Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GRW3

Protein Details
Accession V5GRW3    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-147GESSSKSEKKEKKEKKDKKEKKEKKEKKSTAPAPVEBasic
346-373YLKKVERARVQKDKLERRKRKAEAVGGEBasic
380-400MEKSRTFKQRKVVQKDVRDQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-140KSEKKEKKEKKDKKEKKEKKEKKS
351-367ERARVQKDKLERRKRKA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MVSFNCDGCGDVVKKPKLIQHYNRCYAPVTCLDCSKQFNSPNEFKAHNSCVSEAEKYERTVYRGPKHADSQNGTSQKGKSPTKVQKVEEVKTPSKAEEKRDEDVAVEAANEGESSSKSEKKEKKEKKDKKEKKEKKEKKSTAPAPVEVADDASGSDIDPAEHDQDDPMQAASEEARIIKPLSTSELEAFQKKQRKLGIVYISRIPPGMTPAKVRHILSNFGELGRIYLHQDSTKPGESKKRSSVAHYSEGWVEFTSKKVAKAAAEMLNAQPIGGLAASNSKKSGSGGGSSKMGKSSKRFADDVWTMKYLKGFKWHMLSEQMAQERASHAARLRTELSQSAYEQKDYLKKVERARVQKDKLERRKRKAEAVGGEVDDKSGMEKSRTFKQRKVVQKDVRDQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.46
4 0.49
5 0.57
6 0.61
7 0.63
8 0.7
9 0.74
10 0.73
11 0.69
12 0.63
13 0.53
14 0.48
15 0.45
16 0.4
17 0.35
18 0.37
19 0.39
20 0.41
21 0.44
22 0.42
23 0.41
24 0.43
25 0.48
26 0.52
27 0.55
28 0.55
29 0.54
30 0.54
31 0.49
32 0.5
33 0.48
34 0.44
35 0.4
36 0.37
37 0.36
38 0.37
39 0.36
40 0.3
41 0.31
42 0.29
43 0.28
44 0.33
45 0.31
46 0.33
47 0.38
48 0.45
49 0.46
50 0.52
51 0.55
52 0.55
53 0.59
54 0.59
55 0.6
56 0.56
57 0.55
58 0.55
59 0.54
60 0.5
61 0.47
62 0.44
63 0.43
64 0.46
65 0.44
66 0.41
67 0.48
68 0.56
69 0.63
70 0.68
71 0.64
72 0.65
73 0.68
74 0.65
75 0.62
76 0.6
77 0.53
78 0.5
79 0.5
80 0.42
81 0.44
82 0.45
83 0.45
84 0.47
85 0.49
86 0.47
87 0.47
88 0.45
89 0.37
90 0.34
91 0.27
92 0.17
93 0.12
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.09
102 0.13
103 0.17
104 0.2
105 0.3
106 0.37
107 0.46
108 0.57
109 0.63
110 0.71
111 0.78
112 0.86
113 0.88
114 0.93
115 0.93
116 0.93
117 0.95
118 0.93
119 0.93
120 0.95
121 0.94
122 0.93
123 0.94
124 0.91
125 0.89
126 0.9
127 0.85
128 0.84
129 0.77
130 0.67
131 0.58
132 0.5
133 0.41
134 0.3
135 0.24
136 0.14
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.22
177 0.29
178 0.29
179 0.32
180 0.31
181 0.33
182 0.34
183 0.39
184 0.42
185 0.37
186 0.38
187 0.37
188 0.35
189 0.31
190 0.28
191 0.21
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.13
196 0.16
197 0.18
198 0.23
199 0.26
200 0.26
201 0.27
202 0.26
203 0.29
204 0.26
205 0.28
206 0.24
207 0.2
208 0.2
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.17
220 0.21
221 0.2
222 0.23
223 0.32
224 0.36
225 0.41
226 0.45
227 0.47
228 0.43
229 0.47
230 0.53
231 0.48
232 0.48
233 0.43
234 0.38
235 0.33
236 0.33
237 0.28
238 0.2
239 0.17
240 0.12
241 0.13
242 0.17
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.2
247 0.18
248 0.21
249 0.25
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.21
254 0.21
255 0.2
256 0.17
257 0.11
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.03
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.19
271 0.13
272 0.17
273 0.2
274 0.21
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.35
283 0.38
284 0.41
285 0.42
286 0.38
287 0.44
288 0.45
289 0.44
290 0.4
291 0.36
292 0.32
293 0.32
294 0.35
295 0.29
296 0.26
297 0.31
298 0.3
299 0.32
300 0.37
301 0.37
302 0.36
303 0.38
304 0.38
305 0.33
306 0.35
307 0.33
308 0.28
309 0.27
310 0.25
311 0.22
312 0.23
313 0.21
314 0.18
315 0.19
316 0.24
317 0.24
318 0.28
319 0.29
320 0.28
321 0.29
322 0.29
323 0.3
324 0.26
325 0.27
326 0.31
327 0.3
328 0.29
329 0.27
330 0.29
331 0.33
332 0.33
333 0.39
334 0.4
335 0.45
336 0.52
337 0.61
338 0.65
339 0.67
340 0.74
341 0.78
342 0.74
343 0.75
344 0.77
345 0.79
346 0.81
347 0.83
348 0.84
349 0.83
350 0.88
351 0.87
352 0.86
353 0.84
354 0.82
355 0.77
356 0.72
357 0.67
358 0.58
359 0.54
360 0.44
361 0.35
362 0.26
363 0.19
364 0.15
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.21
369 0.25
370 0.36
371 0.46
372 0.51
373 0.53
374 0.61
375 0.67
376 0.73
377 0.78
378 0.79
379 0.79
380 0.83