Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EPR6

Protein Details
Accession V5EPR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
306-329TGSDKGHGKKKIKKERKVDDDEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-322KGHGKKKIKKERK
341-351SGKRKSGSKAI
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MPSAKASSSSSAAGSKLTKLETALYRAAQSAPGGIITQDQISEQFKHEQIDDRLQAINGLLRKNLFTAQSLQGTIQFAATARAEASIMGKLDENETMVYSHIKDARNDGIWTKQLKNRTNLHQTIINRCLKSLEQKQLVKAVKSVKYPTRKIYMLFGLTPSIELSGGPWYTDNELDTGFINELSMAILNFIRSKSFPKNGQSRALFPTSHTSQLPSAKAIHSYLRNAELTETQLEVEHVVSLLDILVYDEQIEKIPVLSLNGGGGGINEFDEEDQNYSDSERSTDGSGSDSESASGSDSESSAQETGSDKGHGKKKIKKERKVDDDEDDDSDDENAGPVKSGKRKSGSKAIRPHSVKVRWTETPCGHCPVFDFCDDTGPVNAETCEYFGGKEDELGRKVKNGWIDTIAFDDDEEEPEEADEGDDVKMVDDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.26
8 0.27
9 0.3
10 0.31
11 0.29
12 0.29
13 0.29
14 0.29
15 0.24
16 0.2
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.15
29 0.17
30 0.19
31 0.24
32 0.25
33 0.27
34 0.28
35 0.34
36 0.35
37 0.42
38 0.41
39 0.37
40 0.36
41 0.34
42 0.33
43 0.25
44 0.24
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.19
53 0.18
54 0.22
55 0.25
56 0.26
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.22
62 0.17
63 0.13
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.14
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.25
92 0.28
93 0.3
94 0.3
95 0.28
96 0.27
97 0.3
98 0.34
99 0.35
100 0.34
101 0.4
102 0.45
103 0.5
104 0.52
105 0.56
106 0.62
107 0.59
108 0.58
109 0.55
110 0.52
111 0.53
112 0.54
113 0.51
114 0.41
115 0.39
116 0.38
117 0.34
118 0.4
119 0.4
120 0.41
121 0.43
122 0.45
123 0.47
124 0.53
125 0.54
126 0.45
127 0.41
128 0.4
129 0.36
130 0.38
131 0.42
132 0.41
133 0.47
134 0.5
135 0.51
136 0.5
137 0.47
138 0.44
139 0.43
140 0.4
141 0.33
142 0.3
143 0.25
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.13
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.13
181 0.18
182 0.23
183 0.27
184 0.34
185 0.42
186 0.45
187 0.52
188 0.48
189 0.46
190 0.45
191 0.42
192 0.35
193 0.27
194 0.3
195 0.24
196 0.25
197 0.22
198 0.2
199 0.2
200 0.24
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.16
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.22
298 0.29
299 0.36
300 0.42
301 0.49
302 0.59
303 0.69
304 0.77
305 0.79
306 0.83
307 0.86
308 0.87
309 0.88
310 0.82
311 0.76
312 0.7
313 0.63
314 0.54
315 0.45
316 0.35
317 0.26
318 0.22
319 0.16
320 0.11
321 0.09
322 0.09
323 0.07
324 0.08
325 0.1
326 0.16
327 0.24
328 0.29
329 0.35
330 0.42
331 0.48
332 0.54
333 0.62
334 0.65
335 0.67
336 0.72
337 0.71
338 0.74
339 0.71
340 0.71
341 0.7
342 0.67
343 0.63
344 0.6
345 0.6
346 0.57
347 0.58
348 0.61
349 0.57
350 0.57
351 0.55
352 0.55
353 0.48
354 0.41
355 0.39
356 0.37
357 0.34
358 0.28
359 0.27
360 0.21
361 0.26
362 0.27
363 0.26
364 0.21
365 0.2
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.15
377 0.14
378 0.17
379 0.22
380 0.26
381 0.29
382 0.32
383 0.3
384 0.31
385 0.34
386 0.34
387 0.36
388 0.33
389 0.33
390 0.34
391 0.35
392 0.32
393 0.33
394 0.3
395 0.22
396 0.19
397 0.18
398 0.14
399 0.15
400 0.16
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08