FuNGI

V5GGZ3

Protein Details

Accession

V5GGZ3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
548-570	AQDSSKFRPRHARSRNPGARVRF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-35	KRTAVVKGKPRVPAPATPWRPRISR

Subcellular Location(s)

mito 21, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002343 Hud_Sxl_RNA IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MTTAMHRNGGKRTAVVKGKPRVPAPATPWRPRISRKSPALTADDQEDQPSPLDRKAVNTALHLKFGSKTEPIAASPAPTSATLVPGADKEESVGPQLVGDAYRRNVQEPGAPKLEQGVEWPGDRWSPMRSDFGISTGPLDEGQARIHAFQRGLPAFHFRPGSAADAYDASARRADDCLAFDLNHETNVYVNGLPKEMTDHMLYLLGSACGVVISHKAMLDRLTDQCKGFGFLMYASADMAKHAIEWLNSHGFAASFAKESFSAKLRRMADTSSTNVYLSNLPIKFTVQQLEQLFVPYPIASLKILYDIHGESRGVGFVRLYDRAAAKVCIERLHGRVLPGTTLPLRVRFADSDAQKHLKHSVSQKHTLESLGLLMLDARASGQPVQGLCRGELDAAVSAQPRNTGTMPRPFIPAATSLPVAEGGSPPVVEQGWQGHNGLGIQMPSQLMFAHPRVNQILHPAMWPSVATAGVVYTGMEGNFPIDRSYPMSPVVAGVYDSHKGSHGEPAGYLPIPLHPPPGLVHPSHLTNRGEQPHAIREEPKENRQAPAQDSSKFRPRHARSRNPGARVRFPGDTVDAGTRAVSDPMAMLAAQARVREALGLPDRVRAAVSADNSIDEGHVEAPADSSIISGSSSDDDEESFSVEIQIHPDARAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.52
3	0.56
4	0.59
5	0.63
6	0.65
7	0.64
8	0.64
9	0.61
10	0.61
11	0.59
12	0.61
13	0.63
14	0.65
15	0.69
16	0.66
17	0.68
18	0.69
19	0.72
20	0.7
21	0.71
22	0.72
23	0.74
24	0.73
25	0.72
26	0.7
27	0.63
28	0.56
29	0.51
30	0.45
31	0.37
32	0.35
33	0.3
34	0.25
35	0.23
36	0.25
37	0.23
38	0.21
39	0.26
40	0.24
41	0.28
42	0.34
43	0.38
44	0.35
45	0.38
46	0.45
47	0.42
48	0.44
49	0.4
50	0.34
51	0.31
52	0.32
53	0.3
54	0.22
55	0.22
56	0.23
57	0.24
58	0.23
59	0.25
60	0.23
61	0.2
62	0.19
63	0.19
64	0.16
65	0.14
66	0.16
67	0.13
68	0.14
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.13
73	0.15
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.14
78	0.14
79	0.16
80	0.16
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.13
85	0.11
86	0.12
87	0.14
88	0.14
89	0.2
90	0.21
91	0.22
92	0.23
93	0.23
94	0.28
95	0.28
96	0.33
97	0.32
98	0.31
99	0.29
100	0.31
101	0.31
102	0.25
103	0.23
104	0.22
105	0.19
106	0.2
107	0.21
108	0.18
109	0.18
110	0.19
111	0.18
112	0.15
113	0.17
114	0.19
115	0.23
116	0.23
117	0.26
118	0.25
119	0.26
120	0.25
121	0.2
122	0.19
123	0.16
124	0.15
125	0.11
126	0.12
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.15
134	0.17
135	0.17
136	0.17
137	0.25
138	0.24
139	0.24
140	0.24
141	0.29
142	0.27
143	0.31
144	0.3
145	0.22
146	0.22
147	0.23
148	0.25
149	0.18
150	0.17
151	0.14
152	0.14
153	0.14
154	0.16
155	0.14
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.15
162	0.13
163	0.14
164	0.16
165	0.16
166	0.15
167	0.15
168	0.19
169	0.18
170	0.16
171	0.15
172	0.12
173	0.11
174	0.12
175	0.13
176	0.09
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.14
183	0.14
184	0.15
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.14
189	0.13
190	0.1
191	0.1
192	0.07
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.13
208	0.16
209	0.19
210	0.21
211	0.21
212	0.22
213	0.21
214	0.22
215	0.19
216	0.16
217	0.12
218	0.1
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.07
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.11
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.11
240	0.12
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.16
249	0.19
250	0.19
251	0.26
252	0.27
253	0.29
254	0.29
255	0.28
256	0.28
257	0.27
258	0.28
259	0.23
260	0.22
261	0.2
262	0.19
263	0.18
264	0.15
265	0.13
266	0.16
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.15
271	0.15
272	0.16
273	0.17
274	0.12
275	0.17
276	0.17
277	0.18
278	0.17
279	0.16
280	0.15
281	0.13
282	0.13
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.06
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.19
321	0.19
322	0.17
323	0.18
324	0.17
325	0.16
326	0.13
327	0.14
328	0.1
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.14
333	0.14
334	0.16
335	0.15
336	0.17
337	0.19
338	0.2
339	0.21
340	0.24
341	0.27
342	0.25
343	0.26
344	0.27
345	0.23
346	0.26
347	0.3
348	0.36
349	0.38
350	0.46
351	0.46
352	0.43
353	0.42
354	0.38
355	0.3
356	0.21
357	0.15
358	0.08
359	0.07
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.1
373	0.13
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.11
391	0.14
392	0.17
393	0.25
394	0.28
395	0.28
396	0.3
397	0.28
398	0.27
399	0.25
400	0.23
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.09
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.1
419	0.12
420	0.13
421	0.14
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.09
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.1
436	0.11
437	0.16
438	0.17
439	0.2
440	0.21
441	0.23
442	0.22
443	0.24
444	0.25
445	0.2
446	0.2
447	0.18
448	0.16
449	0.15
450	0.14
451	0.1
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.08
470	0.1
471	0.14
472	0.16
473	0.16
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.15
479	0.11
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.13
487	0.14
488	0.15
489	0.2
490	0.2
491	0.19
492	0.19
493	0.2
494	0.21
495	0.2
496	0.19
497	0.12
498	0.12
499	0.16
500	0.16
501	0.17
502	0.14
503	0.16
504	0.17
505	0.22
506	0.23
507	0.2
508	0.23
509	0.23
510	0.28
511	0.29
512	0.35
513	0.3
514	0.31
515	0.38
516	0.39
517	0.39
518	0.36
519	0.37
520	0.38
521	0.4
522	0.38
523	0.35
524	0.35
525	0.43
526	0.47
527	0.5
528	0.51
529	0.5
530	0.5
531	0.52
532	0.52
533	0.46
534	0.49
535	0.46
536	0.42
537	0.46
538	0.5
539	0.53
540	0.51
541	0.52
542	0.54
543	0.58
544	0.64
545	0.68
546	0.73
547	0.73
548	0.82
549	0.85
550	0.82
551	0.82
552	0.78
553	0.75
554	0.71
555	0.66
556	0.57
557	0.5
558	0.46
559	0.41
560	0.35
561	0.29
562	0.25
563	0.2
564	0.19
565	0.17
566	0.15
567	0.13
568	0.13
569	0.1
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.06
576	0.08
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.13
581	0.13
582	0.13
583	0.14
584	0.13
585	0.18
586	0.21
587	0.27
588	0.27
589	0.3
590	0.31
591	0.29
592	0.29
593	0.21
594	0.2
595	0.19
596	0.21
597	0.2
598	0.2
599	0.2
600	0.2
601	0.2
602	0.16
603	0.12
604	0.11
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.09
620	0.1
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.13
625	0.13
626	0.13
627	0.12
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.12
632	0.13
633	0.17
634	0.17

V5GGZ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer