FuNGI

V5ERV4

Protein Details

Accession

V5ERV4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-34	VYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHN	Hydrophilic
365-389	ADTSTAKKPTKKKKKAQREKEEAEA	Hydrophilic
406-434	AAATAKKPKKKMTKKEREEKERREKEEKE	Basic
452-474	AAANGKAKPKSKKKQKEEAAAAA	Hydrophilic
498-519	GSPEKDKKASPKKTAGKKPVTT	Hydrophilic
525-544	ASGKKKTPAKSDKKVPNTAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
371-478	KKPTKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAATAKKPKKKMTKKEREEKERREKEEKEKAEKEEKERKEKEAAAAAAANGKAKPKSKKKQKEEAAAAAAAAA
482-538	ASAEAASKATAKKDAPGSPEKDKKASPKKTAGKKPVTTTPATPASGKKKTPAKSDKK

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 10, nucl 7, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATTASVYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHNHHFRFERQNGMFLFDSPVKAFLGYIRDQKVPADLIDVLTDSGVQFFEGCLLVDVHDHRSHAAASASILGPRELHSMSAAGTLARGDRDASGGAIGEGALASTLFYLQEGGRYGARKLLGGASSSDPRTGGLGGVEIYRIVLHPSSETLWADIKMLDDFAGGMWSDQEALEVEAKILALTAPPLCLTPDPQATRIANLMLSSTALPSAYTPSQDSPFRSARKRGANSIEMEKEEANRQRREKIMRLMQHGHKGVVPPSGPAMGEGGPASAAAATAFVPTFDRMTFIERWRIGRNAALNGAPLGAPAPGAASASANGTAPAKGKDTKPAENDADTSTAKKPTKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAATAKKPKKKMTKKEREEKERREKEEKEKAEKEEKERKEKEAAAAAAANGKAKPKSKKKQKEEAAAAAAAAAAAAASAEAASKATAKKDAPGSPEKDKKASPKKTAGKKPVTTTPATPASGKKKTPAKSDKKVPNTAVPPTGSTDTPVLANATIQTPVLNSATPSVQNTPTPAHRAIPTPQLQQQAQMQQLTQQQLQQAALAGMFPGMNQMPFNTPQANAGGFGAGMQMMNFPPTSNPQATAAALAAMQGMGLGQFGGNAGMNFAGGNAAQMQQMMQMMQANGMGFGMNGFQPQGQQGQQQGQQQGQQGQQGQSGDMPVGVGLGGLANWGTGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.49
3	0.56
4	0.64
5	0.71
6	0.79
7	0.85
8	0.88
9	0.9
10	0.9
11	0.9
12	0.89
13	0.86
14	0.83
15	0.81
16	0.79
17	0.75
18	0.73
19	0.71
20	0.68
21	0.6
22	0.57
23	0.54
24	0.5
25	0.54
26	0.5
27	0.53
28	0.47
29	0.52
30	0.47
31	0.49
32	0.44
33	0.35
34	0.36
35	0.28
36	0.29
37	0.23
38	0.24
39	0.19
40	0.18
41	0.17
42	0.15
43	0.19
44	0.21
45	0.28
46	0.3
47	0.32
48	0.32
49	0.33
50	0.33
51	0.29
52	0.25
53	0.21
54	0.18
55	0.17
56	0.17
57	0.17
58	0.13
59	0.11
60	0.11
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.05
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.11
74	0.13
75	0.17
76	0.19
77	0.19
78	0.18
79	0.2
80	0.2
81	0.19
82	0.17
83	0.12
84	0.11
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.14
89	0.13
90	0.13
91	0.14
92	0.17
93	0.14
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.13
98	0.14
99	0.12
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.07
115	0.06
116	0.05
117	0.04
118	0.04
119	0.03
120	0.03
121	0.03
122	0.03
123	0.03
124	0.03
125	0.04
126	0.05
127	0.05
128	0.08
129	0.1
130	0.12
131	0.14
132	0.16
133	0.17
134	0.19
135	0.2
136	0.17
137	0.17
138	0.19
139	0.17
140	0.17
141	0.19
142	0.19
143	0.23
144	0.23
145	0.22
146	0.18
147	0.17
148	0.17
149	0.15
150	0.12
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.08
164	0.1
165	0.11
166	0.13
167	0.14
168	0.13
169	0.15
170	0.14
171	0.15
172	0.13
173	0.13
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.05
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.11
207	0.14
208	0.21
209	0.23
210	0.24
211	0.29
212	0.29
213	0.29
214	0.27
215	0.24
216	0.17
217	0.14
218	0.14
219	0.08
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.18
233	0.21
234	0.23
235	0.24
236	0.3
237	0.35
238	0.38
239	0.42
240	0.46
241	0.53
242	0.54
243	0.55
244	0.55
245	0.53
246	0.52
247	0.51
248	0.46
249	0.37
250	0.35
251	0.28
252	0.24
253	0.26
254	0.29
255	0.3
256	0.34
257	0.36
258	0.4
259	0.45
260	0.5
261	0.51
262	0.53
263	0.54
264	0.54
265	0.57
266	0.59
267	0.57
268	0.58
269	0.53
270	0.44
271	0.38
272	0.34
273	0.29
274	0.25
275	0.21
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.06
301	0.08
302	0.08
303	0.12
304	0.15
305	0.16
306	0.23
307	0.23
308	0.26
309	0.28
310	0.29
311	0.25
312	0.25
313	0.25
314	0.2
315	0.2
316	0.17
317	0.15
318	0.13
319	0.13
320	0.1
321	0.07
322	0.06
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.04
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.1
341	0.12
342	0.13
343	0.21
344	0.25
345	0.29
346	0.31
347	0.34
348	0.34
349	0.32
350	0.33
351	0.25
352	0.23
353	0.19
354	0.19
355	0.15
356	0.2
357	0.22
358	0.27
359	0.35
360	0.43
361	0.55
362	0.63
363	0.71
364	0.75
365	0.85
366	0.9
367	0.92
368	0.92
369	0.9
370	0.83
371	0.78
372	0.7
373	0.58
374	0.47
375	0.36
376	0.25
377	0.15
378	0.11
379	0.06
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.09
387	0.09
388	0.08
389	0.09
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.1
396	0.16
397	0.18
398	0.2
399	0.24
400	0.33
401	0.44
402	0.54
403	0.63
404	0.69
405	0.77
406	0.82
407	0.89
408	0.9
409	0.9
410	0.89
411	0.89
412	0.89
413	0.86
414	0.82
415	0.8
416	0.76
417	0.75
418	0.75
419	0.71
420	0.69
421	0.65
422	0.63
423	0.65
424	0.63
425	0.62
426	0.62
427	0.61
428	0.62
429	0.6
430	0.59
431	0.55
432	0.53
433	0.47
434	0.43
435	0.37
436	0.28
437	0.26
438	0.22
439	0.19
440	0.17
441	0.15
442	0.1
443	0.12
444	0.14
445	0.19
446	0.29
447	0.37
448	0.48
449	0.59
450	0.69
451	0.76
452	0.84
453	0.86
454	0.87
455	0.82
456	0.76
457	0.67
458	0.56
459	0.47
460	0.36
461	0.27
462	0.16
463	0.1
464	0.05
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.01
469	0.01
470	0.02
471	0.02
472	0.02
473	0.03
474	0.03
475	0.06
476	0.07
477	0.08
478	0.12
479	0.13
480	0.17
481	0.22
482	0.26
483	0.29
484	0.35
485	0.39
486	0.44
487	0.52
488	0.5
489	0.48
490	0.48
491	0.53
492	0.57
493	0.61
494	0.59
495	0.62
496	0.69
497	0.76
498	0.82
499	0.82
500	0.81
501	0.76
502	0.74
503	0.72
504	0.67
505	0.59
506	0.51
507	0.47
508	0.42
509	0.39
510	0.36
511	0.34
512	0.38
513	0.42
514	0.41
515	0.42
516	0.45
517	0.49
518	0.58
519	0.63
520	0.64
521	0.67
522	0.76
523	0.79
524	0.79
525	0.81
526	0.74
527	0.71
528	0.65
529	0.59
530	0.53
531	0.44
532	0.37
533	0.34
534	0.33
535	0.24
536	0.22
537	0.19
538	0.16
539	0.15
540	0.14
541	0.11
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.1
555	0.12
556	0.13
557	0.15
558	0.16
559	0.18
560	0.18
561	0.21
562	0.23
563	0.25
564	0.29
565	0.28
566	0.27
567	0.27
568	0.3
569	0.31
570	0.36
571	0.37
572	0.37
573	0.4
574	0.43
575	0.41
576	0.41
577	0.43
578	0.4
579	0.39
580	0.35
581	0.3
582	0.29
583	0.34
584	0.35
585	0.3
586	0.27
587	0.25
588	0.26
589	0.27
590	0.22
591	0.18
592	0.14
593	0.12
594	0.1
595	0.08
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.07
600	0.07
601	0.08
602	0.08
603	0.1
604	0.13
605	0.15
606	0.19
607	0.18
608	0.18
609	0.19
610	0.21
611	0.2
612	0.17
613	0.15
614	0.12
615	0.1
616	0.1
617	0.08
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.1
627	0.15
628	0.21
629	0.21
630	0.23
631	0.24
632	0.26
633	0.26
634	0.25
635	0.2
636	0.14
637	0.13
638	0.11
639	0.08
640	0.06
641	0.05
642	0.04
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.05
660	0.06
661	0.07
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.11
677	0.1
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.06
682	0.07
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.12
687	0.16
688	0.16
689	0.2
690	0.24
691	0.3
692	0.35
693	0.4
694	0.42
695	0.4
696	0.42
697	0.44
698	0.45
699	0.41
700	0.42
701	0.41
702	0.39
703	0.39
704	0.36
705	0.32
706	0.27
707	0.25
708	0.2
709	0.14
710	0.12
711	0.08
712	0.08
713	0.06
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04

V5ERV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer