FuNGI

V5EGE8

Protein Details

Accession

V5EGE8

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MSKGKDSPAKDGKRKSKFSDAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-30	PAKDGKRKSKFSDAADSPKKSKK
503-512	PRKGKAGGRK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MSKGKDSPAKDGKRKSKFSDAADSPKKSKKASTSANAAASSSTSKAGSGQATLSVKGSGSSFKQLSKSGAAFASFADYNPAPSTKFSIYRADGLPDETGASTNDTDERLLLAGETDTMAYVGNNFEFGSSSEARGYTGHYMVGVYDPSSSSVTLRAVPTFQVARSIKANSSLSSISSKRTFADYGEMTAARRALGDAFGNRKQKANARNQDRMKVDTANMEVILDDFTGGIQDNLASLPSLDEVLASSTSSRPMPPANLDAKHPAEAYRISDLIPSEIFKSLPIQKLIDNVSDPEALKELLPYSKDFPAWIWSRLVDNLQRSSHLSGGSGGKKHTTFDEDEDEAASVTNAEDVMMMPALGATEDKEDAKTKVRIAYYMSLLWYIQSRPKSVSQRGKLITALKLDGEDANKRIVKAILGTFTETPANSDRAVMSAFHQTKVLAYMCALALHLDNFSVDHDKLARNCNIPPATLRELFRTLGCTASVVGGEKRMVLKTPFTLPQPRKGKAGGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.82
3	0.82
4	0.79
5	0.76
6	0.76
7	0.72
8	0.73
9	0.74
10	0.72
11	0.68
12	0.69
13	0.67
14	0.6
15	0.61
16	0.59
17	0.6
18	0.64
19	0.65
20	0.66
21	0.67
22	0.68
23	0.61
24	0.52
25	0.42
26	0.34
27	0.28
28	0.21
29	0.17
30	0.13
31	0.13
32	0.14
33	0.17
34	0.17
35	0.16
36	0.15
37	0.2
38	0.21
39	0.22
40	0.21
41	0.18
42	0.17
43	0.16
44	0.17
45	0.14
46	0.15
47	0.22
48	0.23
49	0.25
50	0.29
51	0.31
52	0.33
53	0.35
54	0.33
55	0.29
56	0.28
57	0.26
58	0.23
59	0.2
60	0.21
61	0.16
62	0.15
63	0.17
64	0.15
65	0.17
66	0.18
67	0.19
68	0.16
69	0.17
70	0.22
71	0.21
72	0.25
73	0.26
74	0.32
75	0.33
76	0.37
77	0.37
78	0.35
79	0.31
80	0.29
81	0.27
82	0.2
83	0.18
84	0.13
85	0.13
86	0.1
87	0.12
88	0.1
89	0.11
90	0.12
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.09
96	0.09
97	0.07
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.06
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.08
115	0.13
116	0.12
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.17
123	0.14
124	0.14
125	0.12
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.09
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.11
140	0.13
141	0.14
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.16
146	0.15
147	0.14
148	0.2
149	0.2
150	0.22
151	0.24
152	0.25
153	0.23
154	0.27
155	0.28
156	0.2
157	0.22
158	0.2
159	0.19
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.21
164	0.22
165	0.19
166	0.22
167	0.21
168	0.17
169	0.22
170	0.19
171	0.18
172	0.2
173	0.19
174	0.16
175	0.17
176	0.16
177	0.1
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.11
184	0.16
185	0.22
186	0.26
187	0.27
188	0.29
189	0.3
190	0.35
191	0.41
192	0.47
193	0.5
194	0.53
195	0.62
196	0.63
197	0.67
198	0.62
199	0.56
200	0.48
201	0.4
202	0.33
203	0.26
204	0.25
205	0.18
206	0.16
207	0.13
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.05
212	0.04
213	0.03
214	0.03
215	0.04
216	0.04
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.12
243	0.17
244	0.2
245	0.2
246	0.21
247	0.25
248	0.25
249	0.24
250	0.22
251	0.17
252	0.15
253	0.15
254	0.16
255	0.13
256	0.12
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.11
268	0.15
269	0.18
270	0.19
271	0.19
272	0.19
273	0.22
274	0.24
275	0.21
276	0.17
277	0.14
278	0.15
279	0.15
280	0.15
281	0.12
282	0.11
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.09
288	0.1
289	0.11
290	0.13
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.19
296	0.2
297	0.21
298	0.19
299	0.17
300	0.19
301	0.19
302	0.22
303	0.19
304	0.2
305	0.22
306	0.22
307	0.22
308	0.23
309	0.24
310	0.23
311	0.19
312	0.16
313	0.15
314	0.2
315	0.22
316	0.21
317	0.2
318	0.21
319	0.21
320	0.22
321	0.21
322	0.2
323	0.18
324	0.2
325	0.24
326	0.22
327	0.22
328	0.22
329	0.2
330	0.16
331	0.14
332	0.1
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.07
351	0.07
352	0.09
353	0.11
354	0.13
355	0.19
356	0.21
357	0.22
358	0.27
359	0.27
360	0.27
361	0.29
362	0.31
363	0.28
364	0.26
365	0.24
366	0.19
367	0.19
368	0.18
369	0.16
370	0.14
371	0.17
372	0.18
373	0.19
374	0.22
375	0.3
376	0.38
377	0.46
378	0.54
379	0.54
380	0.61
381	0.61
382	0.59
383	0.55
384	0.51
385	0.45
386	0.37
387	0.32
388	0.24
389	0.22
390	0.21
391	0.2
392	0.19
393	0.19
394	0.17
395	0.23
396	0.24
397	0.24
398	0.25
399	0.23
400	0.21
401	0.22
402	0.23
403	0.21
404	0.21
405	0.24
406	0.22
407	0.22
408	0.23
409	0.19
410	0.19
411	0.18
412	0.19
413	0.16
414	0.17
415	0.16
416	0.15
417	0.16
418	0.14
419	0.13
420	0.21
421	0.23
422	0.22
423	0.23
424	0.21
425	0.21
426	0.25
427	0.23
428	0.14
429	0.13
430	0.14
431	0.13
432	0.14
433	0.13
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.1
442	0.13
443	0.12
444	0.14
445	0.17
446	0.22
447	0.26
448	0.33
449	0.36
450	0.34
451	0.36
452	0.43
453	0.41
454	0.38
455	0.38
456	0.38
457	0.39
458	0.41
459	0.41
460	0.37
461	0.39
462	0.39
463	0.36
464	0.33
465	0.27
466	0.24
467	0.22
468	0.17
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.14
473	0.14
474	0.15
475	0.15
476	0.17
477	0.19
478	0.19
479	0.22
480	0.22
481	0.26
482	0.27
483	0.33
484	0.35
485	0.38
486	0.48
487	0.48
488	0.56
489	0.6
490	0.59
491	0.58
492	0.6

V5EGE8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer