FuNGI

V5F0R9

Protein Details

Accession

V5F0R9

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-352	VEENNARRLRKRRRTGKFPVPPNE	Hydrophilic
459-479	SEFERQKRSRRSAANKGKERS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
335-345	RRLRKRRRTGK
465-476	KRSRRSAANKGK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSYSNGTNVGPGASSSGSSSRSRRELIDRVRYPNPIPVPPYPPKLVKIPTEPSRYANPHFADRLASQQPIPMVVDVHAGMPIDLANFQNLWEGDFSEVVVPASATLDADDLDEADAFLLQDFATTLPPAATSNSASGAIGLISSLKATDDPASQATLQAALQQRHTQSLGPGAKAALAADDVTWLRRTEYLSAQQRQAQKEVQKPKVTERIDVSREAQLAKIEKSFKDAQKPLSSLVHPHKKGVKAEQVFDFLPDPETWATDYQIVRFIDHPGRIVNGVPQVDPRLDVALLRPVNAADGEQRVSYYLPAGEEISEDAEAPMTLIDNRDVEENNARRLRKRRRTGKFPVPPNEEDEDNENHSETKLLKKDYATPFKLSRDYVPKDTTVAAHDVLVLTLDDGIPDADPDADVDPIKGVKSGPSDAAAQDDDDDDLFGDDDDADNADDAAAGQVDSTLPPQSEFERQKRSRRSAANKGKERSEQPESQGIPSESRPKARAYYHKVGMRFTLRVWRSRFANNEKLRSRDRRYPGKWDAIVLSNRELQEREQLRRLHLRSQVDDVGELDPYEPDEDIQEVMLEGEDGDALASGTADRQLDGIQEDRAQAGVDDDDAQAARASDDEDGAEQGNDDEDDGSDDDEDDEDDDEDGTVDGDEELAALRAEAGEAGEDLDQDAEGGERRSRTRRAGASAASSSAAAIMDEDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.15
4	0.18
5	0.23
6	0.27
7	0.32
8	0.36
9	0.38
10	0.41
11	0.46
12	0.53
13	0.58
14	0.65
15	0.63
16	0.65
17	0.67
18	0.67
19	0.6
20	0.59
21	0.55
22	0.49
23	0.48
24	0.47
25	0.51
26	0.53
27	0.57
28	0.54
29	0.53
30	0.51
31	0.53
32	0.53
33	0.51
34	0.53
35	0.55
36	0.58
37	0.62
38	0.61
39	0.57
40	0.6
41	0.6
42	0.56
43	0.55
44	0.5
45	0.48
46	0.48
47	0.45
48	0.4
49	0.35
50	0.38
51	0.33
52	0.32
53	0.26
54	0.27
55	0.26
56	0.24
57	0.24
58	0.17
59	0.15
60	0.13
61	0.15
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.13
76	0.13
77	0.13
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.08
87	0.07
88	0.06
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.04
107	0.04
108	0.05
109	0.05
110	0.06
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.08
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.12
120	0.13
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.08
126	0.07
127	0.06
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.06
135	0.09
136	0.1
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.14
141	0.15
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.15
146	0.19
147	0.19
148	0.22
149	0.25
150	0.26
151	0.27
152	0.29
153	0.24
154	0.2
155	0.28
156	0.28
157	0.24
158	0.24
159	0.21
160	0.2
161	0.19
162	0.18
163	0.09
164	0.07
165	0.06
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.15
175	0.16
176	0.22
177	0.3
178	0.37
179	0.4
180	0.42
181	0.45
182	0.49
183	0.48
184	0.47
185	0.43
186	0.41
187	0.46
188	0.54
189	0.57
190	0.57
191	0.56
192	0.6
193	0.63
194	0.58
195	0.53
196	0.48
197	0.48
198	0.45
199	0.45
200	0.4
201	0.34
202	0.34
203	0.3
204	0.25
205	0.21
206	0.21
207	0.2
208	0.22
209	0.22
210	0.21
211	0.26
212	0.32
213	0.33
214	0.39
215	0.42
216	0.43
217	0.46
218	0.47
219	0.44
220	0.41
221	0.38
222	0.35
223	0.41
224	0.45
225	0.39
226	0.43
227	0.45
228	0.46
229	0.49
230	0.5
231	0.5
232	0.42
233	0.45
234	0.43
235	0.4
236	0.35
237	0.33
238	0.27
239	0.17
240	0.17
241	0.13
242	0.14
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.14
249	0.15
250	0.13
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.18
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.22
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.16
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.12
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.14
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.12
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.03
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.16
318	0.17
319	0.22
320	0.27
321	0.27
322	0.32
323	0.42
324	0.51
325	0.54
326	0.63
327	0.67
328	0.72
329	0.81
330	0.84
331	0.85
332	0.82
333	0.8
334	0.79
335	0.74
336	0.66
337	0.61
338	0.54
339	0.43
340	0.35
341	0.3
342	0.23
343	0.19
344	0.18
345	0.14
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.1
350	0.15
351	0.17
352	0.18
353	0.2
354	0.2
355	0.29
356	0.36
357	0.44
358	0.4
359	0.4
360	0.41
361	0.42
362	0.44
363	0.36
364	0.32
365	0.32
366	0.34
367	0.34
368	0.34
369	0.31
370	0.3
371	0.29
372	0.26
373	0.19
374	0.16
375	0.12
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.08
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.14
409	0.13
410	0.15
411	0.13
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.05
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.1
446	0.19
447	0.26
448	0.31
449	0.41
450	0.47
451	0.56
452	0.64
453	0.69
454	0.68
455	0.72
456	0.74
457	0.74
458	0.8
459	0.81
460	0.8
461	0.77
462	0.73
463	0.68
464	0.63
465	0.59
466	0.55
467	0.47
468	0.42
469	0.47
470	0.43
471	0.39
472	0.39
473	0.33
474	0.29
475	0.28
476	0.33
477	0.28
478	0.31
479	0.31
480	0.3
481	0.34
482	0.39
483	0.46
484	0.47
485	0.53
486	0.56
487	0.59
488	0.57
489	0.53
490	0.51
491	0.45
492	0.37
493	0.3
494	0.32
495	0.3
496	0.36
497	0.38
498	0.38
499	0.38
500	0.43
501	0.5
502	0.49
503	0.57
504	0.56
505	0.62
506	0.61
507	0.63
508	0.65
509	0.66
510	0.65
511	0.64
512	0.66
513	0.68
514	0.69
515	0.73
516	0.72
517	0.72
518	0.65
519	0.58
520	0.52
521	0.47
522	0.46
523	0.38
524	0.33
525	0.28
526	0.28
527	0.28
528	0.26
529	0.21
530	0.27
531	0.31
532	0.33
533	0.36
534	0.38
535	0.42
536	0.5
537	0.52
538	0.49
539	0.51
540	0.52
541	0.47
542	0.5
543	0.48
544	0.39
545	0.37
546	0.31
547	0.25
548	0.19
549	0.16
550	0.11
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.05
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.04
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.09
582	0.12
583	0.13
584	0.12
585	0.14
586	0.14
587	0.14
588	0.14
589	0.12
590	0.1
591	0.1
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.09
609	0.1
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.07
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.07
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.04
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.08
662	0.1
663	0.14
664	0.17
665	0.23
666	0.31
667	0.37
668	0.43
669	0.51
670	0.55
671	0.59
672	0.62
673	0.6
674	0.59
675	0.55
676	0.49
677	0.4
678	0.33
679	0.26
680	0.2
681	0.16
682	0.09
683	0.08

V5F0R9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer