910 0.24
911 0.19
912 0.09
913 0.1
914 0.1
915 0.09
916 0.08
917 0.07
918 0.07
919 0.06
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.07
924 0.07