FuNGI

V5GGE3

Protein Details

Accession

V5GGE3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-114	TAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDP	Hydrophilic
167-188	GSARPPKSKLFQKKVREIHKAA	Hydrophilic
746-765	LVQHFRKRLKSEPHIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
171-182	PPKSKLFQKKVR
558-558	K
560-560	K

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKAEPGSVSIKAENGRANIQRPRPANGSTNNARSNLKAEEDRKDLPPPPPTTYRDIPLLSTNCGEWLTHLMKFAHHTRVDPNDTAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQPLTWPGPDDDLQRIEEVIKKEIAPKGPGADQSLIAPGGSARPPKSKLFQKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETSEEWESIRTPIPTGARALQDHIDELKGRQASFSNKDANGDIKMQDVKSTVKPEHGVKQESSSSATSHAPWIGKLEGDSSSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMSNEQVEQEYQKYQKTKEMDRWAMRNKPIASGSSITKQEDSAAWRSWPQVNRLSLPTGMSFGAGRRRNLMAVHGGELLRDDDDDDANRSRARKREDSPGGGYGELDYEEEFADDEEIHDPEADIVDDEEAKELEERLKREMARANNIGDDEDAAEEESAPEDEDQMLTGSGKQMMKIMRALGKREGNEAYEKDDDGRNPYATDDSEEDEEESYVANPEKAIQLAREERERKEKEEAKTKGKSTPGTGSGSNTPNDRAEERPVTVTTNKTQRPGAGHASLAQRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLARSVSPGRAESPPLASADAGAASSSGLKRRADSPTTPSSSVAGSSAAITHPEAKRAKTGNTGSRAGSPSGSPPGSKPASRAGSPGAPRVPANAVEAEIIQLIREGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKATNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.3
3	0.29
4	0.27
5	0.33
6	0.35
7	0.42
8	0.47
9	0.52
10	0.56
11	0.55
12	0.58
13	0.56
14	0.55
15	0.56
16	0.53
17	0.55
18	0.55
19	0.6
20	0.57
21	0.56
22	0.53
23	0.46
24	0.45
25	0.39
26	0.37
27	0.37
28	0.38
29	0.42
30	0.46
31	0.48
32	0.47
33	0.5
34	0.49
35	0.48
36	0.52
37	0.5
38	0.51
39	0.55
40	0.56
41	0.57
42	0.56
43	0.54
44	0.5
45	0.46
46	0.42
47	0.43
48	0.41
49	0.36
50	0.32
51	0.29
52	0.24
53	0.24
54	0.21
55	0.15
56	0.19
57	0.2
58	0.2
59	0.23
60	0.22
61	0.24
62	0.29
63	0.33
64	0.35
65	0.33
66	0.34
67	0.37
68	0.45
69	0.49
70	0.45
71	0.43
72	0.39
73	0.4
74	0.39
75	0.34
76	0.3
77	0.25
78	0.26
79	0.26
80	0.3
81	0.37
82	0.44
83	0.51
84	0.57
85	0.67
86	0.76
87	0.81
88	0.8
89	0.83
90	0.83
91	0.86
92	0.86
93	0.85
94	0.84
95	0.83
96	0.8
97	0.75
98	0.69
99	0.64
100	0.57
101	0.54
102	0.51
103	0.49
104	0.46
105	0.45
106	0.47
107	0.43
108	0.41
109	0.38
110	0.36
111	0.37
112	0.38
113	0.39
114	0.35
115	0.33
116	0.33
117	0.34
118	0.31
119	0.27
120	0.25
121	0.2
122	0.22
123	0.23
124	0.24
125	0.26
126	0.25
127	0.23
128	0.22
129	0.22
130	0.19
131	0.22
132	0.22
133	0.2
134	0.2
135	0.2
136	0.25
137	0.29
138	0.31
139	0.29
140	0.28
141	0.28
142	0.3
143	0.31
144	0.3
145	0.27
146	0.23
147	0.22
148	0.22
149	0.18
150	0.15
151	0.12
152	0.09
153	0.1
154	0.13
155	0.16
156	0.18
157	0.24
158	0.28
159	0.32
160	0.4
161	0.48
162	0.56
163	0.62
164	0.68
165	0.72
166	0.79
167	0.83
168	0.84
169	0.83
170	0.75
171	0.71
172	0.67
173	0.62
174	0.54
175	0.55
176	0.47
177	0.43
178	0.46
179	0.41
180	0.38
181	0.43
182	0.46
183	0.46
184	0.48
185	0.48
186	0.46
187	0.44
188	0.43
189	0.36
190	0.3
191	0.21
192	0.18
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.15
207	0.17
208	0.18
209	0.19
210	0.21
211	0.22
212	0.22
213	0.24
214	0.22
215	0.2
216	0.2
217	0.18
218	0.16
219	0.14
220	0.14
221	0.17
222	0.16
223	0.15
224	0.15
225	0.18
226	0.23
227	0.27
228	0.31
229	0.31
230	0.3
231	0.32
232	0.32
233	0.3
234	0.26
235	0.23
236	0.19
237	0.16
238	0.18
239	0.17
240	0.17
241	0.17
242	0.18
243	0.2
244	0.25
245	0.23
246	0.24
247	0.27
248	0.29
249	0.35
250	0.37
251	0.37
252	0.32
253	0.35
254	0.34
255	0.32
256	0.32
257	0.25
258	0.19
259	0.19
260	0.19
261	0.16
262	0.15
263	0.17
264	0.14
265	0.14
266	0.16
267	0.13
268	0.13
269	0.12
270	0.12
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.11
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.11
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.17
301	0.17
302	0.21
303	0.23
304	0.26
305	0.31
306	0.38
307	0.45
308	0.48
309	0.53
310	0.56
311	0.62
312	0.54
313	0.54
314	0.53
315	0.54
316	0.5
317	0.44
318	0.39
319	0.32
320	0.32
321	0.28
322	0.22
323	0.15
324	0.15
325	0.18
326	0.2
327	0.2
328	0.25
329	0.29
330	0.32
331	0.37
332	0.45
333	0.49
334	0.5
335	0.55
336	0.56
337	0.57
338	0.54
339	0.52
340	0.43
341	0.39
342	0.37
343	0.31
344	0.27
345	0.23
346	0.23
347	0.21
348	0.22
349	0.19
350	0.19
351	0.17
352	0.16
353	0.16
354	0.17
355	0.16
356	0.15
357	0.15
358	0.16
359	0.18
360	0.22
361	0.23
362	0.23
363	0.26
364	0.27
365	0.28
366	0.29
367	0.28
368	0.24
369	0.23
370	0.19
371	0.14
372	0.12
373	0.1
374	0.09
375	0.08
376	0.16
377	0.18
378	0.18
379	0.19
380	0.2
381	0.21
382	0.21
383	0.21
384	0.17
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.13
403	0.17
404	0.22
405	0.28
406	0.33
407	0.35
408	0.45
409	0.49
410	0.51
411	0.5
412	0.47
413	0.42
414	0.34
415	0.31
416	0.2
417	0.15
418	0.11
419	0.08
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.06
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.04
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.1
448	0.13
449	0.15
450	0.17
451	0.21
452	0.21
453	0.25
454	0.3
455	0.3
456	0.33
457	0.34
458	0.32
459	0.3
460	0.3
461	0.26
462	0.2
463	0.16
464	0.1
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.13
488	0.14
489	0.16
490	0.17
491	0.19
492	0.21
493	0.23
494	0.26
495	0.29
496	0.32
497	0.31
498	0.33
499	0.31
500	0.27
501	0.29
502	0.27
503	0.25
504	0.22
505	0.21
506	0.2
507	0.21
508	0.2
509	0.2
510	0.22
511	0.19
512	0.18
513	0.18
514	0.18
515	0.16
516	0.18
517	0.14
518	0.14
519	0.14
520	0.14
521	0.14
522	0.13
523	0.12
524	0.1
525	0.09
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.14
537	0.19
538	0.22
539	0.3
540	0.32
541	0.35
542	0.44
543	0.47
544	0.45
545	0.5
546	0.54
547	0.52
548	0.6
549	0.62
550	0.6
551	0.64
552	0.62
553	0.58
554	0.56
555	0.52
556	0.45
557	0.45
558	0.41
559	0.38
560	0.36
561	0.34
562	0.34
563	0.35
564	0.32
565	0.27
566	0.25
567	0.23
568	0.25
569	0.25
570	0.21
571	0.25
572	0.27
573	0.28
574	0.28
575	0.27
576	0.28
577	0.29
578	0.3
579	0.29
580	0.35
581	0.36
582	0.36
583	0.37
584	0.36
585	0.38
586	0.4
587	0.4
588	0.32
589	0.3
590	0.32
591	0.34
592	0.33
593	0.28
594	0.23
595	0.18
596	0.19
597	0.22
598	0.2
599	0.18
600	0.19
601	0.24
602	0.25
603	0.26
604	0.28
605	0.32
606	0.36
607	0.43
608	0.44
609	0.4
610	0.43
611	0.5
612	0.5
613	0.45
614	0.42
615	0.4
616	0.42
617	0.44
618	0.42
619	0.37
620	0.34
621	0.32
622	0.33
623	0.31
624	0.3
625	0.29
626	0.28
627	0.28
628	0.28
629	0.3
630	0.27
631	0.26
632	0.23
633	0.21
634	0.21
635	0.17
636	0.15
637	0.13
638	0.12
639	0.08
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.08
644	0.09
645	0.13
646	0.17
647	0.18
648	0.2
649	0.25
650	0.33
651	0.35
652	0.38
653	0.41
654	0.46
655	0.5
656	0.49
657	0.45
658	0.39
659	0.34
660	0.3
661	0.24
662	0.15
663	0.1
664	0.1
665	0.1
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.17
670	0.17
671	0.25
672	0.27
673	0.28
674	0.36
675	0.38
676	0.41
677	0.42
678	0.49
679	0.5
680	0.53
681	0.54
682	0.48
683	0.5
684	0.49
685	0.41
686	0.35
687	0.27
688	0.26
689	0.3
690	0.29
691	0.24
692	0.23
693	0.3
694	0.34
695	0.33
696	0.32
697	0.35
698	0.39
699	0.39
700	0.4
701	0.36
702	0.39
703	0.41
704	0.45
705	0.39
706	0.35
707	0.34
708	0.35
709	0.33
710	0.27
711	0.27
712	0.22
713	0.2
714	0.19
715	0.18
716	0.16
717	0.14
718	0.12
719	0.09
720	0.1
721	0.1
722	0.09
723	0.11
724	0.11
725	0.1
726	0.17
727	0.19
728	0.19
729	0.2
730	0.2
731	0.24
732	0.27
733	0.32
734	0.3
735	0.35
736	0.4
737	0.46
738	0.52
739	0.53
740	0.59
741	0.64
742	0.7
743	0.74
744	0.76
745	0.8
746	0.81
747	0.76
748	0.7
749	0.62
750	0.59
751	0.53
752	0.47
753	0.38
754	0.35
755	0.34
756	0.31
757	0.31
758	0.27
759	0.26
760	0.27
761	0.33
762	0.32
763	0.42
764	0.46
765	0.51
766	0.5
767	0.49

V5GGE3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer