FuNGI

V5EMD1

Protein Details

Accession

V5EMD1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
805-828	LPTTRTASARRHARQRKDRATDAM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 11.333, cyto_nucl 6.333, cyto 6, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF01535 PPR PF13041 PPR_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MTRGEERKARTATDLKQRLKDARDKGRVLLPPSTAAASRGEQVAIEETIQEETGVVVDEAEMAALPYAERQEIRLQQLFARLALVHTTSDAWASSSETGTDSLQEIKSNLANRIAKILKEHDYELQTSVQQGTPNEASPAELTSNDAAALGPFPTARLDGRAPTLEPTESIDTKQAEDISSTDSSDELITRAETMVNDLSSSESRSFMLDSISKLVRSSSPSSPSSSRIPLGVASIEEWTALAVASARANDTSTLSRTLGLMQDCGYPPSLSLYNNVLDAFATQGQLEACQTWLEQMHTLGLVPDDHTYHSLVKAYATSSQYLPAITLLNTLEEAGRPASMATYTLLISRLLSTPTPSTQAVGWNAFYHMRLSAHPIPDAPLYALMIRACARGVPQPHDLGRLGVSEAERALDLFREMTTRYSVRPNAEVYNALILACARRKDFYLEAFRLLREMVELETTRSEGEGLRFAPDRWTFNVLLQGCARNRDLPRARWVLAEMVRCTAPLFEQGVREKLGREEVREMWGKRPDEESLCHVFHAYASYVPPVRRLVTVGSGSPETTEGTDSTATTGDNDPSTSSSTTPSSEIVATATAKSLELILSDPADAEEETTPGEAAQIFSALVPQTSSDLLAETRSLFARVLADQPSGHTEGPLGAVTAGVRLVNAYLAVLGAHLPVGMRGELLRSTLLPLDGQSEGLERGLFARLGATPNEHSYRVILEALREADGSTLPIVEDVWVRFQTYLGSHTAATGDTELTTTLAQDPDAGQITKCYSAYIHFHAKHASLDQAIGALRHFVSLYPPTLPTTRTASARRHARQRKDRATDAMLEGVDVDLSPLPVAKESLVGLVEMASPSTSASSGIGEDQTEKVGAMKPSPTLTFLDVELLHHRLVRFGRIKDVGFVSWVLHRYAAARRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.65
4	0.7
5	0.69
6	0.69
7	0.7
8	0.69
9	0.7
10	0.73
11	0.69
12	0.66
13	0.67
14	0.65
15	0.61
16	0.56
17	0.47
18	0.41
19	0.4
20	0.38
21	0.3
22	0.26
23	0.25
24	0.2
25	0.2
26	0.19
27	0.17
28	0.15
29	0.16
30	0.18
31	0.15
32	0.14
33	0.12
34	0.11
35	0.12
36	0.12
37	0.11
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.08
42	0.07
43	0.06
44	0.05
45	0.06
46	0.06
47	0.05
48	0.05
49	0.04
50	0.04
51	0.04
52	0.04
53	0.06
54	0.08
55	0.1
56	0.1
57	0.13
58	0.21
59	0.27
60	0.34
61	0.37
62	0.37
63	0.37
64	0.44
65	0.42
66	0.34
67	0.3
68	0.24
69	0.2
70	0.21
71	0.19
72	0.13
73	0.13
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.12
78	0.1
79	0.1
80	0.12
81	0.12
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.14
86	0.13
87	0.14
88	0.12
89	0.15
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.21
95	0.23
96	0.24
97	0.28
98	0.3
99	0.29
100	0.37
101	0.37
102	0.34
103	0.36
104	0.39
105	0.37
106	0.37
107	0.38
108	0.36
109	0.37
110	0.37
111	0.34
112	0.31
113	0.25
114	0.24
115	0.23
116	0.19
117	0.19
118	0.18
119	0.22
120	0.22
121	0.22
122	0.22
123	0.2
124	0.19
125	0.17
126	0.18
127	0.14
128	0.12
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.12
133	0.11
134	0.09
135	0.08
136	0.09
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.09
143	0.1
144	0.13
145	0.15
146	0.17
147	0.21
148	0.22
149	0.22
150	0.23
151	0.24
152	0.21
153	0.19
154	0.21
155	0.23
156	0.22
157	0.22
158	0.24
159	0.23
160	0.24
161	0.25
162	0.22
163	0.17
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.16
168	0.15
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.08
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.13
187	0.13
188	0.16
189	0.14
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.12
195	0.15
196	0.14
197	0.14
198	0.18
199	0.19
200	0.18
201	0.18
202	0.19
203	0.18
204	0.21
205	0.25
206	0.26
207	0.3
208	0.32
209	0.36
210	0.37
211	0.38
212	0.37
213	0.35
214	0.31
215	0.26
216	0.25
217	0.21
218	0.2
219	0.17
220	0.13
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.1
239	0.12
240	0.13
241	0.16
242	0.16
243	0.16
244	0.15
245	0.16
246	0.17
247	0.16
248	0.14
249	0.13
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.12
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.13
259	0.15
260	0.16
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.13
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.08
269	0.08
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.15
304	0.15
305	0.16
306	0.15
307	0.16
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.1
312	0.09
313	0.08
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.12
342	0.13
343	0.15
344	0.14
345	0.14
346	0.13
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.16
351	0.14
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.17
360	0.2
361	0.21
362	0.21
363	0.2
364	0.21
365	0.2
366	0.2
367	0.13
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.11
380	0.14
381	0.17
382	0.19
383	0.21
384	0.22
385	0.24
386	0.23
387	0.2
388	0.18
389	0.14
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.1
407	0.11
408	0.12
409	0.17
410	0.2
411	0.21
412	0.22
413	0.23
414	0.22
415	0.22
416	0.21
417	0.16
418	0.15
419	0.13
420	0.11
421	0.08
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.11
429	0.14
430	0.16
431	0.2
432	0.26
433	0.25
434	0.28
435	0.28
436	0.27
437	0.24
438	0.22
439	0.16
440	0.09
441	0.08
442	0.05
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.1
456	0.11
457	0.11
458	0.16
459	0.17
460	0.18
461	0.18
462	0.22
463	0.2
464	0.2
465	0.26
466	0.21
467	0.21
468	0.2
469	0.22
470	0.18
471	0.2
472	0.2
473	0.2
474	0.2
475	0.28
476	0.32
477	0.31
478	0.38
479	0.39
480	0.39
481	0.34
482	0.34
483	0.29
484	0.28
485	0.28
486	0.22
487	0.19
488	0.18
489	0.18
490	0.17
491	0.12
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.14
497	0.15
498	0.17
499	0.18
500	0.18
501	0.16
502	0.15
503	0.22
504	0.19
505	0.2
506	0.22
507	0.22
508	0.26
509	0.3
510	0.3
511	0.28
512	0.34
513	0.32
514	0.3
515	0.31
516	0.29
517	0.26
518	0.27
519	0.26
520	0.25
521	0.25
522	0.23
523	0.21
524	0.19
525	0.16
526	0.16
527	0.11
528	0.07
529	0.08
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.15
534	0.15
535	0.16
536	0.15
537	0.16
538	0.15
539	0.16
540	0.17
541	0.15
542	0.15
543	0.15
544	0.14
545	0.13
546	0.12
547	0.09
548	0.08
549	0.09
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.13
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.14
570	0.14
571	0.13
572	0.12
573	0.12
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.06
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.06
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.08
621	0.07
622	0.08
623	0.08
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.1
628	0.11
629	0.13
630	0.14
631	0.14
632	0.13
633	0.14
634	0.17
635	0.18
636	0.17
637	0.14
638	0.12
639	0.12
640	0.13
641	0.12
642	0.09
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.03
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.03
662	0.04
663	0.03
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.07
670	0.08
671	0.09
672	0.09
673	0.08
674	0.09
675	0.1
676	0.11
677	0.09
678	0.09
679	0.11
680	0.11
681	0.11
682	0.09
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.06
688	0.08
689	0.09
690	0.08
691	0.07
692	0.08
693	0.09
694	0.11
695	0.12
696	0.14
697	0.14
698	0.19
699	0.22
700	0.22
701	0.21
702	0.2
703	0.2
704	0.19
705	0.19
706	0.15
707	0.13
708	0.15
709	0.16
710	0.16
711	0.14
712	0.13
713	0.11
714	0.11
715	0.11
716	0.08
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.07
722	0.09
723	0.09
724	0.13
725	0.13
726	0.14
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.14
731	0.16
732	0.14
733	0.15
734	0.14
735	0.15
736	0.15
737	0.13
738	0.12
739	0.1
740	0.09
741	0.07
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.1
752	0.12
753	0.15
754	0.15
755	0.13
756	0.15
757	0.17
758	0.19
759	0.18
760	0.16
761	0.14
762	0.17
763	0.22
764	0.26
765	0.33
766	0.32
767	0.34
768	0.36
769	0.37
770	0.35
771	0.32
772	0.29
773	0.2
774	0.19
775	0.16
776	0.15
777	0.14
778	0.13
779	0.11
780	0.1
781	0.09
782	0.09
783	0.1
784	0.08
785	0.12
786	0.15
787	0.17
788	0.17
789	0.19
790	0.21
791	0.23
792	0.24
793	0.22
794	0.26
795	0.28
796	0.32
797	0.37
798	0.41
799	0.48
800	0.57
801	0.62
802	0.66
803	0.72
804	0.77
805	0.81
806	0.86
807	0.88
808	0.85
809	0.84
810	0.79
811	0.74
812	0.67
813	0.59
814	0.51
815	0.4
816	0.32
817	0.26
818	0.19
819	0.15
820	0.1
821	0.09
822	0.05
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.08
827	0.09
828	0.1
829	0.09
830	0.1
831	0.1
832	0.12
833	0.12
834	0.11
835	0.1
836	0.1
837	0.1
838	0.09
839	0.09
840	0.07
841	0.06
842	0.07
843	0.08
844	0.07
845	0.07
846	0.08
847	0.08
848	0.09
849	0.11
850	0.11
851	0.11
852	0.13
853	0.13
854	0.14
855	0.13
856	0.12
857	0.13
858	0.17
859	0.18
860	0.19
861	0.21
862	0.22
863	0.26
864	0.27
865	0.27
866	0.24
867	0.25
868	0.23
869	0.21
870	0.23
871	0.2
872	0.21
873	0.23
874	0.22
875	0.21
876	0.22
877	0.22
878	0.23
879	0.25
880	0.32
881	0.35
882	0.35
883	0.43
884	0.45
885	0.46
886	0.46
887	0.47
888	0.38
889	0.33
890	0.31
891	0.24
892	0.24
893	0.25
894	0.21
895	0.18
896	0.18
897	0.2

V5EMD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer