FuNGI

V5ED59

Protein Details

Accession

V5ED59

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
192-218	SDKPEGDRTPKARRKRRWDVAAPEEVK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
199-208	RTPKARRKRR

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MTEEADEIRRLQEARNASATKNKVAVGKLGGYDQDIYGAGKRSDYVRELPMDAASDDSGSDNDSGPSTGRRANPLDAYSAPQHLLHEFADEDLDPLKARSESRQVAARQSDYHLRRFNRELGDGKAVDAFAENGQTKGDEEESYKDRMRRAELEREEERVRRLIDAKEKEAKEKETERPDQDEWDIKPSTSSDKPEGDRTPKARRKRRWDVAAPEEVKPETNGHDIAEASTEAAPRKRRSRWDEAPTESKEVTSTADQDAAKPAAKRSRWDQAPTGEDATDADHKLQSATSSGASSASVSAVDPRNRYLSDEELNSILPSEGYTIVEPPADYAPVRTPASKLMAAPAPENGGGFMMQDEGATRAVLEEMIPDLPTDIPGVGQLAFFKTEDQAFFKKILTEQDESALSSEEQKERKIMRLLLKIKNGLPSQRKQALRQISDRARDFGPGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVGRILVVIEPLLIDEDYYARIEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAILPHLGSLVNCVEKGLEDEQQKVKTMTALALAALAEAAAPYGIESFENVLKPLWIGIRQHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDSDATLYFVKEVTPTLIREFQSADEEMKKIVLKVVKQCAATDGVTGAFLRDEMLSEFMKGFRTRRSALDRRTYKQVVETTVELANKVGVAEIVSRVVNELKDESEPFRKMVMETIQKVVSNLGAADIDERLEIQLIDGLIYAFQEQTVEDQIMLEGVATVINALGMRAKPYLTQIVSTALWRLNSKDAKTRQQAADLTTKLAVVIKQCGEDALLAKLGVVLFEQLGEEFPDALASIISAETAIANVVGMAQMSPPIKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADKGAESVSPREWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIARAIGPSDVLQVLTTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTTIPAILNEYRTPEVSVRTGALKSLAFLFQYIGEANKDYVYSVISCLEDALTDRDHVHRQTAASIVHHVALGTFGLGHEESLGHLFNLIWPNIFETSPHVLGSVTSAIESLEVALGPGVLLNHTLQGVFAPARKVREAYVRILNTTYLRSQDALTAYYPSFDALSTERNDYCRHALSSFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.38
3	0.39
4	0.38
5	0.46
6	0.47
7	0.45
8	0.43
9	0.4
10	0.37
11	0.36
12	0.39
13	0.34
14	0.34
15	0.31
16	0.29
17	0.27
18	0.24
19	0.24
20	0.19
21	0.17
22	0.14
23	0.14
24	0.16
25	0.2
26	0.18
27	0.17
28	0.19
29	0.2
30	0.25
31	0.28
32	0.29
33	0.29
34	0.32
35	0.33
36	0.33
37	0.31
38	0.28
39	0.24
40	0.21
41	0.16
42	0.13
43	0.12
44	0.12
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.1
49	0.11
50	0.11
51	0.12
52	0.12
53	0.15
54	0.17
55	0.22
56	0.24
57	0.3
58	0.33
59	0.38
60	0.41
61	0.4
62	0.41
63	0.36
64	0.38
65	0.35
66	0.33
67	0.29
68	0.24
69	0.24
70	0.21
71	0.22
72	0.17
73	0.16
74	0.14
75	0.13
76	0.14
77	0.13
78	0.13
79	0.11
80	0.12
81	0.1
82	0.1
83	0.12
84	0.13
85	0.15
86	0.2
87	0.29
88	0.32
89	0.36
90	0.43
91	0.43
92	0.49
93	0.52
94	0.49
95	0.42
96	0.43
97	0.48
98	0.45
99	0.51
100	0.51
101	0.49
102	0.53
103	0.55
104	0.58
105	0.54
106	0.56
107	0.51
108	0.48
109	0.52
110	0.45
111	0.41
112	0.35
113	0.29
114	0.23
115	0.2
116	0.16
117	0.1
118	0.15
119	0.15
120	0.13
121	0.14
122	0.14
123	0.14
124	0.15
125	0.16
126	0.13
127	0.14
128	0.2
129	0.23
130	0.27
131	0.32
132	0.32
133	0.35
134	0.38
135	0.41
136	0.44
137	0.47
138	0.53
139	0.54
140	0.58
141	0.57
142	0.58
143	0.56
144	0.51
145	0.48
146	0.42
147	0.37
148	0.34
149	0.36
150	0.37
151	0.43
152	0.46
153	0.5
154	0.54
155	0.54
156	0.58
157	0.58
158	0.55
159	0.53
160	0.53
161	0.55
162	0.55
163	0.61
164	0.58
165	0.6
166	0.58
167	0.54
168	0.51
169	0.49
170	0.41
171	0.4
172	0.36
173	0.29
174	0.29
175	0.27
176	0.3
177	0.28
178	0.31
179	0.31
180	0.36
181	0.39
182	0.45
183	0.51
184	0.51
185	0.54
186	0.56
187	0.62
188	0.64
189	0.72
190	0.75
191	0.78
192	0.82
193	0.85
194	0.89
195	0.88
196	0.89
197	0.87
198	0.84
199	0.84
200	0.76
201	0.66
202	0.59
203	0.49
204	0.4
205	0.33
206	0.27
207	0.2
208	0.2
209	0.19
210	0.17
211	0.18
212	0.17
213	0.16
214	0.16
215	0.12
216	0.1
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.19
221	0.25
222	0.31
223	0.39
224	0.45
225	0.54
226	0.61
227	0.69
228	0.73
229	0.76
230	0.77
231	0.76
232	0.76
233	0.7
234	0.65
235	0.55
236	0.45
237	0.36
238	0.28
239	0.24
240	0.18
241	0.17
242	0.14
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.23
247	0.22
248	0.23
249	0.22
250	0.26
251	0.29
252	0.32
253	0.35
254	0.37
255	0.45
256	0.48
257	0.52
258	0.52
259	0.5
260	0.51
261	0.5
262	0.46
263	0.35
264	0.29
265	0.25
266	0.22
267	0.19
268	0.16
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.14
273	0.14
274	0.12
275	0.1
276	0.11
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.11
288	0.17
289	0.2
290	0.21
291	0.23
292	0.26
293	0.26
294	0.29
295	0.27
296	0.26
297	0.26
298	0.26
299	0.25
300	0.22
301	0.22
302	0.19
303	0.17
304	0.12
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.17
322	0.19
323	0.18
324	0.18
325	0.21
326	0.25
327	0.24
328	0.21
329	0.2
330	0.22
331	0.22
332	0.22
333	0.19
334	0.17
335	0.15
336	0.15
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.11
377	0.15
378	0.17
379	0.17
380	0.18
381	0.18
382	0.19
383	0.19
384	0.23
385	0.24
386	0.24
387	0.23
388	0.24
389	0.24
390	0.22
391	0.21
392	0.16
393	0.12
394	0.13
395	0.15
396	0.18
397	0.19
398	0.19
399	0.24
400	0.25
401	0.3
402	0.31
403	0.34
404	0.37
405	0.45
406	0.52
407	0.53
408	0.55
409	0.53
410	0.5
411	0.5
412	0.44
413	0.43
414	0.42
415	0.4
416	0.43
417	0.48
418	0.49
419	0.46
420	0.52
421	0.53
422	0.51
423	0.52
424	0.53
425	0.51
426	0.55
427	0.53
428	0.47
429	0.39
430	0.36
431	0.32
432	0.28
433	0.25
434	0.2
435	0.21
436	0.19
437	0.19
438	0.17
439	0.18
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.09
448	0.11
449	0.11
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.13
457	0.14
458	0.13
459	0.17
460	0.19
461	0.17
462	0.18
463	0.18
464	0.18
465	0.18
466	0.18
467	0.13
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.15
472	0.16
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.15
477	0.12
478	0.11
479	0.09
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.11
502	0.13
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.12
507	0.1
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.08
523	0.1
524	0.11
525	0.1
526	0.13
527	0.14
528	0.15
529	0.15
530	0.14
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.08
539	0.09
540	0.08
541	0.07
542	0.06
543	0.05
544	0.04
545	0.04
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.02
551	0.03
552	0.03
553	0.04
554	0.05
555	0.08
556	0.13
557	0.19
558	0.23
559	0.26
560	0.33
561	0.43
562	0.51
563	0.57
564	0.58
565	0.6
566	0.62
567	0.66
568	0.62
569	0.55
570	0.48
571	0.43
572	0.39
573	0.32
574	0.27
575	0.2
576	0.18
577	0.14
578	0.12
579	0.07
580	0.05
581	0.04
582	0.03
583	0.02
584	0.02
585	0.02
586	0.02
587	0.02
588	0.03
589	0.04
590	0.04
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.08
599	0.08
600	0.12
601	0.13
602	0.16
603	0.19
604	0.2
605	0.21
606	0.2
607	0.18
608	0.14
609	0.13
610	0.11
611	0.09
612	0.08
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.05
617	0.04
618	0.04
619	0.02
620	0.02
621	0.02
622	0.02
623	0.02
624	0.02
625	0.02
626	0.02
627	0.03
628	0.03
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.08
637	0.07
638	0.08
639	0.11
640	0.16
641	0.26
642	0.28
643	0.29
644	0.3
645	0.3
646	0.29
647	0.28
648	0.26
649	0.19
650	0.18
651	0.17
652	0.16
653	0.14
654	0.13
655	0.11
656	0.07
657	0.04
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.06
671	0.06
672	0.07
673	0.06
674	0.07
675	0.07
676	0.09
677	0.09
678	0.12
679	0.16
680	0.16
681	0.17
682	0.18
683	0.16
684	0.17
685	0.17
686	0.16
687	0.13
688	0.13
689	0.12
690	0.13
691	0.12
692	0.1
693	0.12
694	0.13
695	0.15
696	0.21
697	0.27
698	0.3
699	0.3
700	0.3
701	0.28
702	0.28
703	0.25
704	0.19
705	0.13
706	0.09
707	0.09
708	0.09
709	0.07
710	0.05
711	0.04
712	0.05
713	0.04
714	0.05
715	0.05
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.09
721	0.12
722	0.13
723	0.14
724	0.16
725	0.22
726	0.23
727	0.29
728	0.37
729	0.43
730	0.48
731	0.57
732	0.58
733	0.57
734	0.63
735	0.58
736	0.49
737	0.47
738	0.42
739	0.35
740	0.31
741	0.29
742	0.23
743	0.24
744	0.23
745	0.18
746	0.15
747	0.12
748	0.09
749	0.08
750	0.06
751	0.04
752	0.04
753	0.05
754	0.05
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.07
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.09
763	0.09
764	0.1
765	0.12
766	0.14
767	0.19
768	0.2
769	0.2
770	0.2
771	0.19
772	0.18
773	0.21
774	0.24
775	0.25
776	0.25
777	0.27
778	0.27
779	0.27
780	0.27
781	0.23
782	0.17
783	0.11
784	0.09
785	0.07
786	0.05
787	0.05
788	0.06
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.04
797	0.06
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.05
804	0.06
805	0.04
806	0.04
807	0.04
808	0.04
809	0.05
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.06
817	0.05
818	0.03
819	0.03
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.02
824	0.03
825	0.03
826	0.03
827	0.05
828	0.06
829	0.08
830	0.08
831	0.09
832	0.09
833	0.12
834	0.18
835	0.16
836	0.17
837	0.16
838	0.18
839	0.19
840	0.18
841	0.18
842	0.14
843	0.15
844	0.15
845	0.16
846	0.21
847	0.25
848	0.27
849	0.34
850	0.38
851	0.46
852	0.51
853	0.56
854	0.5
855	0.52
856	0.51
857	0.46
858	0.47
859	0.39
860	0.35
861	0.28
862	0.26
863	0.2
864	0.19
865	0.17
866	0.11
867	0.15
868	0.14
869	0.14
870	0.14
871	0.14
872	0.13
873	0.13
874	0.12
875	0.09
876	0.09
877	0.08
878	0.08
879	0.09
880	0.08
881	0.07
882	0.06
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.04
888	0.05
889	0.06
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.06
896	0.05
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.03
903	0.03
904	0.04
905	0.04
906	0.03
907	0.03
908	0.03
909	0.03
910	0.03
911	0.03
912	0.03
913	0.03
914	0.07
915	0.07
916	0.08
917	0.09
918	0.1
919	0.11
920	0.13
921	0.16
922	0.2
923	0.22
924	0.23
925	0.26
926	0.28
927	0.34
928	0.38
929	0.46
930	0.45
931	0.5
932	0.53
933	0.59
934	0.58
935	0.57
936	0.54
937	0.53
938	0.5
939	0.44
940	0.42
941	0.36
942	0.32
943	0.28
944	0.24
945	0.15
946	0.13
947	0.12
948	0.1
949	0.08
950	0.07
951	0.08
952	0.08
953	0.1
954	0.11
955	0.13
956	0.14
957	0.18
958	0.18
959	0.22
960	0.22
961	0.23
962	0.26
963	0.26
964	0.25
965	0.21
966	0.21
967	0.22
968	0.21
969	0.21
970	0.17
971	0.18
972	0.22
973	0.22
974	0.24
975	0.22
976	0.27
977	0.33
978	0.42
979	0.47
980	0.46
981	0.52
982	0.57
983	0.62
984	0.57
985	0.49
986	0.41
987	0.33
988	0.3
989	0.24
990	0.17
991	0.11
992	0.11
993	0.1
994	0.09
995	0.1
996	0.09
997	0.11
998	0.11
999	0.09
1000	0.09
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.11
1005	0.11
1006	0.13
1007	0.16
1008	0.16
1009	0.2
1010	0.28
1011	0.34
1012	0.4
1013	0.43
1014	0.44
1015	0.44
1016	0.44
1017	0.41
1018	0.32
1019	0.3
1020	0.23
1021	0.19
1022	0.15
1023	0.13
1024	0.12
1025	0.11
1026	0.1
1027	0.05
1028	0.05
1029	0.05
1030	0.06
1031	0.06
1032	0.07
1033	0.1
1034	0.11
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.18
1038	0.18
1039	0.21
1040	0.21
1041	0.23
1042	0.23
1043	0.23
1044	0.24
1045	0.21
1046	0.24
1047	0.22
1048	0.23
1049	0.2
1050	0.22
1051	0.21
1052	0.19
1053	0.2
1054	0.16
1055	0.15
1056	0.16
1057	0.16
1058	0.13
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.13
1063	0.12
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.12
1067	0.13
1068	0.13
1069	0.12
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.11
1075	0.12
1076	0.12
1077	0.11
1078	0.12
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.13
1083	0.12
1084	0.13
1085	0.14
1086	0.18
1087	0.23
1088	0.24
1089	0.26
1090	0.26
1091	0.25
1092	0.27
1093	0.29
1094	0.27
1095	0.24
1096	0.26
1097	0.24
1098	0.21
1099	0.2
1100	0.18
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.1
1104	0.07
1105	0.06
1106	0.05
1107	0.07
1108	0.08
1109	0.08
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.08
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.08
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.13
1119	0.17
1120	0.17
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.19
1124	0.21
1125	0.21
1126	0.16
1127	0.17
1128	0.23
1129	0.24
1130	0.23
1131	0.2
1132	0.19
1133	0.19
1134	0.21
1135	0.17
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.1
1139	0.1
1140	0.1
1141	0.1
1142	0.07
1143	0.06
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.05
1149	0.06
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.09
1156	0.09
1157	0.08
1158	0.08
1159	0.11
1160	0.12
1161	0.14
1162	0.19
1163	0.22
1164	0.27
1165	0.29
1166	0.31
1167	0.31
1168	0.39
1169	0.41
1170	0.41
1171	0.47
1172	0.45
1173	0.44
1174	0.44
1175	0.43
1176	0.36
1177	0.36
1178	0.32
1179	0.26
1180	0.25
1181	0.25
1182	0.24
1183	0.26
1184	0.26
1185	0.24
1186	0.22
1187	0.23
1188	0.2
1189	0.2
1190	0.2
1191	0.16
1192	0.14
1193	0.12
1194	0.13
1195	0.12
1196	0.18
1197	0.2
1198	0.24
1199	0.26
1200	0.28
1201	0.31
1202	0.33
1203	0.36
1204	0.36
1205	0.36

V5ED59

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer