Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GGP9

Protein Details
Accession V5GGP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-174IYALRKFFKLKHFRPNQLRAINHydrophilic
695-715ASSAKNGKKTQPQRRARDADFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, pero 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR004589  DNA_helicase_ATP-dep_RecQ  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032284  RecQ_Zn-bd  
IPR018982  RQC_domain  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0043138  F:3'-5' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF16124  RecQ_Zn_bind  
PF09382  RQC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS50967  HRDC  
CDD cd17920  DEXHc_RecQ  
cd18794  SF2_C_RecQ  
Amino Acid Sequences MPDANGAFQYRIKQAEDRRSETIFLEDEGDDPALFADIKPQPSSGSPFDDDDDLWPSEADDLLDLDPPHRLNVASTTNATYEPTHHPDLDDRNGGHFADAEILELSDDEDEVIEVEDSKVDVRYKRFGPSMQGPEEGDETAREPTYPWTKHVIYALRKFFKLKHFRPNQLRAINGTLRGADVFVLMPTGGGKSLCYQLPACVETGAANGITIVVSPLLSLIEDQVHHLIMADIPAVKLVGSGAMNSSDKRDALNAVRDRNSGLRLLYLTPEFIAGTSQAIELMDLLYSQKRLARFVVDEAHCVSSWGHDFRPNYTQLGIVREKYPTVPIMALTATANKQVIKDVKASLRMKNPLTLTSSFNRPNLEYQVRPKPGGRKLLDEILSLIRTSHQDECGIVYCNSKTMCETVADQLIQEGISAHHYHAGLGPVDKSTIQQQWQKDEIKIIVATIAFGMGIDKPDVRFVIHHSIPKSLEGYYQETGRAGRDGKSSVCYLYYSFGDVTKAQNMIQDNKEEKSQEAVERGLESLRRMQSYCTNDIECRRVQVLRYFGEDFTADRCHSTCDNCCRQSGAIQVKDVTELCIKAIQLVQTIKKQKGHWTMSHCVDVFLGSKAKKIREAGHDKLDMHGAGSVLPKAELVRLFEHLHSLQALGVYDVMNRAGFNTAYIRLGPKANAILSGKQPVEMQFSTKPTSSSASSAKNGKKTQPQRRARDADFAEFDDDAHDISHVSLTPPNARGNAARSRAQPSTSAVNGVNGIGDDDWIPVEMLEDSYDPNNDSDDNVPLAASNSGGGPGPSNGRRPAATNTRREMGGSSDDDFEIDPRSTDPNQQCYKELKKLDARLALKEKQTRGWLIPDHILQEISAIPPESATAFRLGCKGEHSQWLLKYADKYVDVCQRFLKTRKTDFDPRNIAARGPGWNSFIADSPRTAQPGSAAQSPATAATRQDRVAAPRKSAAVAAANLGQYAYEDGDASSGSIRPSSVSKNGMKAKAGRPSPKSGAMAVSKASSAAGVPPAKRITLNRPFMANGGGGLQIRAMPLLPSRGAANRPGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.57
4 0.58
5 0.59
6 0.57
7 0.56
8 0.49
9 0.45
10 0.35
11 0.28
12 0.25
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.18
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.15
24 0.19
25 0.22
26 0.24
27 0.24
28 0.25
29 0.28
30 0.35
31 0.3
32 0.32
33 0.31
34 0.32
35 0.33
36 0.33
37 0.3
38 0.26
39 0.27
40 0.21
41 0.19
42 0.17
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.21
60 0.25
61 0.24
62 0.26
63 0.27
64 0.27
65 0.27
66 0.27
67 0.22
68 0.21
69 0.26
70 0.3
71 0.32
72 0.31
73 0.32
74 0.36
75 0.42
76 0.44
77 0.42
78 0.37
79 0.36
80 0.37
81 0.36
82 0.3
83 0.24
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.11
107 0.14
108 0.19
109 0.23
110 0.3
111 0.32
112 0.38
113 0.41
114 0.4
115 0.44
116 0.48
117 0.52
118 0.48
119 0.48
120 0.43
121 0.41
122 0.4
123 0.32
124 0.23
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.19
132 0.28
133 0.28
134 0.3
135 0.35
136 0.36
137 0.38
138 0.44
139 0.45
140 0.44
141 0.51
142 0.58
143 0.55
144 0.56
145 0.56
146 0.55
147 0.57
148 0.59
149 0.58
150 0.59
151 0.64
152 0.73
153 0.8
154 0.83
155 0.82
156 0.76
157 0.71
158 0.64
159 0.61
160 0.54
161 0.45
162 0.38
163 0.28
164 0.24
165 0.22
166 0.18
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.2
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.14
192 0.12
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.2
240 0.3
241 0.31
242 0.35
243 0.37
244 0.37
245 0.38
246 0.37
247 0.34
248 0.26
249 0.22
250 0.18
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.15
280 0.18
281 0.18
282 0.21
283 0.28
284 0.26
285 0.27
286 0.27
287 0.27
288 0.23
289 0.23
290 0.19
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.2
296 0.21
297 0.23
298 0.29
299 0.27
300 0.25
301 0.24
302 0.25
303 0.22
304 0.27
305 0.26
306 0.23
307 0.23
308 0.22
309 0.23
310 0.21
311 0.21
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.09
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.16
327 0.19
328 0.18
329 0.21
330 0.23
331 0.25
332 0.34
333 0.36
334 0.36
335 0.4
336 0.43
337 0.41
338 0.42
339 0.4
340 0.34
341 0.36
342 0.32
343 0.3
344 0.27
345 0.33
346 0.31
347 0.32
348 0.31
349 0.28
350 0.29
351 0.32
352 0.33
353 0.3
354 0.34
355 0.42
356 0.43
357 0.43
358 0.44
359 0.45
360 0.47
361 0.53
362 0.48
363 0.44
364 0.44
365 0.48
366 0.46
367 0.38
368 0.33
369 0.26
370 0.24
371 0.19
372 0.16
373 0.11
374 0.11
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.18
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.16
387 0.16
388 0.14
389 0.13
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.13
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.08
402 0.06
403 0.04
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.13
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.11
420 0.14
421 0.17
422 0.22
423 0.24
424 0.28
425 0.34
426 0.35
427 0.32
428 0.31
429 0.27
430 0.24
431 0.22
432 0.16
433 0.12
434 0.1
435 0.09
436 0.06
437 0.06
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.11
451 0.18
452 0.2
453 0.23
454 0.23
455 0.26
456 0.26
457 0.26
458 0.23
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.18
463 0.16
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.15
477 0.14
478 0.13
479 0.12
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.1
492 0.13
493 0.14
494 0.17
495 0.17
496 0.2
497 0.2
498 0.2
499 0.22
500 0.19
501 0.18
502 0.17
503 0.18
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.14
508 0.13
509 0.13
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.13
514 0.14
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.22
519 0.26
520 0.28
521 0.25
522 0.25
523 0.26
524 0.28
525 0.3
526 0.23
527 0.2
528 0.19
529 0.17
530 0.18
531 0.2
532 0.22
533 0.2
534 0.23
535 0.23
536 0.21
537 0.21
538 0.2
539 0.16
540 0.14
541 0.15
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.13
547 0.16
548 0.2
549 0.26
550 0.33
551 0.34
552 0.34
553 0.33
554 0.32
555 0.31
556 0.33
557 0.32
558 0.26
559 0.26
560 0.26
561 0.25
562 0.25
563 0.23
564 0.17
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.1
573 0.12
574 0.14
575 0.16
576 0.21
577 0.26
578 0.28
579 0.31
580 0.32
581 0.38
582 0.45
583 0.48
584 0.46
585 0.48
586 0.51
587 0.49
588 0.51
589 0.42
590 0.33
591 0.28
592 0.24
593 0.18
594 0.13
595 0.15
596 0.11
597 0.15
598 0.18
599 0.19
600 0.22
601 0.24
602 0.28
603 0.34
604 0.42
605 0.42
606 0.46
607 0.47
608 0.44
609 0.42
610 0.37
611 0.27
612 0.19
613 0.16
614 0.1
615 0.08
616 0.09
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.06
622 0.08
623 0.08
624 0.1
625 0.11
626 0.14
627 0.16
628 0.16
629 0.19
630 0.17
631 0.16
632 0.14
633 0.13
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.12
655 0.13
656 0.13
657 0.12
658 0.13
659 0.12
660 0.15
661 0.16
662 0.17
663 0.17
664 0.22
665 0.2
666 0.19
667 0.2
668 0.18
669 0.22
670 0.19
671 0.21
672 0.2
673 0.23
674 0.24
675 0.24
676 0.23
677 0.19
678 0.22
679 0.2
680 0.2
681 0.22
682 0.23
683 0.26
684 0.33
685 0.36
686 0.41
687 0.42
688 0.44
689 0.5
690 0.56
691 0.64
692 0.67
693 0.73
694 0.74
695 0.81
696 0.82
697 0.74
698 0.73
699 0.65
700 0.59
701 0.51
702 0.43
703 0.35
704 0.28
705 0.25
706 0.17
707 0.14
708 0.1
709 0.08
710 0.07
711 0.05
712 0.05
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.09
717 0.1
718 0.14
719 0.16
720 0.18
721 0.18
722 0.19
723 0.2
724 0.23
725 0.29
726 0.3
727 0.31
728 0.32
729 0.37
730 0.37
731 0.37
732 0.33
733 0.29
734 0.3
735 0.26
736 0.26
737 0.21
738 0.2
739 0.19
740 0.17
741 0.14
742 0.09
743 0.09
744 0.06
745 0.06
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.06
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.09
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.11
769 0.11
770 0.1
771 0.11
772 0.09
773 0.08
774 0.06
775 0.05
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.13
782 0.15
783 0.2
784 0.22
785 0.24
786 0.25
787 0.27
788 0.33
789 0.39
790 0.44
791 0.47
792 0.49
793 0.49
794 0.49
795 0.46
796 0.39
797 0.32
798 0.29
799 0.24
800 0.22
801 0.21
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.16
806 0.14
807 0.12
808 0.1
809 0.1
810 0.15
811 0.16
812 0.25
813 0.3
814 0.36
815 0.42
816 0.43
817 0.46
818 0.49
819 0.54
820 0.54
821 0.51
822 0.49
823 0.52
824 0.55
825 0.58
826 0.59
827 0.54
828 0.54
829 0.58
830 0.55
831 0.54
832 0.55
833 0.51
834 0.48
835 0.5
836 0.46
837 0.42
838 0.43
839 0.4
840 0.37
841 0.39
842 0.35
843 0.32
844 0.29
845 0.26
846 0.2
847 0.17
848 0.14
849 0.11
850 0.11
851 0.09
852 0.08
853 0.08
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.1
858 0.12
859 0.12
860 0.13
861 0.16
862 0.17
863 0.16
864 0.19
865 0.23
866 0.24
867 0.3
868 0.34
869 0.36
870 0.37
871 0.41
872 0.38
873 0.36
874 0.35
875 0.31
876 0.3
877 0.26
878 0.27
879 0.28
880 0.36
881 0.35
882 0.34
883 0.36
884 0.37
885 0.43
886 0.47
887 0.51
888 0.5
889 0.57
890 0.63
891 0.67
892 0.72
893 0.71
894 0.75
895 0.73
896 0.66
897 0.65
898 0.58
899 0.5
900 0.43
901 0.39
902 0.34
903 0.3
904 0.3
905 0.25
906 0.25
907 0.26
908 0.23
909 0.25
910 0.24
911 0.22
912 0.21
913 0.22
914 0.24
915 0.25
916 0.25
917 0.21
918 0.2
919 0.24
920 0.27
921 0.28
922 0.26
923 0.24
924 0.25
925 0.25
926 0.24
927 0.2
928 0.17
929 0.15
930 0.19
931 0.23
932 0.23
933 0.26
934 0.27
935 0.33
936 0.42
937 0.43
938 0.42
939 0.42
940 0.43
941 0.4
942 0.38
943 0.33
944 0.28
945 0.25
946 0.23
947 0.22
948 0.2
949 0.19
950 0.18
951 0.14
952 0.1
953 0.11
954 0.1
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.08
959 0.08
960 0.08
961 0.08
962 0.09
963 0.09
964 0.1
965 0.1
966 0.11
967 0.15
968 0.2
969 0.24
970 0.3
971 0.34
972 0.42
973 0.5
974 0.53
975 0.54
976 0.56
977 0.57
978 0.59
979 0.63
980 0.63
981 0.61
982 0.65
983 0.66
984 0.65
985 0.6
986 0.53
987 0.51
988 0.46
989 0.43
990 0.36
991 0.31
992 0.24
993 0.22
994 0.2
995 0.14
996 0.11
997 0.11
998 0.17
999 0.2
1000 0.21
1001 0.27
1002 0.29
1003 0.3
1004 0.33
1005 0.36
1006 0.39
1007 0.45
1008 0.52
1009 0.49
1010 0.5
1011 0.49
1012 0.47
1013 0.44
1014 0.34
1015 0.24
1016 0.18
1017 0.18
1018 0.15
1019 0.14
1020 0.13
1021 0.11
1022 0.11
1023 0.11
1024 0.1
1025 0.09
1026 0.12
1027 0.16
1028 0.16
1029 0.16
1030 0.19
1031 0.24
1032 0.26
1033 0.31