Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5ED95

Protein Details
Accession V5ED95    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31YPSPTKGKSKSSPSKAAKAAHydrophilic
120-142PPLVRFRRKVRAQWDKERRHWVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-60KGKSKSSPSKAAKAAASRLAREAKAREREALKAAKQRAAAEKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.833, cyto 9, mito_nucl 8.666, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
Amino Acid Sequences MPNLNPPSDGDYPSPTKGKSKSSPSKAAKAAASRLAREAKAREREALKAAKQRAAAEKKRFLEVNRLRTSKSDTMRELIVDLDRTLFASGQPFAGCQESVTARFQEEGASVNMCDGVVAPPLVRFRRKVRAQWDKERRHWVPLDKEEVRREPMVIVYIDAKEVVQLVGEGAGLESWYGDLKRRLQAMDGEDPQVFLICQGLVKYYARLKANENRAYTARIRQQLADNQPADEPTTSTARRKAPPPTTTTTVPPQATVERSLLQLKLVHRCYVIHAASLVDGIEWLHQLTSDLSLKPYKSLRDTHLSFAVDMGRNTTSSSSAAVYGMMLQQIPRVTPAIAGSITTIYPSLNALLSAYGRCADEAEERGLLSGVQVQSNKDGTERRGNRTNLGLQLSKRIHAVVRGRNAELLVSNPTKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.41
4 0.43
5 0.49
6 0.51
7 0.58
8 0.64
9 0.69
10 0.77
11 0.77
12 0.8
13 0.76
14 0.73
15 0.67
16 0.62
17 0.58
18 0.56
19 0.52
20 0.45
21 0.46
22 0.46
23 0.43
24 0.42
25 0.44
26 0.45
27 0.51
28 0.51
29 0.52
30 0.5
31 0.52
32 0.54
33 0.55
34 0.53
35 0.52
36 0.54
37 0.52
38 0.52
39 0.52
40 0.55
41 0.58
42 0.6
43 0.61
44 0.65
45 0.63
46 0.65
47 0.63
48 0.55
49 0.56
50 0.56
51 0.57
52 0.57
53 0.57
54 0.53
55 0.53
56 0.59
57 0.55
58 0.53
59 0.5
60 0.43
61 0.44
62 0.44
63 0.42
64 0.34
65 0.27
66 0.23
67 0.17
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.13
82 0.12
83 0.09
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.14
109 0.18
110 0.2
111 0.24
112 0.29
113 0.39
114 0.45
115 0.51
116 0.57
117 0.64
118 0.7
119 0.77
120 0.81
121 0.8
122 0.81
123 0.83
124 0.74
125 0.7
126 0.67
127 0.63
128 0.61
129 0.58
130 0.59
131 0.53
132 0.56
133 0.55
134 0.52
135 0.48
136 0.39
137 0.35
138 0.27
139 0.23
140 0.21
141 0.16
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.07
166 0.1
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.24
173 0.25
174 0.28
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.22
179 0.21
180 0.17
181 0.12
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.11
192 0.16
193 0.18
194 0.19
195 0.23
196 0.29
197 0.38
198 0.42
199 0.4
200 0.37
201 0.37
202 0.39
203 0.36
204 0.35
205 0.32
206 0.3
207 0.3
208 0.29
209 0.32
210 0.35
211 0.38
212 0.39
213 0.33
214 0.29
215 0.29
216 0.27
217 0.25
218 0.18
219 0.14
220 0.09
221 0.13
222 0.14
223 0.16
224 0.22
225 0.26
226 0.29
227 0.33
228 0.4
229 0.43
230 0.46
231 0.5
232 0.5
233 0.49
234 0.48
235 0.47
236 0.42
237 0.4
238 0.35
239 0.3
240 0.26
241 0.24
242 0.24
243 0.22
244 0.2
245 0.15
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.25
253 0.25
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.26
258 0.3
259 0.27
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.17
281 0.17
282 0.2
283 0.23
284 0.24
285 0.26
286 0.3
287 0.33
288 0.39
289 0.41
290 0.41
291 0.43
292 0.4
293 0.35
294 0.32
295 0.32
296 0.25
297 0.22
298 0.21
299 0.16
300 0.16
301 0.17
302 0.16
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.15
349 0.18
350 0.19
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.15
356 0.11
357 0.14
358 0.13
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.22
363 0.24
364 0.24
365 0.22
366 0.26
367 0.28
368 0.38
369 0.42
370 0.46
371 0.53
372 0.55
373 0.55
374 0.58
375 0.58
376 0.52
377 0.52
378 0.5
379 0.42
380 0.49
381 0.47
382 0.42
383 0.37
384 0.34
385 0.3
386 0.33
387 0.41
388 0.4
389 0.47
390 0.5
391 0.5
392 0.5
393 0.48
394 0.42
395 0.34
396 0.27
397 0.25