FuNGI

V5GQH9

Protein Details

Accession

V5GQH9

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
298-322	EGDVGFKKPKTKRKKAAKVKISFDD	Basic
667-697	SHVFHGKKPGTKKQEKRLKKIEDEKKRERMA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
80-90	KAQAKRDAARR
125-135	KKRAKEHAARR
304-316	KKPKTKRKKAAKV
672-695	GKKPGTKKQEKRLKKIEDEKKRER

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 14.5, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MSEFQKEELSLEETNKLRISLGLKPLVADDEPAPSKGSSSDIDVAPKLDGDALASKNFQDKQERERREREDIEVKERLAKAQAKRDAARRLKGPTLGDAEASGEASTSASGSGSKDTLKWLEESKKRAKEHAARRAKQLEEEEALEQAQYRESDLAGLRVGHDADEFDEGEERILTLRDAGVLDDADDELMDSALDQAERDAKNIERKKGAKEYTGLDDEETLSGRKRGVLSKYDADLPEGDLATAEASGFRLGGSTSAADRHAKLRQEAEEEARRANKQLLSLDYTKNQEVSDYLQEGDVGFKKPKTKRKKAAKVKISFDDDQDAGEPSSTAAASTNILADVEMEEAKVSAKPARRQETDNFVDDDELQASLARSRRLKAKKTFNKMTPEMIAKNLAAQRAAEEAERSATNGVATPVIANGADTANGSGEVPDGQGALTFDETSEFVRAIRERPTEVEVPRRARTIKEESVDVKLAPAADVKREEFAGVIDVPMRELLTSNIKTEQDDDAEATLTPDHVKEEPEKGETLEAIVAAAAKDVKPEVKDNEPVIGRGMAGTLSFLRQQGMIAQANPELKSREEQQRQYDAWLAARRREEQDRELARQASKASGSSVDQATREVQNRNREVEEARLAQDRFRDYKPDVEIKYHDEFGRDLDQKEAWKHLSHVFHGKKPGTKKQEKRLKKIEDEKKRERMAAGDTPTGMSAAFQSRSERTGKAHMVLSVGSRGSAPQENDLLDGKGAGSAGMQLKKAVRQNGPSAKGKKTDGEMLSPAPGLDSTGAASVAANGDGATTTTKTGGWARVGSATPAPSTATTVAAGGSGFKRIAAASASGDSPAAADAGTGPSNGPFRLAFGGVKRKAEDQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.26
4	0.22
5	0.24
6	0.26
7	0.27
8	0.33
9	0.35
10	0.34
11	0.34
12	0.34
13	0.34
14	0.3
15	0.25
16	0.18
17	0.21
18	0.22
19	0.23
20	0.24
21	0.21
22	0.21
23	0.2
24	0.22
25	0.16
26	0.2
27	0.24
28	0.23
29	0.27
30	0.27
31	0.27
32	0.24
33	0.23
34	0.17
35	0.14
36	0.12
37	0.11
38	0.16
39	0.17
40	0.18
41	0.19
42	0.19
43	0.25
44	0.28
45	0.3
46	0.35
47	0.37
48	0.46
49	0.56
50	0.64
51	0.66
52	0.72
53	0.74
54	0.74
55	0.73
56	0.7
57	0.69
58	0.65
59	0.64
60	0.59
61	0.53
62	0.51
63	0.48
64	0.42
65	0.4
66	0.42
67	0.42
68	0.48
69	0.54
70	0.54
71	0.59
72	0.65
73	0.68
74	0.68
75	0.68
76	0.63
77	0.62
78	0.6
79	0.6
80	0.54
81	0.49
82	0.47
83	0.41
84	0.36
85	0.3
86	0.26
87	0.21
88	0.2
89	0.14
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.07
99	0.09
100	0.1
101	0.12
102	0.12
103	0.16
104	0.19
105	0.19
106	0.2
107	0.25
108	0.34
109	0.39
110	0.47
111	0.53
112	0.59
113	0.6
114	0.63
115	0.66
116	0.67
117	0.71
118	0.74
119	0.75
120	0.7
121	0.76
122	0.77
123	0.68
124	0.64
125	0.57
126	0.52
127	0.43
128	0.42
129	0.34
130	0.28
131	0.26
132	0.2
133	0.17
134	0.12
135	0.12
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.14
141	0.13
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.12
146	0.13
147	0.13
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.11
153	0.1
154	0.09
155	0.11
156	0.1
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.03
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.12
186	0.13
187	0.14
188	0.16
189	0.19
190	0.3
191	0.36
192	0.4
193	0.43
194	0.45
195	0.52
196	0.59
197	0.58
198	0.52
199	0.49
200	0.48
201	0.45
202	0.45
203	0.38
204	0.28
205	0.25
206	0.22
207	0.19
208	0.17
209	0.12
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.13
214	0.15
215	0.2
216	0.24
217	0.29
218	0.33
219	0.36
220	0.37
221	0.39
222	0.37
223	0.32
224	0.28
225	0.24
226	0.2
227	0.16
228	0.14
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.06
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.16
250	0.2
251	0.22
252	0.24
253	0.27
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.34
258	0.36
259	0.35
260	0.35
261	0.34
262	0.32
263	0.3
264	0.31
265	0.27
266	0.23
267	0.25
268	0.25
269	0.27
270	0.3
271	0.3
272	0.3
273	0.31
274	0.28
275	0.26
276	0.23
277	0.18
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.15
282	0.14
283	0.13
284	0.14
285	0.13
286	0.15
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.15
291	0.24
292	0.31
293	0.41
294	0.49
295	0.58
296	0.66
297	0.76
298	0.85
299	0.88
300	0.91
301	0.92
302	0.88
303	0.83
304	0.79
305	0.74
306	0.64
307	0.54
308	0.46
309	0.36
310	0.29
311	0.24
312	0.18
313	0.12
314	0.11
315	0.09
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.09
339	0.15
340	0.21
341	0.3
342	0.37
343	0.39
344	0.43
345	0.46
346	0.51
347	0.49
348	0.45
349	0.37
350	0.3
351	0.28
352	0.24
353	0.2
354	0.12
355	0.09
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.08
360	0.11
361	0.13
362	0.14
363	0.16
364	0.25
365	0.32
366	0.41
367	0.47
368	0.56
369	0.62
370	0.7
371	0.76
372	0.73
373	0.74
374	0.67
375	0.61
376	0.52
377	0.46
378	0.38
379	0.31
380	0.26
381	0.18
382	0.2
383	0.19
384	0.16
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.11
389	0.12
390	0.09
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.03
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.08
436	0.09
437	0.1
438	0.15
439	0.16
440	0.16
441	0.18
442	0.22
443	0.24
444	0.25
445	0.31
446	0.31
447	0.35
448	0.35
449	0.36
450	0.33
451	0.3
452	0.35
453	0.34
454	0.33
455	0.3
456	0.31
457	0.3
458	0.32
459	0.32
460	0.25
461	0.17
462	0.13
463	0.12
464	0.1
465	0.11
466	0.08
467	0.1
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.12
472	0.12
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.05
484	0.05
485	0.07
486	0.13
487	0.14
488	0.15
489	0.18
490	0.18
491	0.18
492	0.2
493	0.2
494	0.14
495	0.13
496	0.13
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.08
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.07
507	0.09
508	0.11
509	0.15
510	0.17
511	0.18
512	0.18
513	0.17
514	0.17
515	0.15
516	0.13
517	0.09
518	0.07
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.05
527	0.05
528	0.07
529	0.09
530	0.12
531	0.15
532	0.19
533	0.23
534	0.24
535	0.28
536	0.27
537	0.25
538	0.23
539	0.2
540	0.16
541	0.12
542	0.11
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.13
555	0.13
556	0.13
557	0.14
558	0.16
559	0.18
560	0.18
561	0.18
562	0.15
563	0.15
564	0.17
565	0.22
566	0.3
567	0.35
568	0.4
569	0.45
570	0.5
571	0.49
572	0.49
573	0.48
574	0.38
575	0.36
576	0.37
577	0.32
578	0.3
579	0.33
580	0.34
581	0.34
582	0.4
583	0.4
584	0.37
585	0.45
586	0.45
587	0.46
588	0.47
589	0.45
590	0.39
591	0.37
592	0.34
593	0.27
594	0.23
595	0.19
596	0.16
597	0.15
598	0.15
599	0.17
600	0.17
601	0.16
602	0.16
603	0.17
604	0.18
605	0.21
606	0.23
607	0.26
608	0.3
609	0.38
610	0.41
611	0.43
612	0.42
613	0.4
614	0.38
615	0.36
616	0.35
617	0.28
618	0.27
619	0.29
620	0.28
621	0.27
622	0.3
623	0.3
624	0.29
625	0.28
626	0.32
627	0.28
628	0.34
629	0.38
630	0.42
631	0.39
632	0.39
633	0.4
634	0.4
635	0.42
636	0.38
637	0.33
638	0.27
639	0.25
640	0.25
641	0.3
642	0.27
643	0.25
644	0.24
645	0.26
646	0.28
647	0.3
648	0.31
649	0.25
650	0.24
651	0.26
652	0.3
653	0.32
654	0.31
655	0.4
656	0.4
657	0.42
658	0.49
659	0.49
660	0.49
661	0.53
662	0.6
663	0.6
664	0.66
665	0.71
666	0.74
667	0.81
668	0.85
669	0.86
670	0.87
671	0.85
672	0.84
673	0.86
674	0.86
675	0.86
676	0.86
677	0.86
678	0.85
679	0.79
680	0.71
681	0.62
682	0.55
683	0.5
684	0.48
685	0.43
686	0.35
687	0.32
688	0.3
689	0.29
690	0.26
691	0.18
692	0.11
693	0.09
694	0.12
695	0.13
696	0.13
697	0.17
698	0.19
699	0.22
700	0.25
701	0.24
702	0.24
703	0.3
704	0.32
705	0.32
706	0.32
707	0.3
708	0.29
709	0.27
710	0.25
711	0.2
712	0.17
713	0.14
714	0.12
715	0.11
716	0.14
717	0.18
718	0.18
719	0.19
720	0.21
721	0.21
722	0.23
723	0.24
724	0.21
725	0.16
726	0.15
727	0.11
728	0.1
729	0.09
730	0.07
731	0.06
732	0.09
733	0.14
734	0.17
735	0.17
736	0.19
737	0.21
738	0.27
739	0.33
740	0.37
741	0.37
742	0.4
743	0.5
744	0.57
745	0.61
746	0.64
747	0.63
748	0.61
749	0.61
750	0.58
751	0.52
752	0.47
753	0.5
754	0.43
755	0.42
756	0.4
757	0.36
758	0.35
759	0.31
760	0.26
761	0.18
762	0.16
763	0.12
764	0.1
765	0.09
766	0.08
767	0.08
768	0.09
769	0.08
770	0.08
771	0.08
772	0.08
773	0.07
774	0.06
775	0.05
776	0.06
777	0.06
778	0.07
779	0.08
780	0.08
781	0.09
782	0.1
783	0.1
784	0.13
785	0.17
786	0.21
787	0.22
788	0.23
789	0.23
790	0.27
791	0.28
792	0.28
793	0.27
794	0.24
795	0.21
796	0.21
797	0.21
798	0.17
799	0.19
800	0.18
801	0.16
802	0.14
803	0.14
804	0.13
805	0.12
806	0.11
807	0.11
808	0.11
809	0.12
810	0.11
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.14
815	0.12
816	0.14
817	0.13
818	0.15
819	0.16
820	0.15
821	0.15
822	0.13
823	0.12
824	0.1
825	0.08
826	0.05
827	0.05
828	0.06
829	0.09
830	0.1
831	0.1
832	0.1
833	0.13
834	0.16
835	0.16
836	0.17
837	0.14
838	0.16
839	0.19
840	0.21
841	0.21
842	0.26
843	0.37
844	0.39
845	0.43

V5GQH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer