Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EWD8

Protein Details
Accession V5EWD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-294SQVTEELKDKKEKKRKVKTEDDKKSKKSKKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-294KDKKEKKRKVKTEDDKKSKKSKKE
Subcellular Location(s) nucl 12, mito_nucl 11.999, mito 10.5, cyto_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSKRSRSDSESSSSSSSSGGSVVEAQTASVSTAKLPPSRNLSSIGYKPPRGFDPVSFSSSSPFLQKKLSASNAQQLWAVRIPAGLSPSQLDGVVIDLPRDTSDVKSASKPLGTIEVATASSSHAATYNFYASVPSALKGKAKKAQSSADSQLIAMASDAVASDEQSVASGQGAASELESLKLLVPAGNGDEDGKLVLAPVKVSRCLHLSIASPAETSKAEKVKETSNRFEEKKLPQQPWHLLKGNFKPAGTRLTTESTGTEPASQVTEELKDKKEKKRKVKTEDDKKSKKSKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.27
3 0.22
4 0.17
5 0.13
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.14
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.3
24 0.36
25 0.4
26 0.4
27 0.4
28 0.4
29 0.42
30 0.43
31 0.48
32 0.46
33 0.47
34 0.47
35 0.46
36 0.44
37 0.43
38 0.41
39 0.34
40 0.36
41 0.36
42 0.38
43 0.36
44 0.33
45 0.3
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.22
52 0.24
53 0.26
54 0.31
55 0.35
56 0.34
57 0.35
58 0.41
59 0.39
60 0.37
61 0.36
62 0.29
63 0.28
64 0.24
65 0.22
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.11
90 0.13
91 0.15
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.14
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.13
125 0.15
126 0.19
127 0.23
128 0.25
129 0.28
130 0.3
131 0.34
132 0.33
133 0.36
134 0.35
135 0.31
136 0.28
137 0.25
138 0.22
139 0.17
140 0.14
141 0.09
142 0.06
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.1
187 0.12
188 0.16
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.21
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.14
203 0.14
204 0.17
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.25
209 0.32
210 0.41
211 0.45
212 0.47
213 0.49
214 0.56
215 0.55
216 0.57
217 0.56
218 0.55
219 0.58
220 0.59
221 0.58
222 0.57
223 0.63
224 0.68
225 0.67
226 0.66
227 0.63
228 0.58
229 0.61
230 0.63
231 0.64
232 0.57
233 0.51
234 0.47
235 0.43
236 0.46
237 0.4
238 0.34
239 0.28
240 0.31
241 0.32
242 0.3
243 0.28
244 0.24
245 0.24
246 0.23
247 0.2
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.16
255 0.2
256 0.24
257 0.28
258 0.37
259 0.44
260 0.54
261 0.63
262 0.69
263 0.75
264 0.82
265 0.88
266 0.88
267 0.92
268 0.92
269 0.93
270 0.94
271 0.94
272 0.93
273 0.91
274 0.92