FuNGI

V5GKD5

Protein Details

Accession

V5GKD5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
301-324	LRAVAPPTTKRKRKSNKNIKLEGI	Hydrophilic
544-567	MGVPIREPYKRKKPKAPRDASTAM	Hydrophilic
611-637	GGSGKTRSGARKGRKRGRQQSSDESSS	Hydrophilic
643-671	DAAANGKRGKKGRKGKKASKKSQGTAQGY	Hydrophilic
690-710	MLPPSHPLRRKETRLNKRGAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
310-316	KRKRKSN
551-560	PYKRKKPKAP
608-628	SGKGGSGKTRSGARKGRKRGR
648-663	GKRGKKGRKGKKASKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin IPR013137 Znf_TFIIB
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF08271 TF_Zn_Ribbon PF00382 TFIIB
CDD	cd20553 CYCLIN_TFIIIB90_rpt1 cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MKCTNCGSSAIDFADNQAVCSQCGVVLEESQIVSDITFGENSAGGAVVQGSMIAADQARARVSGPSGFRGGYVSESREMTISNARIGINNMASALRIPSHVADRALRFFTLALDGGASAATGDEPKNYVLGRKSEYTVASCLYVACRMEKTTHMLIDFADAIQVNVFVLGRSYLKLIRILNLRLPLIDPSIYIARFAALLDFGEETQKVAYDASRLVSRFQKDWITEGRRPAGICGACLMLAARMNHFRRSVSEVIQVVKIADVTLKARLEEFKKTPTGQLSVQDFRNVWLEEEHAPPAYLRAVAPPTTKRKRKSNKNIKLEGIEVADDSDAADADADAEGEADAGTSARTAVAEDADAIDPALEKVVDEATEQEIQQYLQQSLAQELDKALETQEREREERAKSGQVASTSSRPAAASDAGPIPDANGAGPSGTRDPSLDISRAGKLLPLGGLGMDVQSTFGDDAEAALDGVADDADATSADRRRSVGPHADELADLDEDELDRFILSPEEVRIKERVWMEFNKDWMEQMLKKQLKLEHDQKMGVPIREPYKRKKPKAPRDASTAMHNTSAAESAKMMLKQKQFSKKINYDALNNLFPGAKVVGGGSGKGGSGKTRSGARKGRKRGRQQSSDESSSEEEEEDAAANGKRGKKGRKGKKASKKSQGTAQGYFESDNNDSQMEVVEEDGEMLPPSHPLRRKETRLNKRGAGQLSSAAEESATDLGEEMNEPADGGAMLLNEATMRSQLGYFNDDTEDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.24
3	0.23
4	0.23
5	0.21
6	0.19
7	0.2
8	0.19
9	0.12
10	0.14
11	0.15
12	0.13
13	0.14
14	0.15
15	0.16
16	0.15
17	0.14
18	0.14
19	0.11
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.08
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.08
30	0.07
31	0.06
32	0.06
33	0.06
34	0.05
35	0.05
36	0.05
37	0.04
38	0.04
39	0.04
40	0.05
41	0.05
42	0.06
43	0.08
44	0.1
45	0.11
46	0.11
47	0.12
48	0.14
49	0.16
50	0.21
51	0.22
52	0.24
53	0.25
54	0.25
55	0.24
56	0.23
57	0.22
58	0.21
59	0.21
60	0.21
61	0.22
62	0.23
63	0.23
64	0.22
65	0.21
66	0.19
67	0.23
68	0.21
69	0.2
70	0.22
71	0.22
72	0.23
73	0.24
74	0.26
75	0.19
76	0.18
77	0.17
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.1
83	0.09
84	0.11
85	0.12
86	0.16
87	0.19
88	0.21
89	0.24
90	0.27
91	0.31
92	0.31
93	0.29
94	0.25
95	0.22
96	0.21
97	0.19
98	0.15
99	0.11
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.08
104	0.07
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.05
109	0.06
110	0.07
111	0.09
112	0.09
113	0.11
114	0.12
115	0.16
116	0.19
117	0.24
118	0.27
119	0.29
120	0.3
121	0.32
122	0.34
123	0.31
124	0.29
125	0.25
126	0.22
127	0.19
128	0.17
129	0.15
130	0.16
131	0.14
132	0.15
133	0.16
134	0.16
135	0.18
136	0.2
137	0.25
138	0.26
139	0.27
140	0.25
141	0.24
142	0.22
143	0.22
144	0.21
145	0.14
146	0.11
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.04
155	0.05
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.1
160	0.11
161	0.13
162	0.18
163	0.18
164	0.22
165	0.27
166	0.28
167	0.3
168	0.32
169	0.31
170	0.27
171	0.27
172	0.23
173	0.19
174	0.17
175	0.13
176	0.12
177	0.16
178	0.15
179	0.14
180	0.13
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.08
185	0.05
186	0.05
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.13
202	0.14
203	0.17
204	0.22
205	0.24
206	0.23
207	0.26
208	0.29
209	0.26
210	0.3
211	0.36
212	0.38
213	0.38
214	0.42
215	0.42
216	0.39
217	0.38
218	0.35
219	0.33
220	0.26
221	0.22
222	0.19
223	0.16
224	0.14
225	0.13
226	0.13
227	0.07
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.19
232	0.21
233	0.24
234	0.25
235	0.25
236	0.24
237	0.3
238	0.31
239	0.26
240	0.29
241	0.28
242	0.28
243	0.28
244	0.25
245	0.19
246	0.16
247	0.13
248	0.08
249	0.07
250	0.06
251	0.07
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.16
257	0.19
258	0.24
259	0.25
260	0.26
261	0.29
262	0.3
263	0.32
264	0.31
265	0.31
266	0.26
267	0.3
268	0.31
269	0.31
270	0.3
271	0.29
272	0.26
273	0.24
274	0.27
275	0.21
276	0.17
277	0.14
278	0.15
279	0.15
280	0.17
281	0.17
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.08
288	0.07
289	0.09
290	0.1
291	0.12
292	0.16
293	0.21
294	0.3
295	0.39
296	0.46
297	0.5
298	0.59
299	0.67
300	0.76
301	0.81
302	0.83
303	0.84
304	0.87
305	0.86
306	0.78
307	0.69
308	0.59
309	0.49
310	0.38
311	0.28
312	0.18
313	0.12
314	0.09
315	0.07
316	0.06
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.02
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.02
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.02
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.08
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.11
382	0.15
383	0.17
384	0.18
385	0.2
386	0.24
387	0.24
388	0.27
389	0.27
390	0.25
391	0.24
392	0.24
393	0.24
394	0.2
395	0.21
396	0.19
397	0.19
398	0.17
399	0.16
400	0.15
401	0.13
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.08
406	0.09
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.13
426	0.15
427	0.14
428	0.14
429	0.15
430	0.16
431	0.16
432	0.14
433	0.12
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.03
445	0.04
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.02
465	0.02
466	0.03
467	0.06
468	0.1
469	0.11
470	0.12
471	0.13
472	0.16
473	0.18
474	0.23
475	0.28
476	0.28
477	0.31
478	0.31
479	0.3
480	0.28
481	0.26
482	0.22
483	0.13
484	0.1
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.06
497	0.08
498	0.14
499	0.14
500	0.16
501	0.18
502	0.18
503	0.23
504	0.24
505	0.25
506	0.25
507	0.27
508	0.33
509	0.33
510	0.35
511	0.33
512	0.31
513	0.28
514	0.25
515	0.26
516	0.21
517	0.23
518	0.31
519	0.3
520	0.31
521	0.35
522	0.37
523	0.38
524	0.44
525	0.48
526	0.46
527	0.47
528	0.47
529	0.43
530	0.48
531	0.46
532	0.39
533	0.32
534	0.28
535	0.32
536	0.39
537	0.43
538	0.44
539	0.51
540	0.61
541	0.68
542	0.74
543	0.79
544	0.82
545	0.89
546	0.89
547	0.82
548	0.8
549	0.77
550	0.68
551	0.64
552	0.57
553	0.46
554	0.38
555	0.33
556	0.25
557	0.21
558	0.22
559	0.15
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.14
564	0.16
565	0.19
566	0.22
567	0.27
568	0.33
569	0.42
570	0.51
571	0.55
572	0.59
573	0.66
574	0.66
575	0.68
576	0.7
577	0.64
578	0.58
579	0.58
580	0.55
581	0.47
582	0.4
583	0.33
584	0.26
585	0.23
586	0.21
587	0.14
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.11
599	0.1
600	0.12
601	0.14
602	0.16
603	0.24
604	0.29
605	0.36
606	0.46
607	0.54
608	0.62
609	0.71
610	0.78
611	0.8
612	0.87
613	0.89
614	0.9
615	0.89
616	0.86
617	0.85
618	0.83
619	0.77
620	0.66
621	0.58
622	0.49
623	0.42
624	0.35
625	0.24
626	0.16
627	0.13
628	0.13
629	0.1
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.11
634	0.16
635	0.2
636	0.26
637	0.33
638	0.41
639	0.49
640	0.6
641	0.69
642	0.76
643	0.82
644	0.87
645	0.91
646	0.93
647	0.93
648	0.93
649	0.92
650	0.85
651	0.83
652	0.83
653	0.77
654	0.7
655	0.63
656	0.55
657	0.47
658	0.43
659	0.35
660	0.29
661	0.25
662	0.22
663	0.2
664	0.17
665	0.16
666	0.15
667	0.15
668	0.11
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.07
673	0.09
674	0.09
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.11
680	0.15
681	0.21
682	0.27
683	0.32
684	0.41
685	0.5
686	0.59
687	0.66
688	0.75
689	0.79
690	0.82
691	0.84
692	0.8
693	0.76
694	0.76
695	0.69
696	0.61
697	0.51
698	0.47
699	0.41
700	0.38
701	0.32
702	0.24
703	0.19
704	0.16
705	0.16
706	0.11
707	0.09
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.08
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.05
723	0.06
724	0.05
725	0.06
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.07
731	0.08
732	0.09
733	0.13
734	0.16
735	0.2
736	0.2
737	0.21

V5GKD5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer